摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第一章 引言 | 第9-15页 |
·生物信息学与生命科学 | 第9-11页 |
·生物信息学概述 | 第9-10页 |
·生物信息学在生命科学中的应用 | 第10-11页 |
·LEA基因研究现状 | 第11-13页 |
·本文的研究内容及创新之处 | 第13-15页 |
第二章 基于BioPerl从NCBI下载LEA基因数据 | 第15-24页 |
·引言 | 第15-16页 |
·BioPerl简介 | 第15页 |
·NCBI数据库简介 | 第15-16页 |
·关键词法远程下载LEA基因数据 | 第16-19页 |
·程序运行环境 | 第16页 |
·关键词筛选 | 第16-17页 |
·程序方法设计 | 第17-18页 |
·结果与讨论 | 第18-19页 |
·精确下载LEA基因数据 | 第19-23页 |
·匹配条件的选择 | 第19页 |
·保守结构域与程序的联系 | 第19-20页 |
·程序方法设计 | 第20-23页 |
·实验结果 | 第23页 |
·讨论 | 第23-24页 |
第三章 基于K-mer频次原理的LEA基因分类 | 第24-32页 |
·引言 | 第24-25页 |
·LEA蛋白分类 | 第24页 |
·基因树冲突与系统发育基因组学 | 第24-25页 |
·K-mer频次原理 | 第25页 |
·利用K-mer频次原理进行LEA基因分类 | 第25-30页 |
·数据及方法 | 第26-27页 |
·实验结果 | 第27-30页 |
·讨论 | 第30-32页 |
第四章 分析LEA基因密码子偏性 | 第32-39页 |
·引言 | 第32-33页 |
·密码子偏性研究进展及意义 | 第32-33页 |
·生物信息学软件简介 | 第33页 |
·利用生物信息学软件分析LEA基因密码子偏性 | 第33-38页 |
·构建数据集 | 第34页 |
·分析LEA基因密码子偏性 | 第34-38页 |
·讨论 | 第38-39页 |
第五章 分析LEA3 蛋白抗旱性与其保守结构域序列重复次数相关性 | 第39-44页 |
·引言 | 第39页 |
·分析LEA3 族蛋白与其保守结构域序列重复次数的关系 | 第39-42页 |
·构建数据集 | 第40页 |
·利用生物信息学软件分析 | 第40-42页 |
·结果与讨论 | 第42-44页 |
第六章 结论与展望 | 第44-46页 |
·主要结论 | 第44-45页 |
·展望与不足 | 第45-46页 |
附录 | 第46-48页 |
参考文献 | 第48-52页 |
在读期间发表的论文 | 第52-53页 |
致谢 | 第53页 |