| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 图目录 | 第10-12页 |
| 表目录 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-38页 |
| ·海洋微生物的分类 | 第13-24页 |
| ·古细菌 | 第14-17页 |
| ·古细菌的分布及特点 | 第15-16页 |
| ·古细菌包括的门类 | 第16-17页 |
| ·细菌 | 第17-20页 |
| ·细菌的分布及特点 | 第17页 |
| ·细菌的门类 | 第17-20页 |
| ·真核微生物 | 第20-23页 |
| ·真核微生物——微藻 | 第21页 |
| ·真核微生物——原生动物 | 第21-22页 |
| ·真核微生物——真菌 | 第22-23页 |
| ·病毒及类病毒 | 第23-24页 |
| ·病毒及类病毒门类 | 第23-24页 |
| ·病毒及类病毒分布及特点 | 第24页 |
| ·海绵动物 | 第24-34页 |
| ·海绵动物的结构 | 第25-26页 |
| ·海绵动物的分类 | 第26-29页 |
| ·海绵动物寻常海绵纲 | 第28-29页 |
| ·海绵动物六放海绵纲 | 第29页 |
| ·海绵动物钙质海绵纲 | 第29页 |
| ·海绵动物的进化地位 | 第29-30页 |
| ·海绵动物及其共生微生物 | 第30-31页 |
| ·海绵动物的研究进展 | 第31-34页 |
| ·宏基因组技术 | 第34-36页 |
| ·宏基因组技术的应用 | 第34-36页 |
| ·宏基因组研究的前景 | 第36页 |
| ·本课题研究的意义 | 第36-38页 |
| 第二章 海绵动物分子标签技术的应用 | 第38-66页 |
| ·引言 | 第38-39页 |
| ·材料与方法 | 第39-42页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第39页 |
| ·海绵材料的采集和保存 | 第39页 |
| ·海绵骨针样本的制备 | 第39-40页 |
| ·海绵ＤＮＡ的提取 | 第40-41页 |
| ·线粒体 COX I 和 16S 序列的扩增 | 第41-42页 |
| ·基于线粒体 COX I 和 16S 序列的系统进化树的构建 | 第42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-65页 |
| ·样品采集结果 | 第42-47页 |
| ·2008 年样品采集结果 | 第42-45页 |
| ·2010 年样品采集结果 | 第45-47页 |
| ·骨针结果分析 | 第47-58页 |
| ·2008 年海绵样品骨针结果分析 | 第47-50页 |
| ·2008 年海绵样品骨针结果分析 | 第50-58页 |
| ·海绵线粒体 COX I 和 16S 序列分析 | 第58-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 第三章 海绵动物共生微生物 16S rDNA 文库的构建和分析 | 第66-79页 |
| ·引言 | 第66-67页 |
| ·材料与方法 | 第67-71页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第67页 |
| ·海绵材料的采集和保存 | 第67页 |
| ·海绵共生微生物基因组ＤＮＡ的提取 | 第67-68页 |
| ·细菌 16S 序列的扩增 | 第68-69页 |
| ·16S rDNA 文库的构建方法 | 第69-70页 |
| ·16S rDNA 文库酶切带型的分析 | 第70-71页 |
| ·16S rDNA 序列分析和系统树构建 | 第71页 |
| ·结果与讨论 | 第71-78页 |
| ·样品采集结果 | 第71页 |
| ·16S rDNA 文库构建情况 | 第71-75页 |
| ·海绵共生微生物的群落结构 | 第75-78页 |
| ·SYSP1 海绵共生微生物的群落结构——PBS2 | 第75页 |
| ·LSSP3 海绵共生微生物的群落结构——PBS4 | 第75-78页 |
| ·小结 | 第78-79页 |
| 第四章 海绵共生微生物宏基因组的分析 | 第79-104页 |
| ·引言 | 第79-80页 |
| ·材料与方法 | 第80-83页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第80页 |
| ·海绵材料的采集和保存 | 第80页 |
| ·海绵共生微生物宏基因组ＤＮＡ的提取 | 第80-81页 |
| ·京 1 样品的 16S rDNA 文库的构建 | 第81页 |
| ·宏基因组测序文库的构建 | 第81-82页 |
| ·宏基因组文库质量控制 | 第82-83页 |
| ·宏基因组文库的分析 | 第83页 |
| ·结果与讨论 | 第83-103页 |
| ·宏基因组的提取和 DNA 的评价 | 第83页 |
| ·海绵共生微生物 16S rDNA 文库分析 | 第83-84页 |
| ·宏基因组文库构建及测序情况 | 第84-92页 |
| ·海绵共生微生物宏基因的群落结构分析 | 第92-96页 |
| ·海绵宏基因的功能分析 | 第96-99页 |
| ·海绵宏基因的比较基因组分析 | 第99-103页 |
| ·小结 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-111页 |
| 文章 | 第111-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
