| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第17-30页 |
| 1.1 引言 | 第17-27页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第17-18页 |
| 1.1.2 竹类植物高生长形态解剖学研究 | 第18-19页 |
| 1.1.3 生长素相关基因研究 | 第19-23页 |
| 1.1.4 可变剪接研究进展 | 第23-25页 |
| 1.1.5 毛竹快速生长相关研究 | 第25-26页 |
| 1.1.6 竹类植物基因组学研究 | 第26-27页 |
| 1.2 研究目的意义 | 第27-28页 |
| 1.3 研究目标和主要研究内容 | 第28-29页 |
| 1.3.1 项目来源与经费支持 | 第28页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第28-29页 |
| 1.4 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 毛竹笋期生物学特性研究 | 第30-40页 |
| 2.1 样地概况 | 第31页 |
| 2.2 试验方法 | 第31-34页 |
| 2.2.1 竹笋高度及节间形态学指标测量 | 第31-32页 |
| 2.2.2 石蜡切片制作 | 第32-33页 |
| 2.2.3 扫描电镜及能谱观察 | 第33-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-39页 |
| 2.5 小结 | 第39-40页 |
| 第三章 毛竹快速生长不同时期转录组测序 | 第40-67页 |
| 3.1 材料和方法 | 第40-44页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第40-41页 |
| 3.1.2 毛竹RNA提取 | 第41页 |
| 3.1.3 文库构建和高通量测序 | 第41-42页 |
| 3.1.4 转录组测序后数据分析 | 第42-43页 |
| 3.1.5 测序结果拼装并比对至参考基因组 | 第43页 |
| 3.1.6 q RT-PCR验证 | 第43-44页 |
| 3.2 结果 | 第44-62页 |
| 3.2.1 转录组拼装结果 | 第44-47页 |
| 3.2.2 差异表达基因数量统计 | 第47-48页 |
| 3.2.3 实时定量PCR（q RT-PCR）验证差异表达基因 | 第48-50页 |
| 3.2.4 差异表达基因GO功能注释和Pathway注释 | 第50-52页 |
| 3.2.5 毛竹笋快速生长相关的基因家族 | 第52-57页 |
| 3.2.6 氮代谢通路 | 第57页 |
| 3.2.7 色氨酸代谢通路 | 第57-58页 |
| 3.2.8 淀粉和蔗糖代谢通路 | 第58-59页 |
| 3.2.9 植物激素信号转导通路 | 第59-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-65页 |
| 3.4 小结 | 第65-67页 |
| 第四章 毛竹快速生长过程中可变剪接研究 | 第67-87页 |
| 4.1 材料和方法 | 第67-69页 |
| 4.1.1 植物材料以及RNA提取 | 第67页 |
| 4.1.2 文库构建，高通量测序和测序结果拼装 | 第67页 |
| 4.1.3 AS事件识别和蛋白序列预测 | 第67-68页 |
| 4.1.4 同源异构体的表达量及保守结构域研究 | 第68页 |
| 4.1.5 可变剪接事件半定量验证 | 第68-69页 |
| 4.2 结果 | 第69-82页 |
| 4.2.1 毛竹笋生长过程中的可变剪接事件 | 第69-73页 |
| 4.2.2 AS频率和基因特征间的关系 | 第73-74页 |
| 4.2.3 笋生长过程中SR同源异构体的Pre-m RNA剪接 | 第74-75页 |
| 4.2.4 同源异构体的表达量分析及保守结构域分析 | 第75-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-85页 |
| 4.3.1 毛竹笋快速生长过程中AS的特征 | 第82-83页 |
| 4.3.2 毛竹中的SR蛋白 | 第83页 |
| 4.3.3 AS频率与不同生长时期呈一定关联性 | 第83-84页 |
| 4.3.4 可变剪接在笋生长过程中的功能影响 | 第84-85页 |
| 4.4 小结 | 第85-87页 |
| 第五章 AUX/LAX和AUX/IAA功能研究 | 第87-109页 |
| 5.1 实验材料 | 第87-88页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第87页 |
| 5.1.2 载体及菌株 | 第87-88页 |
| 5.1.3 拟南芥原生质体分离所用试剂的制备方法 | 第88页 |
| 5.1.4 培养基的配制 | 第88页 |
| 5.2 试验方法 | 第88-97页 |
| 5.2.1 毛竹RNA提取 | 第88-89页 |
| 5.2.2 反转录第一链合成 | 第89页 |
| 5.2.3 基因扩增 | 第89-90页 |
| 5.2.4 连接 | 第90-91页 |
| 5.2.5 转化大肠杆菌 | 第91页 |
| 5.2.6 PCR检测阳性菌落 | 第91页 |
| 5.2.7 质粒提取（小提法） | 第91-92页 |
| 5.2.8 表达载体构建及农杆菌转化 | 第92-93页 |
| 5.2.9 农杆菌侵染拟南芥 | 第93页 |
| 5.2.10 转基因株系筛选 | 第93-94页 |
| 5.2.11 毛竹幼苗激素处理 | 第94页 |
| 5.2.12 实时定量PCR | 第94页 |
| 5.2.13 亚细胞定位载体构建 | 第94-95页 |
| 5.2.14 质粒提取 | 第95-96页 |
| 5.2.15 原生质体的分离制备 | 第96-97页 |
| 5.2.16 家族生信分析 | 第97页 |
| 5.3 结果与分析 | 第97-106页 |
| 5.3.1 系统进化分析 | 第97-101页 |
| 5.3.2 AUX/LAX和AUX/IAA在毛竹笋不同生长发育时期的表达 | 第101-104页 |
| 5.3.3 激素处理下的Phe IAA和Phe LAX的表达量 | 第104页 |
| 5.3.5 亚细胞定位 | 第104-105页 |
| 5.3.6 Phe LAX1转基因验证 | 第105-106页 |
| 5.4 讨论 | 第106-108页 |
| 5.5 小结 | 第108-109页 |
| 第六章 讨论与结论 | 第109-116页 |
| 6.1 讨论 | 第109-113页 |
| 6.2 结论 | 第113-114页 |
| 6.3 展望 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-132页 |
| 附录 | 第132-133页 |
| 在读期间的学术研究 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135页 |
