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基于稳定同位素标记与质谱分析的蛋白质定量数据处理方法研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 绪论第11-22页
   ·蛋白质组学第11-13页
   ·定量蛋白质组学第13页
   ·大规模蛋白质定量技术第13-19页
     ·基于双向电泳(2DE Gel)与荧光标记的定量技术第14-16页
     ·基于稳定同位素标记与质谱分析的定量技术第16-17页
     ·基于质谱分析的无标记定量技术第17-18页
     ·基于蛋白质芯片的定量技术第18-19页
   ·定量蛋白质组中生物信息学分析第19-20页
   ·论文研究内容与结构第20-22页
第二章 稳定同位素标记的质谱定量分析策略及算法第22-34页
   ·实验方法第23-26页
     ·稳定同位素标记第24页
     ·质谱分析第24页
     ·实验方法对数据处理方法的影响第24-26页
   ·定量算法第26-33页
     ·图谱定量信息提取与计算第26-28页
     ·肽段丰度比计算第28-30页
     ·蛋白质丰度比计算与差异显著性分析第30-31页
     ·定量软件第31-33页
   ·本章小结第33-34页
第三章 "定量信息缺失"问题研究及解决第34-47页
   ·实验数据产出及分析方法第34-36页
   ·"定量信息缺失"问题描述及原因分析第36-39页
     ·问题描述第37-38页
     ·原因分析第38-39页
   ·"定量信息缺失"问题解决方法第39-43页
     ·精确质量时间标签第40-41页
     ·解决方法第41-43页
   ·结果分析第43-47页
     ·各条带定量蛋白质个数对比第43-44页
     ·组间蛋白质重叠情况对比第44-45页
     ·蛋白质比值加和分布对比第45-46页
     ·定量信息缺失查找比例第46-47页
第四章 "同一蛋白,多个条带"问题研究及解决第47-56页
   ·"同一蛋白,多个条带"问题描述第47-49页
     ·蛋白质占有条带个数分布情况第47-48页
     ·蛋白质占有单一条带、相邻条带及其它条带分布情况第48-49页
   ·"同一蛋白,多个条带"问题原因分析第49页
   ·"同一蛋白,多个条带"问题解决方法第49-52页
     ·加和平均第49-51页
     ·底层整合第51-52页
   ·结果分析第52-54页
     ·"加和平均"与"底层整合"方法比较第52-53页
     ·相隔条带分开计算结果分析第53-54页
   ·本章小结第54-56页
第五章 定量软件MSAQ2.0开发及应用第56-60页
   ·软件计算流程第56-57页
     ·不同疾病状态各条带定量信息查找模块第56-57页
     ·不同条带与不同疾病状态间定量蛋白质对比模块第57页
     ·定量信息交叉搜索查找模块第57页
     ·肽段与蛋白质比值计算第57页
   ·结果显示及应用第57-58页
   ·本章小结第58-60页
第六章 总结及展望第60-63页
   ·遗留问题第60-61页
     ·"定量信息缺失"解决存在问题第60-61页
     ·"同一蛋白,多个条带"解决存在问题第61页
   ·展望第61-63页
结束语第63-64页
致谢第64-65页
参考文献第65-70页
作者在学期间取得的学术成果第70页

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