| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| abstract | 第9-10页 |
| 1 绪论 | 第18-24页 |
| 1.1 前言 | 第18页 |
| 1.2 热休克蛋白（HSPs）及其发现过程 | 第18页 |
| 1.3 热休克蛋白的类别 | 第18-19页 |
| 1.4 热休克蛋白的主要分子生物学功能 | 第19页 |
| 1.5 水产类中的热休克蛋白研究进展 | 第19页 |
| 1.6 DnaJ蛋白简介 | 第19-22页 |
| 1.6.1 DnaJ蛋白的结构 | 第20页 |
| 1.6.2 DnaJ蛋白的分类 | 第20-21页 |
| 1.6.3 DnaJ蛋白的作用原理 | 第21-22页 |
| 1.7 本研究的目的及其意义 | 第22页 |
| 1.8 课题来源及论文的内容安排 | 第22-24页 |
| 2 罗氏沼虾转录组测序 | 第24-33页 |
| 2.1 材料 | 第24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第24页 |
| 2.2 方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 实验材料的处理 | 第24-25页 |
| 2.2.2 总RNA提取 | 第25页 |
| 2.2.3 总RNA样品检测 | 第25-26页 |
| 2.2.4 Illumina测序 | 第26页 |
| 2.2.5 过滤测序数据 | 第26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-31页 |
| 2.3.1 转录组组装与分析 | 第26-27页 |
| 2.3.2 Unigene的长度分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3 Unigene注释 | 第28-30页 |
| 2.3.4 差异表达筛选 | 第30-31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-33页 |
| 3 DnaJ基因序列筛选及克隆 | 第33-51页 |
| 3.1 DnaJ基因筛选 | 第33页 |
| 3.2 材料及方法 | 第33-35页 |
| 3.2.1 实验材料的处理 | 第33页 |
| 3.2.2 实验试剂 | 第33页 |
| 3.2.3 主要仪器 | 第33页 |
| 3.2.4 RNA提取 | 第33页 |
| 3.2.5 引物 | 第33-35页 |
| 3.3 方法 | 第35-42页 |
| 3.3.1 四种不同DnaJ基因序列的克隆 | 第35-42页 |
| 3.4 结果 | 第42-46页 |
| 3.4.1 DnaJ A1基因的cDNA序列分析 | 第42-43页 |
| 3.4.2 DnaJ B6基因的cDNA序列分析 | 第43-44页 |
| 3.4.3 DnaJ C2基因的cDNA序列分析 | 第44-45页 |
| 3.4.4 DnaJ C5基因的cDNA序列分析 | 第45-46页 |
| 3.5 DnaJ基因序列比对及系统进化树分析 | 第46-48页 |
| 3.6 系统进化树分析 | 第48-49页 |
| 3.7 讨论 | 第49-51页 |
| 4 罗氏沼虾中四种DnaJ mRNA的表达分析 | 第51-68页 |
| 4.1 DnaJ基因在罗氏沼虾不同组织中的表达 | 第51-56页 |
| 4.1.1 材料及方法 | 第51-53页 |
| 4.1.2 四种不同Dna J在不同组织中的表达分布 | 第53-55页 |
| 4.1.3 讨论 | 第55-56页 |
| 4.2 DnaJ基因在不同温度处理下的表达差异 | 第56-61页 |
| 4.2.1 材料及方法 | 第56页 |
| 4.2.2 DnaJ A1在不同温度处理下的表达差异 | 第56-58页 |
| 4.2.3 DnaJ B6在不同温度处理下的表达差异 | 第58-59页 |
| 4.2.4. DnaJ C2在不同温度处理下的表达差异 | 第59-60页 |
| 4.2.5 DnaJ C5在不同温度处理下的表达差异 | 第60页 |
| 4.2.6 讨论 | 第60-61页 |
| 4.3 细菌侵染不同时间的表达差异 | 第61-66页 |
| 4.3.1 嗜水气单胞菌侵染实验 | 第61页 |
| 4.3.2 提取RNA | 第61页 |
| 4.3.3 样品cDNA的合成 | 第61页 |
| 4.3.4 荧光定量PCR | 第61-62页 |
| 4.3.5 DnaJ A1在嗜水气单胞菌侵染后的表达差异 | 第62-63页 |
| 4.3.6 DnaJ B6在嗜水气单胞菌侵染后的表达差异 | 第63-64页 |
| 4.3.7 DnaJ C2在嗜水气单胞菌侵染后的表达差异 | 第64-65页 |
| 4.3.8 DnaJ C5在嗜水气单胞菌侵染后的表达差异 | 第65-66页 |
| 4.3.9 四种DnaJ基因在嗜水气单胞菌侵染后的表达差异 | 第66页 |
| 4.4 讨论 | 第66-68页 |
| 5 总结 | 第68-71页 |
| 5.1 研究总结 | 第68-69页 |
| 5.2 创新点 | 第69-70页 |
| 5.3 展望 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 作者简历 | 第76页 |
