| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| ·生物信息学发展背景及研究意义 | 第8-9页 |
| ·国内外研究概况 | 第9-12页 |
| ·分形理论简介及其在生物学中的应用 | 第9-10页 |
| ·基于CGR的DNA序列的研究概况 | 第10-11页 |
| ·基于CGR的蛋白质序列的研究概况 | 第11-12页 |
| ·本论文的主要工作 | 第12-14页 |
| 第二章 基于CGR的细菌必需基因和非必需基因DNA序列Hurst指数对比分析 | 第14-30页 |
| ·课题的数据来源 | 第14-15页 |
| ·DNA序列混沌游戏表示的基本原理 | 第15-17页 |
| ·混沌游戏简介 | 第15页 |
| ·DNA序列混沌游戏表示图形化 | 第15-16页 |
| ·基于CGR的基因时间序列模型 | 第16-17页 |
| ·细菌必需基因和非必需基因DNA序列Hurst指数特征分析 | 第17-22页 |
| ·Hurst指数计算原理 | 第17-19页 |
| ·DNA序列Hurst指数分布规律分析 | 第19-20页 |
| ·DNA序列长度与Hurst指数的关系 | 第20-22页 |
| ·细菌必需基因和非必需基因DNA序列Hurst指数差异显著性分析 | 第22-27页 |
| ·基于非参数检验法的DNA序列Hurst指数差异显著性分析 | 第22-24页 |
| ·两类基因DNA序列划分长度区间Hurst指数差异性对比 | 第24-26页 |
| ·两类基因DNA序列整体Hurst指数均值对比分析 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-30页 |
| 第三章 基于CGR的细菌必需基因和非必需基因蛋白质序列信息维数对比分析 | 第30-40页 |
| ·蛋白质序列混沌游戏表示的基本原理 | 第30-32页 |
| ·细菌必需基因和非必需基因蛋白质序列信息维数特征分析 | 第32-34页 |
| ·信息维数计算原理 | 第32-33页 |
| ·蛋白质序列长度与信息维数的关系 | 第33-34页 |
| ·细菌必需基因和非必需基因蛋白质序列信息维数差异显著性分析 | 第34-39页 |
| ·基于非参数检验法的蛋白质序列信息维数差异显著性分析 | 第34-35页 |
| ·两类基因蛋白质序列划分长度区间信息维数差异性对比 | 第35-38页 |
| ·两类基因蛋白质序列整体信息维数均值对比分析 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 基于CGR的物种进化关系分析 | 第40-46页 |
| ·数据来源 | 第40-41页 |
| ·DNA序列的相似性计算方法 | 第41-43页 |
| ·绝对差法计算遗传距离矩阵原理 | 第41-42页 |
| ·Pearson距离法计算遗传距离矩阵原理 | 第42-43页 |
| ·基于CGR的物种进化关系分析 | 第43-45页 |
| ·遗传距离矩阵计算结果 | 第43-44页 |
| ·绝对差法和Pearson距离法绘制进化树结果分析 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第五章 总结与展望 | 第46-48页 |
| ·论文工作总结 | 第46-47页 |
| ·展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-52页 |
| 攻读学位期间所取得的相关科研成果 | 第52-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
