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国槐和紫薇带化病植原体的分子鉴定

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第11-23页
    1.1 植原体的发现第11页
    1.2 植原体的形态第11页
    1.3 植原体病害症状及致病机理第11-12页
    1.4 植原体的分类第12-17页
        1.4.1 植原体的系统学位置第12页
        1.4.2 植原体暂定名分类第12-13页
        1.4.3 基于常用的保守基因的分类第13-14页
        1.4.4 DNA 条形码鉴定植原体第14-15页
        1.4.5 植原体 16S rRNA 基因的计算机模拟 RFLP 分析第15-17页
        1.4.6 植原体分类中存在的主要问题第17页
    1.5 植原体检测方法第17-20页
        1.5.1 电子显微镜检测植原体第18页
        1.5.2 组织学检测第18页
        1.5.3 PCR 检测第18-19页
        1.5.4 实时荧光 PCR 检测技术第19页
        1.5.5 Reverse Transcription-PCR 检测第19-20页
    1.6 植原体的基因组学第20-21页
    1.7 国槐和紫薇植原体病害的研究现状第21页
    1.8 紫薇 DNA 提取方法及存在问题第21-22页
    1.9 本研究的目的和意义第22-23页
第二章 国槐带化病植原体的分子鉴定第23-44页
    2.1 材料第23-24页
        2.1.1 植物材料第23页
        2.1.2 试验中溶液的配置第23页
        2.1.3 主要试剂第23-24页
        2.1.4 主要仪器第24页
    2.2 方法第24-28页
        2.2.1 植物总 DNA 的提取第24页
        2.2.2 PCR 扩增第24-26页
        2.2.3 PCR 产物的回收纯化第26页
        2.2.4 克隆目的片段第26-27页
        2.2.5 阳性克隆的鉴定第27页
        2.2.6 目标序列的测序及分析第27-28页
        2.2.7 在线工具 iPhyClssifier 分析 16S rDNA 序列第28页
    2.3 结果与分析第28-41页
        2.3.1 国槐带化植原体病害的田间症状第28-29页
        2.3.2 国槐植原体 16S rRNA 序列分析第29-35页
        2.3.3 国槐植原体 rp 基因序列及系统发育分析第35-39页
        2.3.4 植原体 tuf 基因序列分析第39-41页
    2.4 结论与讨论第41-44页
        2.4.1 结论第41-42页
        2.4.2 讨论第42-44页
第三章 紫薇带化病植原体的分子鉴定第44-59页
    3.1 材料第44页
        3.1.1 植物材料第44页
        3.1.2 试验中溶液的配置第44页
        3.1.3 主要试剂参考 2.1.3第44页
        3.1.4 试验仪器参考 2.1.4第44页
    3.2 方法第44-47页
        3.2.1 紫薇 DNA 提取方法试验第44-46页
        3.2.2 琼脂糖凝胶检测提取的紫薇总 DNA第46页
        3.2.3 检测提取的 DNA 的浓度第46页
        3.2.4 紫薇茎总 DNA 的 RAPD 试验第46页
        3.2.5 植原体的 16S rDNA 基因的扩增第46页
        3.2.6 目标序列的测序及分析第46-47页
    3.3 结果与分析第47-55页
        3.3.1 紫薇的田间症状表现第47页
        3.3.2 不同 PVP 浓度和 CTAB 浓度对 DNA 质量的影响第47-49页
        3.3.3 PVP 粉末加入量对提取 DNA 质量的影响第49-51页
        3.3.4 紫薇总 DNA 的 RAPD-PCR第51-52页
        3.3.5 紫薇茎带化植原体 16S rDNA 序列分析第52-55页
    3.4 结论与讨论第55-59页
        3.4.1 结论第55-56页
        3.4.2 讨论第56-59页
第四章 结论与讨论第59-60页
    4.1 结论第59页
    4.2 讨论第59-60页
参考文献第60-70页
致谢第70-71页
作者简介第71页

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