| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 家蝇的研究与应用概况 | 第11-13页 |
| 1.2 转录组在家蝇研究中的应用 | 第13-18页 |
| 1.2.1 测序技术的发展及其应用概况 | 第13-16页 |
| 1.2.2 转录组技术在家蝇对逆境的响应研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.2.3 转录组技术在家蝇免疫研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 环境温度与昆虫的关系 | 第18-20页 |
| 1.3.1 环境温度与昆虫滞育 | 第18-19页 |
| 1.3.2 环境温度对家蝇的影响 | 第19-20页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 第二章 不同温度胁迫下家蝇幼虫转录组研究 | 第21-28页 |
| 2.1 材料、试剂与仪器 | 第21页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-24页 |
| 2.2.0 温度对家蝇幼虫生长的影响 | 第21-22页 |
| 2.2.1 家蝇幼虫TotalRNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.2 TotalRNA样品的检测 | 第22-23页 |
| 2.2.3 转录组文库构建及测序 | 第23页 |
| 2.2.4 测序数据的denovo组装 | 第23-24页 |
| 2.2.5 Unigene生物信息学分析 | 第24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-27页 |
| 2.3.1 温度对家蝇幼虫生长的影响 | 第24-25页 |
| 2.3.2 转录组测序数据产量统计 | 第25页 |
| 2.3.3 Denovo组装结果 | 第25-26页 |
| 2.3.4 基因功能注释结果 | 第26-27页 |
| 2.3.5 Unigenes的CDS检测和SSR检测结果 | 第27页 |
| 2.4 讨论 | 第27-28页 |
| 第三章 3个不同培养温度下家蝇幼虫差异表达分析 | 第28-46页 |
| 3.1 实验材料与主要仪器、试剂 | 第28页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第28页 |
| 3.1.2 主要仪器设备 | 第28页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第28页 |
| 3.2 实验方法 | 第28-36页 |
| 3.2.1 总RNA的提取 | 第28-29页 |
| 3.2.2 表达谱测序 | 第29页 |
| 3.2.3 测序数据比对与饱和度分析 | 第29-30页 |
| 3.2.4 基因定量分析及差异表达基因筛选 | 第30-31页 |
| 3.2.5 差异表达基因的GO分析 | 第31页 |
| 3.2.6 差异表达基因的Pathway分析 | 第31-32页 |
| 3.2.7 荧光定量PCR | 第32-36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-44页 |
| 3.3.1 测序数据产量及质控结果 | 第36页 |
| 3.3.2 差异表达基因筛选结果 | 第36-37页 |
| 3.3.3 差异基因的GO功能显著性富集分析 | 第37-38页 |
| 3.3.4 差异基因的Pathway显著性富集分析 | 第38-42页 |
| 3.3.5 Real Time PCR结果 | 第42-44页 |
| 3.4 讨论 | 第44-46页 |
| 第四章 结论与展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-57页 |
| 研究生期间发表的论文 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
