摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第1章 绪论 | 第10-20页 |
1.1 课题背景 | 第10-11页 |
1.2 海洋微生物指标的研究方法 | 第11-13页 |
1.2.1 PCR技术 | 第11页 |
1.2.2 荧光定量PCR技术 | 第11-12页 |
1.2.3 高通量测序技术 | 第12页 |
1.2.4 荧光显微技术 | 第12-13页 |
1.3 微生物的信息学分析 | 第13页 |
1.4 对海洋微生物指标的研究现状 | 第13-14页 |
1.5 藻毒素合成基因的概述 | 第14-16页 |
1.6 深圳湾概况 | 第16-17页 |
1.7 课题研究目的及内容 | 第17-20页 |
1.7.1 课题来源及研究目的 | 第17-18页 |
1.7.2 本研究的研究内容 | 第18-20页 |
第2章 实验材料与方法 | 第20-28页 |
2.1 实验材料 | 第20-21页 |
2.1.1 实验样本 | 第20页 |
2.1.2 主要分子生物学试剂 | 第20页 |
2.1.3 实验仪器及设备 | 第20-21页 |
2.2 实验方法 | 第21-27页 |
2.2.1 水质理化指标测定 | 第21-22页 |
2.2.2 DNA提取 | 第22页 |
2.2.3 目标基因的PCR扩增 | 第22-23页 |
2.2.4 荧光定量PCR | 第23-26页 |
2.2.5 数据分析 | 第26-27页 |
2.4 本章小节 | 第27-28页 |
第3章 深圳湾海岸带微生物群落结构和环境因子的相关性分析 | 第28-66页 |
3.1 取样设计 | 第28-30页 |
3.2 深圳湾不同季节水样理化性质的变化规律 | 第30-41页 |
3.2.1 水温的时空分布 | 第30-31页 |
3.2.2 盐度的时空分布 | 第31-33页 |
3.2.3 溶解氧的时空分布 | 第33-35页 |
3.2.4 可溶解性无机氮的时空分布 | 第35-39页 |
3.2.5 总磷的时空分布 | 第39-41页 |
3.3 深圳湾不同季节水样微生物指标的变化规律 | 第41-57页 |
3.3.1 生物量的时空分布 | 第41-44页 |
3.3.2 高通量测序方法的确定 | 第44-47页 |
3.3.3 微生物群落结构的时空变化 | 第47-55页 |
3.3.4 微生物群落多样性的时空变化 | 第55-57页 |
3.4 微生物群落结构与环境因子的相关性分析 | 第57-61页 |
3.4.1 样本之间差异性分析 | 第57-58页 |
3.4.2 微生物群落结构与环境因子的相关性分析 | 第58-60页 |
3.4.3 微生物生物量与环境因子之间的相关性分析 | 第60-61页 |
3.5 暴雨事件对深圳湾海岸带水环境的影响 | 第61-65页 |
3.5.1 暴雨对理化因子的影响 | 第61-62页 |
3.5.2 暴雨对微生物群落结构的影响 | 第62-65页 |
3.6 本章小结 | 第65-66页 |
第4章 深圳湾海岸带病原微生物的风险评估 | 第66-77页 |
4.1 病原菌的预筛选 | 第66-67页 |
4.2 病原微生物在深圳湾海岸带的时空分布 | 第67-69页 |
4.3 病原微生物污染源解析 | 第69-75页 |
4.3.1 粪便指示微生物——厚壁菌门和拟杆菌门的组成分析 | 第69-74页 |
4.3.2 主要病原菌的溯源分析 | 第74-75页 |
4.4 本章小结 | 第75-77页 |
第5章 深圳湾藻类风险分析 | 第77-89页 |
5.1 深圳湾蓝藻检测方法比较 | 第77-81页 |
5.1.1 基于藻细胞的自然荧光特性探究总叶绿素和蓝藻的时空分布 | 第77-80页 |
5.1.2 基于高通量测序对蓝藻的定量分析检验 | 第80-81页 |
5.2 藻毒素PCR定性分析 | 第81-85页 |
5.2.1 藻毒素功能基因引物的预筛选 | 第81-83页 |
5.2.2 Microcystin(微囊藻毒素)合成基因Mcy B的多样性分析 | 第83-84页 |
5.2.3 Microcystin(微囊藻毒素)合成基因Mcy B的时空分布 | 第84-85页 |
5.3 微囊藻毒素MCYB基因的QPCR定量分析 | 第85-86页 |
5.4 微囊藻毒素的时空分布 | 第86-87页 |
5.5 本章小节 | 第87-89页 |
结论 | 第89-90页 |
参考文献 | 第90-99页 |
致谢 | 第99页 |