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美洲野生稻异源四倍体中查尔酮异构酶基因家族的系统进化

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 综述第9-14页
   ·查尔酮异构酶的特征第11-12页
   ·植物中查尔酮异构酶编码基因第12-14页
第二章 被子植物中查尔酮异构酶基因家族的系统发育与进化第14-19页
   ·材料与方法第14页
     ·序列检索和排列第14页
     ·系统发育分析第14页
   ·结果与讨论第14-19页
     ·被子植物chi基因家族的序列特点第15页
     ·被子植物chi基因家族的系统进化关系第15-19页
第三章 美洲野生稻异源四倍体中查尔酮异构酶基因家族的系统进化第19-48页
   ·植物材料与引物设计第20-21页
     ·植物材料第20页
     ·引物设计第20-21页
   ·实验流程第21-29页
     ·植物总DNA的提取第21页
     ·去除实验过程中外源性RNase的污染第21-22页
     ·RNA的提取第22-23页
     ·甲醛-琼脂糖凝胶电泳第23页
     ·除去RNA样品中的DNA第23-24页
     ·反转录第24页
     ·PCR反应第24-25页
     ·PCR产物的纯化回收第25-26页
     ·连接第26页
     ·感受态细胞的制备第26页
     ·质粒转化第26-27页
     ·质粒提取第27页
     ·测序策略第27-28页
     ·测序PCR反应第28页
     ·测序PCR产物的纯化及测序第28-29页
   ·数据处理第29页
   ·结果第29-37页
     ·总DNA的提取,总RNA的提取第29-30页
     ·双酶切质粒检测第30页
     ·DNA测序第30-31页
     ·DNA序列blast结果第31-34页
     ·利用反转录得到的cDNA进行blast第34-37页
   ·异源四倍体美洲野生稻编码CHI的基因分子进化分析第37-46页
     ·编码CHI1的DNA序列分析第37-39页
     ·编码CHI2的DNA序列分析第39-42页
     ·美洲野生稻叶鞘中CHI1的表达分析第42-44页
     ·美洲野生稻叶鞘中CHI2的表达分析第44-46页
   ·讨论第46-48页
第四章 美洲野生稻异源四倍体中磷酸丙糖异构酶基因的核苷酸多样性分析第48-54页
   ·材料和方法第49-50页
     ·植物材料第49-50页
     ·DNA提取、PCR扩增、克隆和测序第50页
     ·数据处理第50页
   ·结果与分析第50-52页
     ·rict基因序列特点第50-51页
     ·核苷酸多态性第51-52页
     ·重组、中性进化和核苷酸置换速率第52页
   ·讨论第52-54页
参考文献第54-61页
附表第61-70页
 附表3.1 美洲野生稻异源四倍体叶鞘查尔酮异构酶基因序列第61-64页
 附表4.1 美洲野生稻异源四倍体中磷酸丙糖异构酶基因序列第64-70页
在校期间发表的论文第70-71页
致谢第71页

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