| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-28页 |
| 1.1 简单重复序列概述 | 第10-19页 |
| 1.1.1 简单重复序列提取 | 第11-12页 |
| 1.1.2 重复序列的分类 | 第12-14页 |
| 1.1.3 重复序列分布和功能 | 第14-15页 |
| 1.1.4 与重复序列有关的人类疾病 | 第15-16页 |
| 1.1.5 简单重复序列实际应用 | 第16-17页 |
| 1.1.6 简单重复序列的突变机制 | 第17-19页 |
| 1.2 有关人类免疫缺陷病毒（ HIV）的介绍 | 第19-22页 |
| 1.2.1 HIV分型 | 第19页 |
| 1.2.2 HIV流行分布 | 第19-20页 |
| 1.2.3 HIV对人体的危害 | 第20-21页 |
| 1.2.4 HIV的编码基因组及结构域 | 第21-22页 |
| 1.3 生物信息数据库介绍 | 第22-26页 |
| 1.3.1 不同研究方向的代表性数据库 | 第22-24页 |
| 1.3.2 GenBank数据库 | 第24-25页 |
| 1.3.3 EMBL（欧洲分子生物学实验室） | 第25页 |
| 1.3.4 DDBJ（日本国家遗传学研究所， NIG） | 第25-26页 |
| 1.4 本研究工作内容和意义 | 第26-28页 |
| 第2章 材料和方法 | 第28-37页 |
| 2.1 前言 | 第28页 |
| 2.2 材料与方法 | 第28-37页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第28-31页 |
| 2.2.2 序列处理 | 第31页 |
| 2.2.3 相关软件选取 | 第31-36页 |
| 2.2.4 对分析结果处理 | 第36-37页 |
| 第3章 结果分析与讨论 | 第37-54页 |
| 3.1 前言 | 第37页 |
| 3.2 微卫星在HIV-1 基因组中区域分布特征 | 第37-42页 |
| 3.3 HIV-1 基因组中单核、双核、三核苷酸微卫星区域特征分布 | 第42-51页 |
| 3.4 HIV-1 的亚型与微卫星区域特征分布之间的联系 | 第51-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-71页 |
| 附录一 攻读硕士期间发表的学术论文目录 | 第71-72页 |
| 附录二 VGML部分程序源代码 | 第72-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
