摘要 | 第1-7页 |
前言 | 第7-13页 |
1 尖孢镰刀菌及枯萎病防治简介 | 第7-8页 |
2 β-微管蛋白、丙酮酸脱羧酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶的研究进展 | 第8-11页 |
·β-微管蛋白 | 第8-9页 |
·丙酮酸脱羧酶 | 第9页 |
·甘油醛-3-磷酸脱氢酶 | 第9-11页 |
3 生物信息学分析应用 | 第11-13页 |
4 本课题的研究目的和意义 | 第13页 |
1 材料、试剂和仪器 | 第13-14页 |
·材料 | 第13页 |
·试剂 | 第13-14页 |
·仪器 | 第14页 |
2 方法 | 第14-18页 |
·尖孢镰刀菌及突变株的培养与DNA、RNA提取 | 第14页 |
·尖孢镰刀菌西瓜专化型基因组DNA、RNA提取 | 第14-16页 |
·菌体培养 | 第14页 |
·DNA提取方法—改良SDS—CTAB法 | 第14-15页 |
·RNA的提取—改良Trizol法 | 第15-16页 |
·β-微管蛋白基因的扩增与测序 | 第16-18页 |
·PCR反应体系 | 第16页 |
·PCR产物割胶回收 | 第16页 |
·PCR产物克隆测序 | 第16-18页 |
·丙酮酸脱羧酶基因扩增与测序 | 第18页 |
·PCR反应体系 | 第18页 |
·PCR产物割胶回收 | 第18页 |
·PCR产物克隆测序 | 第18页 |
·甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因扩增与测序 | 第18页 |
·PCR反应体系 | 第18页 |
·PCR产物割胶回收 | 第18页 |
·PCR产物克隆测序 | 第18页 |
·测序结果与生物信息学分析 | 第18页 |
·ORF预测与验证 | 第18页 |
·预测基因氨基酸序列 | 第18页 |
·蛋白质二级结构预测 | 第18页 |
·蛋白质三级结构预测 | 第18页 |
·蛋白质理化性质的预测 | 第18页 |
3 结果与分析 | 第18-41页 |
·高通量转录组测序结果与分析 | 第18-19页 |
·DNA提取 | 第19页 |
·β-微管蛋白基因的扩增、测序、对比及其蛋白质结构性质的研究 | 第19-26页 |
·基因的克隆 | 第19-20页 |
·测序的结果 | 第20-23页 |
·生物信息学分析 | 第23-26页 |
·丙酮酸脱羧酶基因的扩增、测序、对比及其蛋白质结构性质的研究 | 第26-34页 |
·基因克隆 | 第26-28页 |
·测序的结果 | 第28-31页 |
·生物信息学分析 | 第31-34页 |
·甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的扩增、测序、对比及其蛋白质结构性质的研究 | 第34-41页 |
·基因克隆 | 第34-35页 |
·测序的结果 | 第35-37页 |
·生物信息学分析 | 第37-41页 |
4 讨论 | 第41-42页 |
·β-微管蛋白 | 第41页 |
·丙酮酸脱羧酶 | 第41页 |
·甘油醛-3-磷酸脱氢酶 | 第41-42页 |
5 结论 | 第42-43页 |
参考文献 | 第43-48页 |
Abstract | 第48-50页 |
致谢 | 第50页 |