| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-26页 |
| 1.1 辣椒病毒病毒原种类 | 第11-16页 |
| 1.1.1 烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV) | 第12页 |
| 1.1.2 黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV) | 第12页 |
| 1.1.3 马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY) | 第12-13页 |
| 1.1.4 蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus,BBWV2) | 第13页 |
| 1.1.5 辣椒叶脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV) | 第13-14页 |
| 1.1.6 辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV) | 第14-15页 |
| 1.1.7 辣椒叶脉黄化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV) | 第15页 |
| 1.1.8 辣椒环斑病毒(Chilli ringspot virus,ChiRSV) | 第15-16页 |
| 1.1.9 烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV) | 第16页 |
| 1.2 siRNA深度测序技术 | 第16-17页 |
| 1.3 全基因组克隆 | 第17-19页 |
| 1.3.1 病毒基因组克隆策略 | 第17-18页 |
| 1.3.2 病毒基因组3’端克隆 | 第18页 |
| 1.3.3 病毒基因组5’端克隆 | 第18-19页 |
| 1.4 辣椒病毒病检测技术研究进展 | 第19-25页 |
| 1.4.1 常规植物病毒检测方法 | 第19-21页 |
| 1.4.2 血清学检测法 | 第21-22页 |
| 1.4.3 分子生物学方法 | 第22-25页 |
| 1.5 本项目研究的目的与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 湖南辣椒毒原种类鉴定 | 第26-33页 |
| 2.1 材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 样本采集 | 第26-27页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第27页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第27页 |
| 2.1.4 检测引物 | 第27-28页 |
| 2.2 方法 | 第28-29页 |
| 2.2.1 总RNA的提取及cDNA的合成 | 第28-29页 |
| 2.2.2 病毒种类的RT-PCR验证 | 第29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-32页 |
| 2.3.1 PCR验证siRNA测序存在的病毒 | 第29-30页 |
| 2.3.2 2013年辣椒病毒病原检测结果 | 第30-32页 |
| 2.4 讨论 | 第32-33页 |
| 第三章 ChiVMV和PMMoV湖南分离物的序列分析 | 第33-46页 |
| 3.1 材料 | 第33-34页 |
| 3.2 方法 | 第34-38页 |
| 3.3 结果与分析 | 第38-44页 |
| 3.3.1 辣椒叶脉斑驳病毒(ChiVMV)湖南分离物的结果与分析 | 第38-41页 |
| 3.3.2 辣椒轻斑驳病毒(PMMoV)湖南分离物的结果分析 | 第41-44页 |
| 3.4 讨论 | 第44-46页 |
| 第四章 四种病毒的多重PCR | 第46-57页 |
| 4.1 材料 | 第46页 |
| 4.1.1 主要试剂 | 第46页 |
| 4.1.2 主要仪器 | 第46页 |
| 4.1.3 病毒和植物材料 | 第46页 |
| 4.2 四种侵染辣椒病毒毒原的多重RT-PCR检测 | 第46-48页 |
| 4.2.1 核酸提取与反转录 | 第46页 |
| 4.2.2 引物设计与测序 | 第46-47页 |
| 4.2.3 多重RT-PCR反应体系的优化 | 第47-48页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第48-55页 |
| 4.3.1 病毒引物和RT-PCR扩增产物的测序结果 | 第48-51页 |
| 4.3.2 单重P-PCR退火温度结果和优化后多重RT-PCR的反应体系 | 第51-54页 |
| 4.3.3 多重RT-PCR灵敏度实验结果 | 第54页 |
| 4.3.4 多重RT-PCR的适用性试验结果 | 第54-55页 |
| 4.4 讨论 | 第55-57页 |
| 第五章 总结与讨论 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-68页 |
| 附录 本实验所用重要缩写及中文对照 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简介 | 第70页 |
