摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第一章 绪论 | 第12-21页 |
·引言 | 第12-13页 |
·研究背景 | 第13-18页 |
·膜蛋白类型概述 | 第13-16页 |
·国内外研究现状 | 第16-18页 |
·本文主要工作及创新 | 第18-19页 |
·论文结构 | 第19-21页 |
第二章 膜蛋白序列的特征提取和分类算法 | 第21-32页 |
·引言 | 第21页 |
·膜蛋白序列的特征提取算法 | 第21-26页 |
·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法 | 第22-23页 |
·基于氨基酸物理化学特性的特征提取方法 | 第23-25页 |
·其它特征提取方法 | 第25-26页 |
·膜蛋白分类算法 | 第26-29页 |
·基于统计的分类算法 | 第27-28页 |
·基于机器学习的算法 | 第28-29页 |
·分类模型的检验与评估 | 第29-31页 |
·模型的检验 | 第29-30页 |
·模型的评估 | 第30-31页 |
·本章小结 | 第31-32页 |
第三章 新膜蛋白序列数据集的建立 | 第32-39页 |
·数据集数据来源简介 | 第32-33页 |
·SWISS-PROT数据库的约定 | 第33-35页 |
·数据库的结构 | 第33页 |
·数据的级别 | 第33-34页 |
·序列条目的结构 | 第34-35页 |
·新膜蛋白数据集的建立 | 第35-38页 |
·数据集建立的准则 | 第35-36页 |
·CE2059 和 CE2625 的不足分析 | 第36-37页 |
·新数据集的建立 | 第37-38页 |
·本章小结 | 第38-39页 |
第四章 基于多种氨基酸残基指数构建自相关系数多特征提取算法 | 第39-49页 |
·特征提取 | 第39-41页 |
·支持向量机 | 第41-43页 |
·特征降维 | 第43-44页 |
·实验结果与分析 | 第44-47页 |
·本章小结 | 第47-49页 |
第五章 结束语 | 第49-52页 |
·本文工作总结 | 第49-50页 |
·下一步工作展望 | 第50-52页 |
致谢 | 第52-54页 |
参考文献 | 第54-61页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第61-62页 |
攻读硕士期间参加的科研工作 | 第62-63页 |
附录A 836 条 type I transmembrane proteins ID号 | 第63-67页 |
附录 B 165 条 type II transmembrane proteins ID 号 | 第67-68页 |
附录 C 4490 条 multi-pass transmembrane proteins ID 号 | 第68-86页 |
附录D 259 条 lipid-chain anchored membrane proteins ID号 | 第86-87页 |