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低氧应激下甘肃鼢鼠脑和肝中MsrA的表达及其基因克隆与生物信息学分析

摘要第3-6页
Abstract第6-9页
第1章 前言第13-25页
    1.1 地下鼠第13-16页
        1.1.1 地下鼠概述第13-14页
        1.1.2 地下鼠低氧适应研究进展第14-16页
    1.2 甘肃鼢鼠第16-17页
        1.2.1 甘肃鼢鼠概述第16页
        1.2.2 甘肃鼢鼠低氧适应第16-17页
    1.3 低氧应激第17-18页
    1.4 抗氧化酶系第18页
    1.5 甲硫氨酸硫氧化物还原酶第18-21页
        1.5.1 蛋白质中甲硫氨酸Met的氧化与还原第18-19页
        1.5.2 甲硫氨酸硫氧化物还原酶A(MsrA)第19-21页
    1.6 生物信息学概述第21-22页
    1.7 研究目标和内容第22-25页
        1.7.1 研究目标第22页
        1.7.2 研究内容第22-25页
第2章 甘肃鼢鼠MsrA mRNA表达第25-41页
    2.1 实验材料第25-26页
        2.1.1 实验动物第25页
        2.1.2 主要实验仪器和耗材第25-26页
        2.1.3 主要实验试剂第26页
        2.1.4 主要试剂配方第26页
    2.2 实验方法第26-31页
        2.2.1 实验取材第26-27页
        2.2.2 总RNA提取第27-28页
        2.2.3 总RNA质量鉴定第28页
        2.2.4 第一链cDNA合成第28-29页
        2.2.5 实时定量RT-PCR第29-31页
    2.3 结果与分析第31-36页
        2.3.1 模板及引物专一性检测第31-32页
        2.3.2 实时定量RT-PCR结果第32-36页
    2.4 讨论第36-41页
第3章 甘肃鼢鼠MsrA基因克隆第41-47页
    3.1 实验材料第41-42页
        3.1.1 实验动物第41页
        3.1.2 实验设备及耗材第41-42页
        3.1.3 主要实验试剂第42页
        3.1.4 主要试剂配方第42页
    3.2 实验方法第42-44页
        3.2.1 总RNA提取第42页
        3.2.2 第一链cDNA合成第42页
        3.2.3 引物设计第42-43页
        3.2.4 扩增甘肃鼢鼠MsrA基因所用体系和程序第43-44页
        3.2.5 PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测第44页
        3.2.6 扩增片段的回收纯化第44页
    3.3 结果与分析第44-46页
        3.3.1 甘肃鼢鼠总RNA的提取第44-45页
        3.3.2 甘肃鼢鼠MsrA基因cDNA序列的扩增第45页
        3.3.3 甘肃鼢鼠MsrA基因序列开放阅读框分析第45-46页
    3.4 讨论第46-47页
第4章 甘肃鼢鼠MsrA蛋白序列的生物信息学分析第47-71页
    4.1 研究方法第47-51页
        4.1.1 甘肃鼢鼠MsrA蛋白理化性质分析第47页
        4.1.2 甘肃鼢鼠MsrA蛋白信号肽分析第47-48页
        4.1.3 蛋白质跨膜结构区分析第48页
        4.1.4 甘肃鼢鼠MsrA蛋白亚细胞定位第48页
        4.1.5 甘肃鼢鼠MsrA蛋白疏水性分析第48页
        4.1.6 甘肃鼢鼠MsrA蛋白Coil区分析第48-49页
        4.1.7 甘肃鼢鼠MsrA蛋白结构域分析第49页
        4.1.8 蛋白质功能基序分析第49页
        4.1.9 蛋白质二级结构分析第49页
        4.1.10 蛋白质三级结构分析第49-50页
        4.1.11 MsrA核苷酸和氨基酸的同源性分析第50页
        4.1.12 甘肃鼢鼠MsrA的遗传距离和进化树分析第50页
        4.1.13 甘肃鼢鼠MsrA的功能分化分析第50页
        4.1.14 选择压力分析第50-51页
    4.2 研究结果第51-68页
        4.2.1 甘肃鼢鼠MsrA蛋白理化性质分析第51-52页
        4.2.2 甘肃鼢鼠MsrA蛋白信号肽分析第52-53页
        4.2.3 蛋白质跨膜结构区分析第53-54页
        4.2.4 甘肃鼢鼠MsrA蛋白亚细胞定位第54页
        4.2.5 甘肃鼢鼠MsrA蛋白疏水性分析第54-55页
        4.2.6 甘肃鼢鼠MsrA蛋白Coil区分析第55页
        4.2.7 甘肃鼢鼠MsrA蛋白结构域分析第55-56页
        4.2.8 蛋白质的功能基序分析第56-57页
        4.2.9 蛋白质二级结构分析第57-59页
        4.2.10 蛋白质三级结构分析第59页
        4.2.11 MsrA核苷酸和氨基酸的同源性分析第59-64页
        4.2.12 甘肃鼢鼠MsrA的遗传距离和进化树分析第64-65页
        4.2.13 MsrA功能分化分析第65-66页
        4.2.14 甘肃鼢鼠MsrA的选择压力分析第66-68页
    4.3 讨论第68-71页
第5章 总结第71-73页
参考文献第73-83页
致谢第83-85页
攻读硕士学位期间的研究成果第85页

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