毛白杨响应溃疡病候选基因的挖掘
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-21页 |
| ·植物抗病相关基因研究进展 | 第11-16页 |
| ·信号传导相关基因 | 第13-14页 |
| ·MAPK信号通路 | 第13-14页 |
| ·NB-LRR受体 | 第14页 |
| ·防御相关基因 | 第14-15页 |
| ·辅因子 | 第15-16页 |
| ·转录因子 | 第16页 |
| ·植物抗病相关miRNA | 第16-18页 |
| ·miRNA与靶基因 | 第17页 |
| ·miR393与生长素受体 | 第17-18页 |
| ·miRNA靶基因预测软件 | 第18页 |
| ·杨树溃疡病 | 第18-20页 |
| ·转录组测序技术 | 第20-21页 |
| 2 立题依据与技术路线 | 第21-23页 |
| ·立体依据 | 第21-22页 |
| ·技术路线 | 第22-23页 |
| 3 毛白杨溃疡病条件下转录组分析 | 第23-40页 |
| ·材料与方法 | 第23-25页 |
| ·植物材料与接种 | 第23页 |
| ·RNA提取与测序 | 第23页 |
| ·De novo拼接和功能注释 | 第23-24页 |
| ·差异表达分析与功能富集 | 第24-25页 |
| ·实验验证 | 第25页 |
| ·结果 | 第25-30页 |
| ·毛白杨感染溃疡病病征 | 第25-26页 |
| ·测序和De novo拼接 | 第26-27页 |
| ·序列比对与功能注释 | 第27-28页 |
| ·差异表达基因的鉴定 | 第28-30页 |
| ·富集分析 | 第28-29页 |
| ·植物-病原互作通路 | 第29-30页 |
| ·RT-qPCR验证 | 第30页 |
| ·讨论 | 第30-40页 |
| ·De novo组装质量 | 第30-31页 |
| ·基因注释和富集分析 | 第31-33页 |
| ·信号传导相关基因 | 第33页 |
| ·防御相关基因 | 第33-38页 |
| ·辅因子和间接真菌响应 | 第38页 |
| ·高表达的差异转录本 | 第38-39页 |
| ·谷胱甘肽S-转移酶(GST)基因 | 第39-40页 |
| 4 miRNA靶基因预测和生物信息分析 | 第40-48页 |
| ·材料与方法 | 第40-41页 |
| ·靶基因预测流程 | 第40页 |
| ·靶基因功能注释 | 第40页 |
| ·靶基因的差异表达分析 | 第40-41页 |
| ·结果与分析 | 第41-46页 |
| ·psRNATarget预测靶基因的获得 | 第41页 |
| ·靶基因的功能注释和代谢通路分析 | 第41-43页 |
| ·靶基因的差异表达分析 | 第43-44页 |
| ·miR393靶基因功能预测 | 第44-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| 5 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-61页 |
| 本人简介 | 第61-63页 |
| 导师简介 | 第63-65页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第6页 |
