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多花水仙类胡萝卜素生物合成途径部分酶基因的克隆与分析

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
缩写词第14-16页
第一章 引言第16-28页
 1 多花水仙花色品种概况第16页
 2 植物类胡萝卜素生物合成途径的研究第16-21页
   ·植物类胡萝卜素生物合成途径第17-18页
   ·植物类胡萝卜素合成途径调控机制的相关研究第18-19页
   ·调节植物类胡萝卜素合成途径改变花色第19-20页
   ·中国水仙类胡萝卜素生物合成途径相关基因的研究第20-21页
 3 植物呈色差异的分子机理研究进展第21-25页
   ·可变剪切第22页
   ·基因差异表达第22-23页
   ·启动子区域突变第23页
   ·转录因子调控第23-24页
   ·内含子第24-25页
 4 实时荧光定量PCR的原理及基因表达的研究第25-27页
   ·实时荧光定量PCR的原理第25页
   ·基因表达研究第25-27页
 5 本研究的科学意义、研究内容第27-28页
   ·本研究的科学意义第27页
   ·研究内容第27-28页
第二章 多花水仙三种花色类型PSY基因的克隆及生物信息学分析第28-44页
 1 试验材料第28-29页
   ·植物材料第28页
   ·试剂、酶、菌株和试剂盒第28-29页
   ·耗材和仪器设备第29页
   ·引物合成第29页
 2 试验方法第29-32页
   ·多花水仙总RNA的提取、检测和逆转录第29-30页
     ·多花水仙花朵(花瓣、副冠)总RNA的提取第29页
     ·凝胶电泳分析和紫外分光光度测定第29页
     ·cDNA第一链的合成第29-30页
   ·多花水仙DNA的提取、检测第30页
   ·引物设计第30-31页
   ·目的片段的回收和连接第31页
     ·目的片度的回收第31页
     ·目的片度连接载体第31页
   ·大肠杆菌DH5α感受态的制备、转化和阳性克隆第31-32页
     ·大肠杆菌DH5α感受态的制备、转化第31页
     ·阳性克隆第31-32页
   ·序列拼接及生物学信息学分析第32页
 3 结果与分析第32-41页
   ·多花水仙盛花期的总RNA、DNA质量第32-33页
   ·三种花色类型PSY基因cDNA的ORF克隆及分析第33-39页
     ·三种花色类型PSY基因的ORF获得及编码产物同源性分析第33-36页
     ·三种花色类型的PSY蛋白一级结构分析第36-37页
     ·三种花色类型的PSY蛋白二级结构分析第37-39页
   ·三种花色类型PSY基因ORF区域的DNA克隆及分析第39-41页
     ·三种花色类型PSY的基因组全长拼接第39-40页
     ·三种花类型PSY基因的内含子序列分析第40-41页
 4 讨论第41-44页
   ·RNA的质量第41页
   ·推测多花水仙PSY基因的拷贝数第41-42页
   ·多花水仙PSY基因的进化关系第42页
   ·不同花色类型PSY基因的差异第42-44页
第三章 多花水仙三种花色类型PDS基因的克隆及生物信息学分析第44-56页
 1 试验材料第44页
 2 试验方法第44-45页
 3 结果与分析第45-53页
   ·多花水仙盛花期的总RNA、DNA质量第45-46页
   ·三种花色类型PDS基因cDNA的ORF克隆及分析第46-51页
     ·三种花色类型PDS基因的ORF获得及编码产物同源性分析第46-49页
     ·三种花色类型的PDS蛋白一级结构分析第49-50页
     ·三种花色类型的PDS蛋白二级结构分析第50-51页
   ·三种花色类型PDS基因ORF区域的部分DNA克隆及分析第51-53页
     ·三种花色类型PDS的部分基因组序列第51-52页
     ·三种花色类型PDS基因的内含子序列分析第52-53页
 4 讨论第53-56页
   ·多花水仙PDS编码区内DNA序列的克隆方法第53-54页
   ·多花水仙PDS的基因差异第54-56页
第四章 多花水仙三种花色类型ZDS基因的克隆及生物信息学分析第56-68页
 1 试验材料第56页
 2 试验方法第56-57页
   ·引物设计第56-57页
 3 结果与分析第57-66页
   ·多花水仙盛花期的总RNA、DNA质量第57-58页
   ·三种花色类型ZDS基因cDNA的ORF克隆及分析第58-63页
