药物设计中半柔性分子对接优化算法研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究的背景和意义 | 第9页 |
| ·分子对接的研究现状 | 第9-12页 |
| ·分子对接方法的分类 | 第9-10页 |
| ·国外分子对接技术的研究现状 | 第10-11页 |
| ·国内分子对接技术的研究现状 | 第11-12页 |
| ·分子对接面临的问题 | 第12-13页 |
| ·本文工作 | 第13-14页 |
| 第2章 分子对接的理论 | 第14-21页 |
| ·分子对接原理 | 第14-16页 |
| ·分子表达方法 | 第16页 |
| ·分子对接中的构象空间搜索方法 | 第16-19页 |
| ·遗传算法 | 第16-17页 |
| ·禁忌搜索 | 第17页 |
| ·蒙特卡洛算法 | 第17-18页 |
| ·模拟退火算法 | 第18-19页 |
| ·打分函数 | 第19-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第3章 分子对接中搜索算法的研究与设计 | 第21-33页 |
| ·遗传算法的研究 | 第21-25页 |
| ·改进遗传算法IPSGA 的设计 | 第25-31页 |
| ·IPSGA 算法的整体架构 | 第25-26页 |
| ·个体编码方法 | 第26页 |
| ·新的遗传算子的设计 | 第26-29页 |
| ·淘汰种群的进化策略 | 第29-31页 |
| ·算例分析 | 第31-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第4章 分子对接中打分函数的研究与设计 | 第33-41页 |
| ·力场函数和隐式溶剂模型的研究 | 第33-38页 |
| ·打分函数的设计 | 第38-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第5章 分子对接算法的设计与评估 | 第41-54页 |
| ·IPSGA_DOCK 算法的设计 | 第41-43页 |
| ·算法的整体框架 | 第41页 |
| ·算法参数选择 | 第41-43页 |
| ·算法评估 | 第43-53页 |
| ·数据的准备 | 第43-46页 |
| ·对接结果分析 | 第46-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 个人简历 | 第59页 |
