| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-14页 |
| 前言 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-27页 |
| 1 植物株型性状的研究进展 | 第15-21页 |
| 1.1 叶形株型的发育 | 第15-16页 |
| 1.2 芸薹属作物形态多样性研究 | 第16-18页 |
| 1.3 叶形发育相关研究进展 | 第18-20页 |
| 1.4 温度对表观修饰的影响 | 第20-21页 |
| 2 测序技术的发展应用 | 第21-27页 |
| 2.1 测序技术的发展 | 第21-22页 |
| 2.2 简化基因组测序的发展应用 | 第22-23页 |
| 2.3 转录组学的发展应用 | 第23-24页 |
| 2.4 甲基化测序的发展应用 | 第24-27页 |
| 第二章 不结球白菜束腰株型性状分析 | 第27-37页 |
| 引言 | 第28页 |
| 1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 1.1 材料 | 第28页 |
| 1.2 试验方法 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-35页 |
| 2.1 束腰性状初步形态研究 | 第30-32页 |
| 2.2 F_2分离群体中的束腰性状调查 | 第32-33页 |
| 2.3 F_2分离群体中其它外形特征调查 | 第33-35页 |
| 2.4 株型性状形成与温度的关系 | 第35页 |
| 3 讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 不结球白菜株型性状简化基因组测序(SLAF-seq)分析 | 第37-55页 |
| 引言 | 第38-39页 |
| 1 材料与方法 | 第39-45页 |
| 1.1 材料 | 第39页 |
| 1.2 试验方法 | 第39-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-52页 |
| 2.1 不结球白菜株型性状简化基因组测序样品制备 | 第45-46页 |
| 2.2 不结球白菜株型性状简化基因组测序 | 第46-47页 |
| 2.3 简化基因组测序多态性分析 | 第47-48页 |
| 2.4 群体差异关联性分析 | 第48-50页 |
| 2.5 差异基因分析 | 第50-52页 |
| 3 讨论 | 第52-55页 |
| 第四章 不结球白菜株型性状转录组与MeDIP-seq甲基化联合分析 | 第55-77页 |
| 引言 | 第56-58页 |
| 1 材料与方法 | 第58-62页 |
| 1.1 材料 | 第58页 |
| 1.2 试验方法 | 第58-62页 |
| 2 结果与分析 | 第62-74页 |
| 2.1 不结球白菜转录组及MeDIP测序 | 第62-66页 |
| 2.2 不结球白菜转录组与MeDIP-seq差异基因分析 | 第66-69页 |
| 2.3 不结球白菜甲基化与表达呈负相关的基因的GO功能分析 | 第69-72页 |
| 2.4 不结球白菜甲基化与表达呈负相关的基因的pathway分析 | 第72-73页 |
| 2.5 候选差异基因的表达验证 | 第73-74页 |
| 3 讨论 | 第74-77页 |
| 第五章 生长素响应基因Aux/IAA和ARF基因家族的全基因组鉴定进化分析 | 第77-99页 |
| 引言 | 第78-79页 |
| 1 材料与方法 | 第79-84页 |
| 1.1 材料 | 第79页 |
| 1.2 方法 | 第79-84页 |
| 2 结果与分析 | 第84-95页 |
| 2.1 Aux/IAA和ARF同源基因在白菜中的鉴定和保留 | 第84-86页 |
| 2.2 白菜与拟南芥中IAA和ARF共线基因碱基同义突变频率(Ks)的分析 | 第86-87页 |
| 2.3 白菜中Aux/IAA和ARF基因的扩展和结构特征分析 | 第87-89页 |
| 2.4 Aux/IAA和ARF基因在植物中的进化历史 | 第89-91页 |
| 2.5 两组基因进化中选择压力的分化 | 第91-92页 |
| 2.6 白菜与拟南芥中Aux/IAA和ARF基因在不同组织中的表达分化 | 第92-93页 |
| 2.7 白菜中Aux/IAA基因在多种处理下的表达分化和共表达网络 | 第93-95页 |
| 3 讨论 | 第95-99页 |
| 第六章 不结球白菜ABA信号途径关键元素SnRK2基因家族的克隆和分子进化分析 | 第99-121页 |
| 引言 | 第100-102页 |
| 1 材料与方法 | 第102-108页 |
| 1.1 材料 | 第102页 |
| 1.2 方法 | 第102-108页 |
| 2 结果与分析 | 第108-117页 |
| 2.1 SnRK2基因的进化历程 | 第108-110页 |
| 2.2 薹属作物SnRK2基因三倍化后的保留 | 第110页 |
| 2.3 不结球白菜SnRK2基因家族的获取和鉴定 | 第110-112页 |
| 2.4 不结球白菜SnRK2蛋白特性及保守性分析 | 第112-114页 |
| 2.5 不结球白菜SnRK2.6a亚细胞定位 | 第114-115页 |
| 2.6 不结球白菜SnRK2基因在低温及ABA处理下的表达 | 第115-117页 |
| 3 讨论 | 第117-121页 |
| 全文结论 | 第121-123页 |
| 创新点 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-139页 |
| 附表 | 第139-157页 |
| 附表1 大白菜ARF和Aux/IAA基因注释信息 | 第139-143页 |
| 附表2 番木瓜、毛果杨、葡萄、无油樟、江南卷柏及小立碗藓中的ARF和Aux/IAA基因注释信息 | 第143-152页 |
| 附表3 大白菜ARF和Aux/IAA基因组织表达谱数据 | 第152-157页 |
| 论文发表情况 | 第157-159页 |
| 致谢 | 第159页 |
