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膜蛋白分类的特征提取算法和数据集构建技术研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 绪论第12-21页
   ·引言第12-13页
   ·研究背景第13-18页
     ·膜蛋白类型概述第13-16页
     ·国内外研究现状第16-18页
   ·本文主要工作及创新第18-19页
   ·论文结构第19-21页
第二章 膜蛋白序列的特征提取和分类算法第21-32页
   ·引言第21页
   ·膜蛋白序列的特征提取算法第21-26页
     ·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法第22-23页
     ·基于氨基酸物理化学特性的特征提取方法第23-25页
     ·其它特征提取方法第25-26页
   ·膜蛋白分类算法第26-29页
     ·基于统计的分类算法第27-28页
     ·基于机器学习的算法第28-29页
   ·分类模型的检验与评估第29-31页
     ·模型的检验第29-30页
     ·模型的评估第30-31页
   ·本章小结第31-32页
第三章 新膜蛋白序列数据集的建立第32-39页
   ·数据集数据来源简介第32-33页
   ·SWISS-PROT数据库的约定第33-35页
     ·数据库的结构第33页
     ·数据的级别第33-34页
     ·序列条目的结构第34-35页
   ·新膜蛋白数据集的建立第35-38页
     ·数据集建立的准则第35-36页
     ·CE2059 和 CE2625 的不足分析第36-37页
     ·新数据集的建立第37-38页
   ·本章小结第38-39页
第四章 基于多种氨基酸残基指数构建自相关系数多特征提取算法第39-49页
   ·特征提取第39-41页
   ·支持向量机第41-43页
   ·特征降维第43-44页
   ·实验结果与分析第44-47页
   ·本章小结第47-49页
第五章 结束语第49-52页
   ·本文工作总结第49-50页
   ·下一步工作展望第50-52页
致谢第52-54页
参考文献第54-61页
攻读硕士学位期间发表的论文第61-62页
攻读硕士期间参加的科研工作第62-63页
附录A 836 条 type I transmembrane proteins ID号第63-67页
附录 B 165 条 type II transmembrane proteins ID 号第67-68页
附录 C 4490 条 multi-pass transmembrane proteins ID 号第68-86页
附录D 259 条 lipid-chain anchored membrane proteins ID号第86-87页

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