| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩写、术语表 | 第8-12页 |
| 1. 引言 | 第12-15页 |
| 1.1. 实验背景与实验目的 | 第12-14页 |
| 1.2. 实验设计 | 第14-15页 |
| 1.2.1. 构建曲妥珠单抗耐药细胞模型 | 第14页 |
| 1.2.2. 表达谱分析 | 第14页 |
| 1.2.3. 共表达分析 | 第14-15页 |
| 2. 实验材料与方法 | 第15-29页 |
| 2.1. 构建曲妥珠单抗耐药细胞模型 | 第15-19页 |
| 2.1.1. 曲妥珠单抗耐药细胞模型构建 | 第15-16页 |
| 2.1.2. 曲妥珠单抗耐药细胞模型的评估 | 第16-19页 |
| 2.1.2.1. 光学显微镜观察 | 第16页 |
| 2.1.2.2. 细胞增殖活性测定 | 第16-17页 |
| 2.1.2.3. 细胞凋亡率测定 | 第17-18页 |
| 2.1.2.4. 细胞周期测定 | 第18-19页 |
| 2.2. 表达谱分析 | 第19-24页 |
| 2.2.1. 全转录组基因测序 | 第19-20页 |
| 2.2.2. 表达谱数据与已知基因组的比对 | 第20-21页 |
| 2.2.3. 基因注释和差异表达分析 | 第21-24页 |
| 2.2.3.1. 获取经过注释的差异表达数据 | 第21页 |
| 2.2.3.2. 测序和差异表达分析准确性验证 | 第21-23页 |
| 2.2.3.3. 代表性功能基因分析 | 第23-24页 |
| 2.3. 共表达分析 | 第24-29页 |
| 2.3.1. TCGA数据库的共表达分析 | 第24-25页 |
| 2.3.1.1. 下载和整理TCGA数据 | 第24页 |
| 2.3.1.2. 选取数据集进行共表达聚类 | 第24-25页 |
| 2.3.2. 共表达分析结合耐药细胞表达谱分析 | 第25页 |
| 2.3.3. 探索个别基因作为生物标志物和治疗靶点的可能性 | 第25-29页 |
| 2.3.3.1. 差异表达验证 | 第25-26页 |
| 2.3.3.2. siRNA干扰表达下细胞增殖活性测定 | 第26页 |
| 2.3.3.3. siRNA干扰表达下细胞周期改变测定 | 第26-27页 |
| 2.3.3.4. 通过细胞周期相关标记分子测定siRNA干扰表达下曲妥珠单抗抑制率改变 | 第27-28页 |
| 2.3.3.5. TCGA生存分析 | 第28-29页 |
| 3. 实验结果与讨论 | 第29-46页 |
| 3.1. 构建曲妥珠单抗耐药细胞模型 | 第29-33页 |
| 3.1.1. 曲妥珠单抗耐药细胞模型构建 | 第29页 |
| 3.1.2. 曲妥珠单抗耐药细胞模型的评估 | 第29-32页 |
| 3.1.2.1. 光学显微镜观察 | 第29-30页 |
| 3.1.2.2. 细胞增殖活性测定 | 第30-31页 |
| 3.1.2.3. 细胞凋亡率测定 | 第31-32页 |
| 3.1.2.4. 细胞周期测定 | 第32页 |
| 3.1.3. 讨论 | 第32-33页 |
| 3.2. 表达谱分析 | 第33-38页 |
| 3.2.1. 全转录组基因测序 | 第33页 |
| 3.2.2. 表达谱数据分析 | 第33-38页 |
| 3.2.2.1. 表达谱数据与已知基因组的比对 | 第33-34页 |
| 3.2.2.2. 基因注释和差异表达分析 | 第34-36页 |
| 3.2.2.3. 代表性功能基因分析 | 第36-38页 |
| 3.2.3. 讨论 | 第38页 |
| 3.3. 共表达分析 | 第38-46页 |
| 3.3.1. TCGA数据库的共表达分析 | 第38-39页 |
| 3.3.1.1. 下载和整理TCGA数据 | 第38-39页 |
| 3.3.1.2. 选取数据集进行共表达聚类 | 第39页 |
| 3.3.2. 共表达分析结合耐药细胞表达谱分析 | 第39-40页 |
| 3.3.3. 探索个别基因作为生物标志物和治疗靶点的可能性 | 第40-44页 |
| 3.3.3.1. 差异表达验证 | 第40-41页 |
| 3.3.3.2. siRNA干扰表达下细胞增殖活性测定 | 第41-42页 |
| 3.3.3.3. siRNA干扰表达下细胞周期改变测定 | 第42-43页 |
| 3.3.3.4. 通过细胞周期相关标记分子测定siRNA干扰表达下曲妥珠单抗抑制率改变 | 第43-44页 |
| 3.3.3.5. TCGA生存分析 | 第44页 |
| 3.3.4. 讨论 | 第44-46页 |
| 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 综述 | 第53-61页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 作者简介 | 第61页 |
