| EPIGRAPH | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| CONTENTS | 第15-19页 |
| LIST OF FIGURES | 第19-20页 |
| LIST OF TABLES | 第20-21页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第21-29页 |
| 1.1 Introduction | 第21-26页 |
| 1.2 Reference | 第26-29页 |
| CHAPTER 2 LITERATURE REVIEW | 第29-71页 |
| 2.1 Back ground | 第29页 |
| 2.2 Discovery of Deoxyribonucleic acid (DNA) | 第29-31页 |
| 2.3 Development of molecular markers | 第31-35页 |
| 2.3.1 Restriction fragment length polymorphism (RFLP) | 第32页 |
| 2.3.2 Random amplified polymorphic DNA (RAPD) | 第32-33页 |
| 2.3.3 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) | 第33页 |
| 2.3.4 Simple sequence repeat (SSR) | 第33-34页 |
| 2.3.5 Single nucleotide polymorphism (SNP) | 第34-35页 |
| 2.4 Genetic Linkage Mapping | 第35-36页 |
| 2.4.1 Resources for construction genetic maps | 第35-36页 |
| 2.5 Linkage mapping in aquaculture | 第36页 |
| 2.6 Mapping quantitative trait loci (QTL) | 第36-42页 |
| 2.6.1 Qualitative traits | 第37-39页 |
| a) Color | 第37页 |
| b) LDH and SOD | 第37页 |
| c) Sex | 第37-38页 |
| d) Diseases resistance | 第38页 |
| e) Stress response | 第38页 |
| f) Temperature tolerance | 第38-39页 |
| 2.6.2 Quantitative traits | 第39-42页 |
| a) Meristic | 第39页 |
| b) Body length | 第39页 |
| c) Body size | 第39-40页 |
| d) Body weight | 第40页 |
| e) Embryonic development | 第40页 |
| f) Fat percentage and distribution | 第40-41页 |
| g) Feed conversion ratio (FCR) | 第41页 |
| h) Fecundity | 第41页 |
| i) Growth rate | 第41-42页 |
| j) Hatch time | 第42页 |
| k) Spawning time | 第42页 |
| 2.7 Fish Genetics | 第42-43页 |
| 2.8 Marker-assisted selection breeding | 第43-44页 |
| 2.9 Common carp | 第44-46页 |
| 2.10 Summary | 第46-47页 |
| 2.11 References | 第47-71页 |
| CHAPTER 3 MATERIALS AND METHODS | 第71-79页 |
| 3.1 Source of Population | 第71-72页 |
| 3.2 Trait measurement | 第72页 |
| 3.2.1 Population 1 | 第72页 |
| 3.2.2 Population 2 | 第72页 |
| 3.2.3 Population 3 | 第72页 |
| 3.3 DNA sampling and isolation | 第72页 |
| 3.4 Development of molecular markers | 第72-74页 |
| 3.4.1 Microsatellite markers | 第73页 |
| 3.4.2 Single nucleotide polymorphism | 第73-74页 |
| 3.5 Genotyping | 第74页 |
| 3.6 Construction of genetic linkage map | 第74-75页 |
| 3.7 Mapping Quantitative trait loci (QTL) | 第75页 |
| 3.8 Statistical analysis | 第75-76页 |
| 3.9 References | 第76-79页 |
| CHAPTER 4 MAPPING QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL) FOR BODY WEIGHT, LENGTH AND CONDITION FACTOR TRAITS IN BACKCROSS (BC1) FAMILY OF COMMON CARP (CYPRINUS CARPIO L.) | 第79-107页 |
| 4.1 Introduction | 第79-81页 |
| 4.2 Materials and methods | 第81-84页 |
| 4.2.1 Source of population and traits | 第81-82页 |
| 4.2.2 DNA extraction | 第82页 |
| 4.2.3 Microsatellite and SNP genotyping | 第82-83页 |
| 4.2.4 Construction of genetic map | 第83页 |
| 4.2.5 QTL analysis in Population | 第83-84页 |
| 4.3 Results | 第84-99页 |
| 4.3.1 Traits measurement | 第84页 |
| 4.3.2 Linkage map | 第84页 |
| 4.3.3 QTL mapping | 第84-91页 |
| 4.3.4 Statistical analysis | 第91-99页 |
| 4.4 Discussion | 第99-100页 |
| 4.5 Summary | 第100-101页 |
| 4.6 References | 第101-107页 |
| CHAPTER 5 QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL) ASSOCIATED WITH GROWTH-RATE TRAIT IN COMMON CARP (CYPRINUS CARPIO L.) | 第107-121页 |
| 5.1 Introduction | 第107-109页 |
| 5.2 Material and methods | 第109-110页 |
| 5.2.1 Source of population and traits | 第109页 |
| 5.2.2 DNA extraction | 第109页 |
| 5.2.3 Microsatellite and SNP genotyping | 第109页 |
| 5.2.4 Construction of genetic map | 第109页 |
| 5.2.5 QTL analysis in population | 第109-110页 |
| 5.3 Results | 第110-113页 |
| 5.3.1 Trait measurement | 第110页 |
| 5.3.2 Linkage map | 第110页 |
| 5.3.3 QTL mapping | 第110-113页 |
| 5.4 Discussion | 第113-115页 |
| 5.5 Summery | 第115页 |
| 5.6 Reference | 第115-121页 |
| CHAPTER 6 MAPPING QTLs FOR SWIMMING ABILITY RELATED TRAITS IN COMMON CARP (CYPRINUS CARPIO L.) | 第121-149页 |
| 6.1 Introduction | 第121-124页 |
| 6.2 Material and method | 第124-126页 |
| 6.2.1 Source of population and traits | 第124页 |
| 6.2.2 DNA extraction | 第124页 |
| 6.2.3 Microsatellite and SNP genotyping | 第124-125页 |
| 6.2.4 Construction of genetic map | 第125页 |
| 6.2.5 QTL analysis in population | 第125-126页 |
| 6.3 Results | 第126-132页 |
| 6.3.1 Trait measurement | 第126页 |
| 6.3.2 Linkage map | 第126页 |
| 6.3.3 QTL mapping | 第126-128页 |
| 6.3.4 Statistical analysis | 第128-132页 |
| 6.4 Discussion | 第132-142页 |
| 6.5 Summery | 第142-143页 |
| 6.6 Reference | 第143-149页 |
| CHAPTER 7 CONCLUSION AND FUTURE WORK | 第149-151页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第151-153页 |
| LIST OF PUBLICATIONS | 第153-154页 |
