| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 多巴胺受体及同源模建简述 | 第7-11页 |
| 1.1 多巴胺受体 | 第7-9页 |
| 1.2 同源模建简述 | 第9-11页 |
| 第二章 多巴胺D_4受体同源模建与优化 | 第11-23页 |
| 2.1 多巴胺D_4受体同源模建 | 第11-17页 |
| 2.1.1 氨基酸序列同源性比对 | 第11-15页 |
| 2.1.2 构建多巴胺D_4受体蛋白 | 第15-17页 |
| 2.2 优化同源模建蛋白 | 第17-23页 |
| 2.2.1 力场及分子力学概述 | 第17-18页 |
| 2.2.2 优化参数 | 第18-22页 |
| 2.2.2.1 能量最大容忍度对结构优化的影响 | 第19-20页 |
| 2.2.2.2 阈值对结构优化的影响 | 第20-21页 |
| 2.2.2.3 算法对结构优化的影响 | 第21-22页 |
| 2.2.3 优化结果 | 第22-23页 |
| 第三章 多巴胺分子及其力场参数 | 第23-30页 |
| 3.1 多巴胺(DOP) | 第23-25页 |
| 3.2 多巴胺分子的力场参数 | 第25-30页 |
| 第四章 多巴胺与多巴胺D_4受体蛋白的分子对接 | 第30-35页 |
| 4.1 分子对接简述 | 第30页 |
| 4.2 材料与方法 | 第30-31页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第31-35页 |
| 第五章 POPC磷脂双层膜及分子动力学模拟简述 | 第35-41页 |
| 5.1 POPC磷脂双层膜 | 第35-38页 |
| 5.2 分子动力学模拟简述 | 第38-41页 |
| 5.2.1 分子动力学原理简述 | 第38-39页 |
| 5.2.2 分子动力学模拟软件 | 第39-41页 |
| 第六章 多巴胺与D_4R蛋白相互作用的分子动力学模拟 | 第41-59页 |
| 6.1 引言 | 第41页 |
| 6.2 材料与方法 | 第41-44页 |
| 6.2.1 D_4R-POPC-CHO-DOP-H_2O模拟体系的构建 | 第41-42页 |
| 6.2.2 分子动力学模拟 | 第42-43页 |
| 6.2.3 结合能的计算 | 第43-44页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第44-57页 |
| 6.3.1 复合体系分子动力学模拟 | 第44-46页 |
| 6.3.2 多巴胺与D_4R蛋白的结合能 | 第46-54页 |
| 6.3.3 多巴胺与D_3R蛋白的结合能 | 第54-57页 |
| 6.4 结论 | 第57-59页 |
| 附录 | 第59-70页 |
| 参考文献 | 第70-78页 |
| 攻读硕士学位期间论文发表情况 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |