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洪湖沉积物微生物垂直分布及其对环境变化的响应

摘要第1-8页
Abstract第8-11页
1 前言第11-23页
   ·沉积物研究概况第11-12页
   ·沉积物微生物组成第12-13页
     ·淡水沉积物中微生物类群组成第12-13页
     ·盐碱环境下微生物类群组成第13页
   ·沉积物微生物的特点第13-16页
     ·沉积物微生物垂直分布特点第13-14页
     ·沉积物微生物多样性的地域差异第14-15页
     ·沉积物微生物生理代谢差异第15-16页
   ·沉积物微生物与生物地球化学循环第16-18页
     ·微生物与营养元素循环第16-17页
     ·微生物与金属元素的关系第17-18页
   ·沉积物微生物研究方法概述第18-21页
     ·沉积物微生物基于培养的研究方法第18页
     ·沉积物微生物非培养的研究方法第18-21页
       ·分子生物学方法第18-20页
       ·脂肪酸图谱分析技术第20页
       ·代谢活性的研究第20页
       ·原位研究的方法第20-21页
   ·洪湖沉积物研究概况第21页
   ·研究目的和意义第21-23页
2 材料和方法第23-34页
   ·沉积物样品的采集与保存第23页
   ·主要仪器设备及试剂第23-26页
     ·本实验所用仪器设备第23-24页
     ·主要试剂及配制第24-25页
       ·主要试剂第24页
       ·所用培养基及其配制第24-25页
       ·所用溶液的配制第25页
     ·PCR引物及克隆载体第25-26页
       ·引物及其序列第25页
       ·菌株和载体第25-26页
     ·分析软件第26页
   ·实验方法第26-34页
     ·理化性质测定第26-27页
       ·沉积物样品处理第26页
       ·沉积物含水量测定第26-27页
       ·pH值测定第27页
       ·TC、TOC、TN和TP测定第27页
     ·沉积年代测定第27页
     ·沉积物总DNA抽提第27-28页
     ·细菌及古菌16S rDNA扩增第28-29页
       ·细菌16S rDNA扩增第28-29页
       ·古菌16S rDNA扩增第29页
     ·PCR产物纯化第29-30页
     ·16S rDNA克隆文库构建第30-31页
       ·PCR产物与载体连接第30页
       ·转化第30页
       ·阳性克隆子验证第30-31页
     ·限制性酶切片段长度多态性分析第31-32页
     ·克隆文库保存第32页
     ·测序第32页
     ·细菌和古菌16S rDNA系统发育分析第32-33页
     ·统计分析第33-34页
3 结果与分析第34-65页
   ·沉积物的沉积年代第34页
   ·不同层次沉积物理化性质第34-35页
   ·细菌和古菌16S rDNA的扩增结果第35-36页
   ·细菌16S rDNA多样性及其系统发育分析第36-51页
     ·细菌克隆文库的构建第36-37页
     ·细菌16S rDNA扩增片段的限制性酶切分析第37-38页
     ·细菌16S rDNA多样性指数第38-40页
     ·细菌16S rDNA系统发育分析第40-43页
     ·细菌群落结构变化与营养元素的关系第43-51页
   ·古菌16S rDNA多样性及其系统发育分析第51-57页
     ·古菌克隆文库构建第51页
     ·古菌16S rDNA扩增片段限制性酶切分析第51-52页
     ·古菌16S rDNA多样性指数第52-54页
     ·古菌16S rDNA系统发育分析第54-57页
     ·古菌群落结构变化与营养元素的关系第57页
   ·细菌与古菌垂直变化的对比分析第57-65页
4 讨论第65-68页
   ·拟杆菌的垂直分布第65-66页
   ·产甲烷古菌的类群分布第66-67页
   ·产甲烷古菌的垂直变化第67-68页
5 总结与展望第68-70页
   ·总结第68-69页
   ·展望第69-70页
参考文献第70-78页
致谢第78-79页
攻读硕士学位期间待发表论文第79页

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