摘要 | 第3-6页 |
abstract | 第6-8页 |
引言 | 第12-15页 |
1. 研究内容 | 第15-17页 |
1.1. 结直肠癌和对应的癌旁组织中差异甲基化基因分析 | 第15页 |
1.2. 检测组织中CLDN11甲基化水平 | 第15页 |
1.3. 研究CLDN11甲基化与其m RNA表达相关性 | 第15页 |
1.4. 检测CLDN11启动子片段调节基因表达功能 | 第15页 |
1.5. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化及m RNA表达 | 第15页 |
1.6. 研究CLDN11甲基化改变对结直肠癌细胞迁移能力影响 | 第15-16页 |
1.7. 应用公共数据库验证CLDN11甲基化与结直肠癌转移相关性 | 第16-17页 |
2. 材料和方法 | 第17-31页 |
2.1. 材料 | 第17-19页 |
2.1.1. 主要仪器 | 第17页 |
2.1.2. 主要试剂 | 第17-18页 |
2.1.3. 实验样本 | 第18-19页 |
2.1.4. 细胞株 | 第19页 |
2.1.5. 伦理批准及受试者知情 | 第19页 |
2.2.方法 | 第19-31页 |
2.2.1. 样本的采集和保存 | 第19页 |
2.2.2. DNA提取 | 第19-20页 |
2.2.3. RNA提取 | 第20-22页 |
2.2.4. 亚硫酸氢盐转化DNA | 第22页 |
2.2.5. 甲基化检测 | 第22-24页 |
2.2.6. qRT-PCR检测 | 第24-26页 |
2.2.7. 细胞培养 | 第26-27页 |
2.2.8. 双荧光素酶实验 | 第27-29页 |
2.2.9.5-aza-dC处理结直肠癌细胞 | 第29-30页 |
2.2.10. Transwell实验 | 第30页 |
2.2.11. 统计分析 | 第30-31页 |
3. 实验结果 | 第31-44页 |
3.1. 结直肠癌组织中差异甲基化位点分析 | 第31页 |
3.2. 检测组织中CLDN11甲基化水平 | 第31-35页 |
3.2.1. 比较结直肠癌和癌旁组织中CLDN11甲基化水平差异 | 第31-33页 |
3.2.2. 分析癌组织中CLDN11甲基化水平与临床信息相关性 | 第33-35页 |
3.2.3.应用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve)检测CLDN11甲基化筛查诊断结直肠癌诊断效力 | 第35页 |
3.3. 研究CLDN11甲基化与其表达相关性 | 第35-37页 |
3.3.1. 比较结直肠癌组织与癌旁组织中CLDN11 m RNA表达差异 | 第35-36页 |
3.3.2. 分析CLDN11甲基化与其m RNA表达相关性 | 第36-37页 |
3.4. 检测CLDN11启动子片段启动基因表达功能 | 第37-38页 |
3.5. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化和m RNA表达水平 | 第38-39页 |
3.5.1. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11甲基化水平 | 第38-39页 |
3.5.2. 检测结直肠癌细胞株中CLDN11 m RNA水平 | 第39页 |
3.6. 改变CLDN11甲基化水平,观察结直肠癌细胞迁移能力变化 | 第39-41页 |
3.6.1. 配置不同的 5-aza-dC药物浓度,应用应用qMSP和qRT-PCR实验检测CLDN11甲基化和mRNA表达水平,确定有效药物浓度; | 第40页 |
3.6.2. 应用Transwell实验分析逆转CLDN11甲基化水平前后,结直肠癌细胞迁移能力改变; | 第40-41页 |
3.7. 应用公共数据库分析CLDN11甲基化与结直肠癌转移相关性 | 第41-44页 |
3.7.1. 应用TCGA中CLDN11甲基化数据和mRNA表达数据,验证CLDN11甲基化与表达相关性 | 第42页 |
3.7.2. 应用TCGA中CLDN11甲基化数据和生存数据,分析CLDN11甲基化与结直癌RFS的关系 | 第42-44页 |
4. 结论 | 第44-45页 |
5. 讨论 | 第45-48页 |
参考文献 | 第48-51页 |
附录A TCGA 数据库中 CLDN11 甲基化和表达数据 | 第51-57页 |
附录B 缩写表 | 第57-58页 |
附录C 综述 | 第58-75页 |
参考文献 | 第71-75页 |
在学研究成果 | 第75-77页 |
致谢 | 第77-78页 |