摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
第一章 绪论 | 第11-22页 |
·蛋白质组学 | 第11-13页 |
·定量蛋白质组学 | 第13页 |
·大规模蛋白质定量技术 | 第13-19页 |
·基于双向电泳(2DE Gel)与荧光标记的定量技术 | 第14-16页 |
·基于稳定同位素标记与质谱分析的定量技术 | 第16-17页 |
·基于质谱分析的无标记定量技术 | 第17-18页 |
·基于蛋白质芯片的定量技术 | 第18-19页 |
·定量蛋白质组中生物信息学分析 | 第19-20页 |
·论文研究内容与结构 | 第20-22页 |
第二章 稳定同位素标记的质谱定量分析策略及算法 | 第22-34页 |
·实验方法 | 第23-26页 |
·稳定同位素标记 | 第24页 |
·质谱分析 | 第24页 |
·实验方法对数据处理方法的影响 | 第24-26页 |
·定量算法 | 第26-33页 |
·图谱定量信息提取与计算 | 第26-28页 |
·肽段丰度比计算 | 第28-30页 |
·蛋白质丰度比计算与差异显著性分析 | 第30-31页 |
·定量软件 | 第31-33页 |
·本章小结 | 第33-34页 |
第三章 "定量信息缺失"问题研究及解决 | 第34-47页 |
·实验数据产出及分析方法 | 第34-36页 |
·"定量信息缺失"问题描述及原因分析 | 第36-39页 |
·问题描述 | 第37-38页 |
·原因分析 | 第38-39页 |
·"定量信息缺失"问题解决方法 | 第39-43页 |
·精确质量时间标签 | 第40-41页 |
·解决方法 | 第41-43页 |
·结果分析 | 第43-47页 |
·各条带定量蛋白质个数对比 | 第43-44页 |
·组间蛋白质重叠情况对比 | 第44-45页 |
·蛋白质比值加和分布对比 | 第45-46页 |
·定量信息缺失查找比例 | 第46-47页 |
第四章 "同一蛋白,多个条带"问题研究及解决 | 第47-56页 |
·"同一蛋白,多个条带"问题描述 | 第47-49页 |
·蛋白质占有条带个数分布情况 | 第47-48页 |
·蛋白质占有单一条带、相邻条带及其它条带分布情况 | 第48-49页 |
·"同一蛋白,多个条带"问题原因分析 | 第49页 |
·"同一蛋白,多个条带"问题解决方法 | 第49-52页 |
·加和平均 | 第49-51页 |
·底层整合 | 第51-52页 |
·结果分析 | 第52-54页 |
·"加和平均"与"底层整合"方法比较 | 第52-53页 |
·相隔条带分开计算结果分析 | 第53-54页 |
·本章小结 | 第54-56页 |
第五章 定量软件MSAQ2.0开发及应用 | 第56-60页 |
·软件计算流程 | 第56-57页 |
·不同疾病状态各条带定量信息查找模块 | 第56-57页 |
·不同条带与不同疾病状态间定量蛋白质对比模块 | 第57页 |
·定量信息交叉搜索查找模块 | 第57页 |
·肽段与蛋白质比值计算 | 第57页 |
·结果显示及应用 | 第57-58页 |
·本章小结 | 第58-60页 |
第六章 总结及展望 | 第60-63页 |
·遗留问题 | 第60-61页 |
·"定量信息缺失"解决存在问题 | 第60-61页 |
·"同一蛋白,多个条带"解决存在问题 | 第61页 |
·展望 | 第61-63页 |
结束语 | 第63-64页 |
致谢 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-70页 |
作者在学期间取得的学术成果 | 第70页 |