| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 叶绿体的结构与功能介绍 | 第9-11页 |
| 1.1.1 叶绿体膜 | 第9-10页 |
| 1.1.2 基质 | 第10页 |
| 1.1.3 类囊体膜 | 第10页 |
| 1.1.4 类囊体腔 | 第10-11页 |
| 1.2 研究背景及意义 | 第11-12页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3.1 蛋白质亚叶绿体定位预测研究现状 | 第12-14页 |
| 1.4 本文的研究内容及安排 | 第14-15页 |
| 第二章 特征参数提取与理论预测算法 | 第15-28页 |
| 2.1 引言 | 第15页 |
| 2.2 特征提取 | 第15-24页 |
| 2.2.1 蛋白质序列信息 | 第15-19页 |
| 2.2.1.1 氨基酸分段组分信息（Amino acid fragments composition, AAC) | 第15-16页 |
| 2.2.1.2 氨基酸间隔二肽耦合信息（distant amino acid 2-dipeptide coupling information,DC) | 第16-17页 |
| 2.2.1.3 氨基酸指数信息（Amino Acid Index, AAI) | 第17-19页 |
| 2.2.2 蛋白质结构信息 | 第19-21页 |
| 2.2.2.1 预测的蛋白质二级结构信息（The predicted secondary structure, SS) | 第19-20页 |
| 2.2.2.2 蛋白质骨架（Protein Blocks，PB） | 第20-21页 |
| 2.2.3 基于生物过程与分子功能的Gene Ontology注释信息 | 第21-22页 |
| 2.2.4 基于PSSM矩阵的蛋白质进化信息与保守信息 | 第22-24页 |
| 2.2.4.1 蛋白质的进化信息与保守信息(P~+P~-) | 第23页 |
| 2.2.4.2 蛋白质保守位点的进化信息 | 第23-24页 |
| 2.3 预测算法 | 第24-27页 |
| 2.3.1 mRMR特征筛选算法 | 第24-25页 |
| 2.3.2 支持向量机(SVM)算法 | 第25-26页 |
| 2.3.3 算法评价 | 第26-27页 |
| 2.4 小结 | 第27-28页 |
| 第三章 蛋白质亚叶绿体定位预测研究 | 第28-42页 |
| 3.1 引言 | 第28页 |
| 3.2 数据集 | 第28-30页 |
| 3.3 最优参数的选取 | 第30-37页 |
| 3.3.1 氨基酸单肽分段组分 | 第30-31页 |
| 3.3.2 氨基酸间隔二肽耦合信息 | 第31-33页 |
| 3.3.3 氨基酸指数 | 第33-34页 |
| 3.3.4 预测的蛋白质二级结构信息 | 第34-35页 |
| 3.3.5 蛋白质骨架信息 | 第35页 |
| 3.3.6 Gene Ontology | 第35-36页 |
| 3.3.7 基于PSSM矩阵的蛋白质的进化信息 | 第36-37页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第37-41页 |
| 3.4.1 氨基酸序列信息与蛋白质结构信息对预测结果影响的比较 | 第37页 |
| 3.4.2 不同特征参数及融合特征对预测结果的影响 | 第37-39页 |
| 3.4.3 交叉检验与独立检验结果 | 第39-40页 |
| 3.4.4 与前人预测结果的比较 | 第40-41页 |
| 3.5 小结 | 第41-42页 |
| 第四章 总结与展望 | 第42-44页 |
| 4.1 论文工作总结 | 第42页 |
| 4.2 工作展望 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附录 S1:本文建立的蛋白质亚叶绿体PS60数据集 | 第49-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第53页 |
