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CLDN11基因甲基化与结直肠癌转移的相关性研究

摘要第3-6页
abstract第6-8页
引言第12-15页
1. 研究内容第15-17页
    1.1. 结直肠癌和对应的癌旁组织中差异甲基化基因分析第15页
    1.2. 检测组织中CLDN11甲基化水平第15页
    1.3. 研究CLDN11甲基化与其m RNA表达相关性第15页
    1.4. 检测CLDN11启动子片段调节基因表达功能第15页
    1.5. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化及m RNA表达第15页
    1.6. 研究CLDN11甲基化改变对结直肠癌细胞迁移能力影响第15-16页
    1.7. 应用公共数据库验证CLDN11甲基化与结直肠癌转移相关性第16-17页
2. 材料和方法第17-31页
    2.1. 材料第17-19页
        2.1.1. 主要仪器第17页
        2.1.2. 主要试剂第17-18页
        2.1.3. 实验样本第18-19页
        2.1.4. 细胞株第19页
        2.1.5. 伦理批准及受试者知情第19页
    2.2.方法第19-31页
        2.2.1. 样本的采集和保存第19页
        2.2.2. DNA提取第19-20页
        2.2.3. RNA提取第20-22页
        2.2.4. 亚硫酸氢盐转化DNA第22页
        2.2.5. 甲基化检测第22-24页
        2.2.6. qRT-PCR检测第24-26页
        2.2.7. 细胞培养第26-27页
        2.2.8. 双荧光素酶实验第27-29页
        2.2.9.5-aza-dC处理结直肠癌细胞第29-30页
        2.2.10. Transwell实验第30页
        2.2.11. 统计分析第30-31页
3. 实验结果第31-44页
    3.1. 结直肠癌组织中差异甲基化位点分析第31页
    3.2. 检测组织中CLDN11甲基化水平第31-35页
        3.2.1. 比较结直肠癌和癌旁组织中CLDN11甲基化水平差异第31-33页
        3.2.2. 分析癌组织中CLDN11甲基化水平与临床信息相关性第33-35页
        3.2.3.应用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve)检测CLDN11甲基化筛查诊断结直肠癌诊断效力第35页
    3.3. 研究CLDN11甲基化与其表达相关性第35-37页
        3.3.1. 比较结直肠癌组织与癌旁组织中CLDN11 m RNA表达差异第35-36页
        3.3.2. 分析CLDN11甲基化与其m RNA表达相关性第36-37页
    3.4. 检测CLDN11启动子片段启动基因表达功能第37-38页
    3.5. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化和m RNA表达水平第38-39页
        3.5.1. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化水平第38-39页
        3.5.2. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11 m RNA水平第39页
    3.6. 改变CLDN11甲基化水平,观察结直肠癌细胞迁移能力变化第39-41页
        3.6.1. 配置不同的 5-aza-dC药物浓度,应用应用qMSP和qRT-PCR实验检测CLDN11甲基化和mRNA表达水平,确定有效药物浓度;第40页
        3.6.2. 应用Transwell实验分析逆转CLDN11甲基化水平前后,结直肠癌细胞迁移能力改变;第40-41页
    3.7. 应用公共数据库分析CLDN11甲基化与结直肠癌转移相关性第41-44页
        3.7.1. 应用TCGA中CLDN11甲基化数据和mRNA表达数据,验证CLDN11甲基化与表达相关性第42页
        3.7.2. 应用TCGA中CLDN11甲基化数据和生存数据,分析CLDN11甲基化与结直癌RFS的关系第42-44页
4. 结论第44-45页
5. 讨论第45-48页
参考文献第48-51页
附录A TCGA 数据库中 CLDN11 甲基化和表达数据第51-57页
附录B 缩写表第57-58页
附录C 综述第58-75页
    参考文献第71-75页
在学研究成果第75-77页
致谢第77-78页

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