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禽类病毒RNA沉默抑制子的筛选鉴定及功能分析

中文摘要第1-16页
Abstract第16-20页
1 引言第20-43页
   ·基因沉默第20-25页
     ·基因沉默的发现第20-21页
     ·转录后基因沉默第21-22页
     ·RNA 沉默的分子机制第22-25页
     ·基因沉默相关的小分子 RNA第25页
   ·RNA 沉默抑制子第25-37页
     ·RNA 沉默抑制子研究进展第25-29页
     ·RNA 沉默抑制子作用机制第29-32页
       ·干扰 RNA 沉默的起始第29-30页
       ·干扰 siRNA 的积累阻碍 siRNA 整合入 RISC第30页
       ·干扰 RISC 复合体的形成或者与复合体中的蛋白相互作用第30页
       ·干扰沉默信号的短距离或长距离移动第30-32页
     ·RNA 沉默抑制子结构功能的研究第32页
     ·RNA 沉默抑制子的鉴定方法第32-37页
       ·植物体系第32-36页
       ·昆虫及动物细胞体系第36-37页
   ·RNA 沉默抑制子的应用第37-39页
   ·本研究涉及的几种禽类病毒第39-41页
     ·火鸡疱疹病毒第39页
     ·Ⅰ型马立克氏病毒第39-40页
     ·禽流感病毒第40-41页
     ·鸡传染性支气管炎病毒第41页
   ·本研究的目的意义和主要内容第41-43页
2 材料与方法第43-62页
   ·材料第43-44页
     ·毒源第43页
     ·植物材料第43页
     ·菌株和质粒第43页
     ·PCR 引物(由济南博尚生物技术有限公司合成)第43-44页
   ·方法第44-62页
     ·植物材料管理第44-45页
     ·禽类病毒的提纯及病毒 RNA、DNA 的提取第45-47页
       ·鸡胚接种与病毒的增殖第45页
       ·鸡胚成纤维细胞的制备及病毒的接种第45-46页
       ·病毒 RNA 的提取第46页
       ·病毒 DNA 的提取第46-47页
     ·cDNA 的合成第47页
     ·目的基因的克隆及载体的构建第47-52页
       ·PCR 扩增第47-48页
       ·DNA 片段的回收(试剂盒法)第48页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第48-49页
       ·目的片段与克隆载体的连接第49页
       ·质粒 DNA 向大肠杆菌中转化(热激法)第49页
       ·转化菌落 PCR 鉴定第49页
       ·测序鉴定第49-50页
       ·质粒 DNA 的微量提取第50页
       ·目的片段和质粒 DNA 的酶切第50-51页
       ·目的片段与质粒 DNA 的连接第51页
       ·农杆菌感受态细胞的制备第51页
       ·质粒 DNA 向农杆菌中转化(冻融法)第51-52页
     ·瞬时表达系统及沉默现象观察第52-53页
       ·农杆菌介导的瞬时表达系统第52页
       ·长波紫外灯观察第52页
       ·激光共聚焦显微镜观察第52-53页
     ·定点突变第53-54页
     ·CTAB 法提取植物基因组总 DNA(小量法)第54页
     ·Western blot 检测第54-57页
       ·烟草叶片总蛋白质的提取第54-55页
       ·SDS 变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳第55-56页
       ·半干法蛋白转移第56页
       ·免疫检测第56页
       ·显色法检测蛋白质第56-57页
     ·总 RNA 的 Northern blot 检测第57-59页
       ·热酚提取植物总 RNA第57页
       ·甲醛变性凝胶电泳第57-58页
       ·总 RNA 的转膜第58页
       ·总 RNA 的杂交第58-59页
     ·小分子 RNA 的 Northern blot 检测第59-62页
       ·热酚提取植物小分子 RNA第59-60页
       ·尿素/聚丙烯酰胺凝胶电泳第60-61页
       ·小分子 RNA 的转膜第61页
       ·小分子 RNA 的杂交第61-62页
3 结果与分析第62-102页
   ·禽类病毒 RNA 沉默抑制子的筛选鉴定第62-66页
     ·候选 RNA 沉默抑制蛋白第62页
     ·候选 RNA 沉默抑制蛋白基因的载体构建第62-65页
       ·目的基因的克隆第62-63页
       ·克隆载体的构建与鉴定第63-64页
       ·植物表达载体的构建与鉴定第64-65页
     ·候选 RNA 沉默抑制蛋白瞬时侵染分析第65-66页
   ·GFP 反向重复序列载体的构建第66-67页
   ·HVT063 突变体的获得及载体构建第67-69页
   ·NS1 突变体的获得及载体构建第69-70页
   ·表达 HVT063 和 NS1 的 PVX 病毒载体构建第70-71页
   ·HVT063 沉默抑制功能分析第71-88页
     ·HVT063 抑制局部性 RNA 沉默第71-74页
       ·HVT063 抑制单链 RNA 引发的局部 RNA 沉默第71-72页
       ·HVT063 抑制双链 RNA 引发的局部 RNA 沉默第72-74页
     ·利用 PVX 病毒载体验证 HVT063 的 RNA 沉默抑制功能第74-75页
     ·HVT063 逆反已建立的局部 RNA 沉默第75-77页
     ·HVT063 抑制系统性 RNA 沉默第77-80页
       ·HVT063 抑制单链 RNA 引发的系统性 RNA 沉默第77-78页
       ·HVT063 抑制双链 RNA 引发的系统性 RNA 沉默第78-80页
     ·HVT063 的沉默抑制活性与细胞致死能力具有剂量依赖性第80-85页
     ·HVT063 突变分析第85-88页
   ·NS1 沉默抑制功能分析第88-102页
     ·NS1 抑制局部性 RNA 沉默第88-91页
       ·NS1 抑制单链 RNA 引发的局部 RNA 沉默第88-90页
       ·NS1 抑制双链 RNA 引发的局部 RNA 沉默第90-91页
     ·NS1 抑制系统性 RNA 沉默第91-94页
       ·NS1 抑制单链 RNA 引发的系统性 RNA 沉默第91-93页
       ·NS1 抑制双链 RNA 引发的系统性 RNA 沉默第93-94页
     ·NS1 与 p19 沉默抑制能力的比较第94-96页
     ·NS1 突变分析第96-102页
       ·NS1 各突变体抑制单链 RNA 引发局部 RNA 沉默的能力比较第96-99页
       ·NS1 各突变体抑制双链 RNA 引发局部 RNA 沉默的能力比较第99-102页
4 讨论第102-108页
   ·HVT063 和禽流感 NS1 为新鉴定的 RNA 沉默抑制子第102-103页
   ·HVT063 沉默抑制特点及可能的作用方式第103-106页
     ·HVT063 的局部 RNA 沉默抑制活性第103页
     ·HVT063 在 PVX 病毒表达载体中的 RNA 沉默抑制活性第103-104页
     ·HVT063 的 RNA 沉默抑制活性、细胞致死能力与其剂量之间的关系第104页
     ·HVT063 的系统 RNA 沉默抑制活性第104-105页
     ·HVT063 的 RNA 沉默抑制功能区域第105-106页
   ·NS1 沉默抑制特点及可能的作用方式第106-108页
     ·NS1 的局部 RNA 沉默抑制活性第106页
     ·NS1 的系统 RNA 沉默抑制活性第106-107页
     ·NS1 的 RNA 沉默抑制功能区域第107-108页
5 结论第108-110页
参考文献第110-127页
致谢第127-128页
攻读学位期间发表论文情况第128页

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