蛋白质序列特征提取及其在功能预测中的应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-18页 |
| ·研究背景及意义 | 第11-13页 |
| ·研究现状 | 第13-16页 |
| ·论文主要工作及结构安排 | 第16-18页 |
| 第2章 蛋白质功能预测方法 | 第18-32页 |
| ·蛋白质序列 | 第19-21页 |
| ·蛋白质的基本组成单位-氨基酸 | 第19-20页 |
| ·氨基酸的分类 | 第20-21页 |
| ·蛋白质序列数据集 | 第21-22页 |
| ·PIR蛋白质信息资源 | 第21页 |
| ·SWISS-PROT蛋白质的序列和注释 | 第21-22页 |
| ·特征提取方法 | 第22-26页 |
| ·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法 | 第23-24页 |
| ·基于氨基酸物化特性的特征提取方法 | 第24-26页 |
| ·其他特征提取方法 | 第26页 |
| ·相似性度量方法 | 第26-28页 |
| ·距离函数 | 第27页 |
| ·相似系数函数 | 第27-28页 |
| ·分类算法 | 第28-31页 |
| ·小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于BLAST比对的特征提取方法 | 第32-44页 |
| ·序列比对 | 第32-35页 |
| ·双序列比对 | 第33页 |
| ·多序列比对 | 第33-34页 |
| ·打分方案 | 第34-35页 |
| ·BLAST | 第35-37页 |
| ·Bl2Seq | 第37-39页 |
| ·基于BLAST比对的特征提取 | 第39-43页 |
| ·算法思想 | 第39-41页 |
| ·Bl2Seq比对数据 | 第41页 |
| ·计算标准差权重 | 第41页 |
| ·计算整体相似度 | 第41-42页 |
| ·实验及结果分析 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第4章 改进的K近邻算法在蛋白质功能预测中应用 | 第44-50页 |
| ·K近邻算法 | 第44-45页 |
| ·改进的K近邻算法 | 第45-49页 |
| ·基于分组重量编码的特征提取 | 第45-46页 |
| ·基于距离权重的K近邻算法思想 | 第46-48页 |
| ·实验及结果分析 | 第48-49页 |
| ·小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文和参加的项目 | 第57页 |
