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肉牛RXRG和MyoD1基因的克隆、SNPs筛查及其与肉质和双胎性状的关联分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第一章 文献综述第10-19页
   ·生物信息学与基因组研究概况第10页
   ·基因的电子克隆第10页
   ·候选基因分析方法第10-11页
   ·牛肉质性状与繁殖性状候选基因的研究进展第11-15页
     ·脂肪酸结合蛋白(Fatty acid-binding proteins,FABPs)基因第11-12页
     ·钙蛋白酶抑制蛋白基因(Calpastatin,CAST)第12-13页
     ·固醇调节元件结合蛋白(Adipocyte determination and differentiation-dependent factor 1, ADD1)第13页
     ·骨形态发生蛋白15 基因(Bone Morphogenetic Protein15, BMP15)第13-14页
     ·生长分化因子9(Growth differentiation factor 9, GDF9)第14-15页
   ·MYOD1 基因和RXRG 基因的研究现状第15-17页
     ·生肌决定因子I 基因(Myostatin1 ,MyoD1)第15-16页
     ·视黄素X 受体γ(Retinoid X receptor-gamma, RXRG)第16-17页
   ·研究的目的和意义第17-19页
第二章 材料与方法第19-31页
   ·试验材料第19-21页
     ·用于新基因分离的组织样品第19页
     ·用于分子标记的DNA 样品第19页
     ·主要试剂及来源第19-20页
     ·主要设备及来源第20-21页
     ·主要分子生物学数据库及软件第21页
   ·试验方法第21-31页
     ·候选基因cDNA 的克隆第21-24页
     ·候选基因SNPs 的筛查第24-27页
     ·标记与性状的关联分析第27-31页
第三章 结果与分析第31-40页
   ·RXRG 基因的克隆、鉴定及生物信息学分析第31-34页
     ·总RNA 的提取与检测第31页
     ·RXRG 基因的cDNA 克隆与序列鉴定第31-32页
     ·牛RXRG 基因与其他哺乳动物RXRG 基因cDNA 序列的同源性比较第32页
     ·组织表达谱分析第32-33页
     ·牛RXRG 基因与其它动物的氨基酸序列的遗传进化树分析第33-34页
   ·RXRG 基因的遗传变异分析第34-37页
     ·RXRG 基因SNPs 的筛查结果第34页
     ·A1941G 突变位点的基因分型结果第34-35页
     ·A1941G 位点的群体遗传学分析第35-36页
     ·RXRG 基因突变位点多态性与单、双胎性状之间的关联分析第36-37页
   ·MYOD1 基因的遗传变异分析第37-40页
     ·MyoD1 基因SNPs 的筛查结果第37页
     ·C1867T 突变位点的基因分型结果第37-38页
     ·C1867T 位点的群体遗传学分析第38-39页
     ·MyoD1 基因C1867T 位点多态性与部分肉质性状的关联分析第39-40页
第四章 讨论第40-44页
   ·关于牛肌肉组织总RNA 的提取第40页
     ·关于样品的采集和保存第40页
     ·关于总RNA 的提取过程第40页
   ·关于RT-PCR 技术和PCR 产物的克隆第40页
   ·关于RXRG 基因的克隆第40-41页
   ·关于SNPS 的筛查与鉴定第41-42页
   ·关于基因的多态性第42页
   ·SNPS 与生产性状的关联分析第42-44页
第五章 结论第44-45页
   ·研究结果第44-45页
参考文献第45-49页
英文缩略表第49-50页
致谢第50-51页
作者简介第51页

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