     ·三种花色类型ZDS基因的ORF获得及编码产物同源性分析第58-60页
     ·三种花色类型的ZDS蛋白一级结构分析第60-62页
     ·三种花色类型的ZDS蛋白二级结构分析第62-63页
   ·三种花色类型ZDS基因ORF区域的DNA克隆及分析第63-66页
     ·三种花色类型ZDS的部分基因组序列第63-65页
     ·三种花色类型ZDS基因的内含子序列分析第65-66页
     ·差异内含子的分析第66页
 4 讨论第66-68页
   ·多花水仙ZDS编码区内DNA序列的分段克隆第66-67页
   ·多花水仙ZDS基因在花色差异中的可能作用机制第67-68页
第五章 多花水仙三种花色类型LCY-β基因的克隆及生物信息学分析第68-76页
 1 试验材料第68页
 2 试验方法第68-69页
   ·引物设计第68-69页
 3 结果与分析第69-74页
   ·多花水仙盛花期的总RNA、DNA质量第69页
   ·三种花色类型LCY-β基因cDNA的ORF克隆及分析第69-74页
     ·三种花色类型LCY-β基因的ORF获得及编码产物同源性分析第69-71页
     ·三种花色类型的LCY-β蛋白一级结构分析第71-73页
     ·三种花色类型的LCY-β蛋白二级结构分析第73-74页
   ·三种花色类型LCY-β基因ORF区域的DNA克隆及分析第74页
     ·三种花色类型LCY-β的基因组全长拼接第74页
 4 讨论第74-76页
第六章 多花水仙三种花色类型LCY-ε基因的克隆及分析第76-88页
 1 试验材料第76页
 2 试验方法第76-78页
   ·多花水仙总RNA的提取、检测和逆转录第76-77页
     ·金盏银台的总RNA5′-RACEcDNA合成第76-77页
   ·金盏银台LCY-ε基因5′-RACE的克隆第77页
     ·引物合成第77页
     ·PCR扩增第77页
   ·多花水仙三种花色类型LCY-εORF的克隆第77-78页
 3 结果与分析第78-86页
   ·多花水仙盛花时期的总RNA质量第78页
   ·金盏银台LCY-ε基因的cDNA5′RACE的克隆与序列分析第78-79页
   ·金盏银台LCY-ε基因cDNA全长的获得与序列分析第79-80页
   ·三种花色类型LCY-ε基因的开放阅读框(ORF)扩增第80-86页
     ·三种花色类型的LCY-ε蛋白一级结构分析第83-84页
     ·三种花色类型的LCY-ε蛋白二级结构分析第84-86页
 4 讨论第86-88页
第七章 多花水仙花色形成中PSY、PDS、ZDS和LCY-β的qRT-PCR分析第88-102页
 1 试验材料第88-89页
   ·植物材料第88页
   ·主要试剂盒和仪器第88页
   ·引物合成第88-89页
 2 试验方法第89-91页
   ·多花水仙总RNA的提取、检测第89页
   ·两步法实时定量PCR第89-90页
     ·cDNA第一链的合成第89页
     ·实时定量PCR反应第89-90页
   ·引物设计第90-91页
 3 结果与分析第91-98页
   ·多花水仙不同时期的花朵(花瓣和副冠)总RNA质量第91页
   ·实时荧光PCR扩增内参基因和目的基因的参数分析第91-94页
     ·金盏银台的标准曲线第91-92页
     ·金盏银台的动力学曲线、融解曲线第92-94页
   ·多花水仙花色形成中相关基因的差异表达第94-98页
     ·多花水仙花色形成中PSY基因的转录水平第94-95页
     ·多花水仙花色形成中PDS基因的转录水平第95-96页
     ·多花水仙花色形成中ZDS基因的转录水平第96-97页
     ·多花水仙花色形成中LCY-β基因的转录水平第97-98页
 4 讨论第98-102页
   ·qRT-PCR方法的选择第98页
   ·多花水仙花色形成中部分基因的差异表达第98-100页
   ·试验材料选择第100-102页
参考文献第102-112页
附录1 多花水仙三种花色类型的不同发育时期第112-113页
附录2 多花水仙PSYcDNA和DNA的序列比对结果第113-117页
附录3 多花水仙ZDS基因的内含子C序列比对结果第117-118页
附录4 多花水仙ZDS基因的内含子F序列比对第118-120页
致谢第120页

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