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基于微生物群落特征的海岸带生境诊断方法研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 绪论第10-20页
    1.1 课题背景第10-11页
    1.2 海洋微生物指标的研究方法第11-13页
        1.2.1 PCR技术第11页
        1.2.2 荧光定量PCR技术第11-12页
        1.2.3 高通量测序技术第12页
        1.2.4 荧光显微技术第12-13页
    1.3 微生物的信息学分析第13页
    1.4 对海洋微生物指标的研究现状第13-14页
    1.5 藻毒素合成基因的概述第14-16页
    1.6 深圳湾概况第16-17页
    1.7 课题研究目的及内容第17-20页
        1.7.1 课题来源及研究目的第17-18页
        1.7.2 本研究的研究内容第18-20页
第2章 实验材料与方法第20-28页
    2.1 实验材料第20-21页
        2.1.1 实验样本第20页
        2.1.2 主要分子生物学试剂第20页
        2.1.3 实验仪器及设备第20-21页
    2.2 实验方法第21-27页
        2.2.1 水质理化指标测定第21-22页
        2.2.2 DNA提取第22页
        2.2.3 目标基因的PCR扩增第22-23页
        2.2.4 荧光定量PCR第23-26页
        2.2.5 数据分析第26-27页
    2.4 本章小节第27-28页
第3章 深圳湾海岸带微生物群落结构和环境因子的相关性分析第28-66页
    3.1 取样设计第28-30页
    3.2 深圳湾不同季节水样理化性质的变化规律第30-41页
        3.2.1 水温的时空分布第30-31页
        3.2.2 盐度的时空分布第31-33页
        3.2.3 溶解氧的时空分布第33-35页
        3.2.4 可溶解性无机氮的时空分布第35-39页
        3.2.5 总磷的时空分布第39-41页
    3.3 深圳湾不同季节水样微生物指标的变化规律第41-57页
        3.3.1 生物量的时空分布第41-44页
        3.3.2 高通量测序方法的确定第44-47页
        3.3.3 微生物群落结构的时空变化第47-55页
        3.3.4 微生物群落多样性的时空变化第55-57页
    3.4 微生物群落结构与环境因子的相关性分析第57-61页
        3.4.1 样本之间差异性分析第57-58页
        3.4.2 微生物群落结构与环境因子的相关性分析第58-60页
        3.4.3 微生物生物量与环境因子之间的相关性分析第60-61页
    3.5 暴雨事件对深圳湾海岸带水环境的影响第61-65页
        3.5.1 暴雨对理化因子的影响第61-62页
        3.5.2 暴雨对微生物群落结构的影响第62-65页
    3.6 本章小结第65-66页
第4章 深圳湾海岸带病原微生物的风险评估第66-77页
    4.1 病原菌的预筛选第66-67页
    4.2 病原微生物在深圳湾海岸带的时空分布第67-69页
    4.3 病原微生物污染源解析第69-75页
        4.3.1 粪便指示微生物——厚壁菌门和拟杆菌门的组成分析第69-74页
        4.3.2 主要病原菌的溯源分析第74-75页
    4.4 本章小结第75-77页
第5章 深圳湾藻类风险分析第77-89页
    5.1 深圳湾蓝藻检测方法比较第77-81页
        5.1.1 基于藻细胞的自然荧光特性探究总叶绿素和蓝藻的时空分布第77-80页
        5.1.2 基于高通量测序对蓝藻的定量分析检验第80-81页
    5.2 藻毒素PCR定性分析第81-85页
        5.2.1 藻毒素功能基因引物的预筛选第81-83页
        5.2.2 Microcystin(微囊藻毒素)合成基因Mcy B的多样性分析第83-84页
        5.2.3 Microcystin(微囊藻毒素)合成基因Mcy B的时空分布第84-85页
    5.3 微囊藻毒素MCYB基因的QPCR定量分析第85-86页
    5.4 微囊藻毒素的时空分布第86-87页
    5.5 本章小节第87-89页
结论第89-90页
参考文献第90-99页
致谢第99页

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