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柑橘NBS类抗病同源序列的克隆与分析

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
英文缩略表第8-13页
第一章 文献综述第13-28页
 1. 柑橘溃疡病概况第13-16页
   ·柑橘溃疡病的发生历史及分布第13-14页
   ·柑橘溃疡病的危害及致病机理第14-15页
   ·柑橘溃疡病的病原菌第15-16页
 2. 植物的抗病反应第16-17页
 3. 植物抗病基因的研究第17-22页
   ·植物抗病基因的结构及其特点第17-19页
     ·核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)第17-18页
     ·富含亮氨酸重复序列(leucine-rich repeats,LRR)第18-19页
     ·丝氨酸/苏氨酸激酶域(STK)第19页
     ·亮氨酸拉链(leucine zipper,LZ)第19页
   ·植物抗病基因的类型与功能第19-22页
 4. 植物抗病基因的克隆第22-24页
   ·转座子标签技术(transposon tagging)第22页
   ·图位克隆技术(map-based cloning)第22-23页
   ·同源序列技术(homologous sequence)第23页
   ·发展中的植物基因克隆新技术第23-24页
 5. 植物抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs)第24-26页
   ·RGAs的应用第24-26页
     ·以RGAs为探针,定位和克隆抗病基因第25页
     ·辅助抗病育种第25页
     ·分析评价种质资源的遗传多样性第25-26页
   ·问题与展望第26页
 6. 立项的依据和意义第26-28页
第二章 柑橘抗溃疡病同源基因的克隆与分析第28-45页
 1. 材料与试剂第28-29页
   ·材料第28页
     ·植物材料第28页
     ·菌种及质粒第28页
   ·生化试剂第28-29页
   ·PCR引物的设计与合成第29页
 2. 方法第29-35页
   ·柑橘叶片总DNA的提取第29-30页
   ·DNA质量检测第30页
   ·PCR扩增第30-31页
   ·PCR扩增特意带的回收第31页
   ·大肠杆菌感受态细胞的制备第31-32页
   ·回收产物的克隆第32页
     ·连接第32页
     ·连接产物转化大肠杆菌第32页
   ·阳性克隆的菌落PCR鉴定第32-33页
   ·质粒的提取第33-34页
   ·重组子的酶切分类第34页
   ·序列分析第34-35页
 3. 结果与分析第35-42页
   ·柑橘RGA的克隆第35-38页
     ·柑橘总DNA的提取第35页
     ·目的片段的扩增第35-36页
     ·目的片段的回收第36页
     ·连接转化与蓝白筛选第36页
     ·菌落PCR鉴定第36-37页
     ·酶切分类第37-38页
   ·柑橘抗病基因同源序列分析第38-42页
     ·克隆片段的测序结果及初步分析第38-39页
     ·柑橘抗病基因同源序列的聚类分析第39-41页
     ·柑橘RGAs与已知的植物抗病基因相关氨基酸序列相似性比较第41-42页
 4. 讨论第42-45页
第三章 柑橘NBS类抗病同源基因的分子鉴定第45-62页
 1. 材料与试剂第45-46页
   ·材料第45页
     ·植物材料第45页
     ·酶与主要生物试剂第45页
     ·杂交试剂盒第45页
   ·常用试剂第45-46页
 2. 方法第46-55页
   ·NBS类抗病基因的PCR鉴定第46-47页
     ·引物的设计第46-47页
     ·柑橘基因组DNA中RGA的PCR鉴定第47页
   ·Southern印迹杂交第47-52页
     ·CTAB法大量提取植物总DNA第47-48页
     ·样品的酶切与电泳第48-50页
       ·限制性内切酶的选择第48页
       ·DNA样品的消化第48-49页
       ·琼脂糖凝胶电泳第49-50页
     ·转膜与DNA的固定第50-52页
       ·DNA的变性第50页
       ·转膜第50-51页
       ·DNA的固定第51-52页
   ·探针的标记与探针灵敏度检测第52-54页
     ·PCR法快速制备地高辛标记探针第52页
     ·标记探针灵敏度的检测第52-54页
   ·杂交第54-55页
 3. 结果与分析第55-59页
   ·柑橘基因组DNA中RGA的PCR检测第55页
   ·植物组织总DNA大量提取第55-56页
   ·样品的酶切、电泳第56-57页
   ·PCR标记地高辛探针第57页
   ·标记探针灵敏度的检测第57-58页
   ·Southern印迹杂交检测结果第58-59页
 4. 讨论第59-62页
   ·PCR鉴定第59页
   ·southern印记杂交第59-61页
     ·DNA样品的制备第59页
     ·PCR标记DIG探针第59-60页
     ·转膜和固定第60页
     ·预杂交和杂交第60-61页
   ·关于柑橘NBS类抗病基因的拷贝数第61-62页
第四章 全文总结第62-64页
参考文献第64-70页
附录:9个阳性克隆的测序结果第70-73页
致谢第73-74页
作者简介第74页

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