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群体感应信号分子降解酶AiiA的分子进化研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第1章 绪论第12-24页
   ·群体感应第12-16页
     ·群体感应现象的发现第12页
     ·群体感应的类型第12-14页
       ·革兰氏阴性菌的群体感应第12-14页
       ·革兰氏阳性菌的群体感应第14页
       ·种间群体感应第14页
     ·信号分子及其检测第14-15页
       ·信号分子的检测原理第14页
       ·微生物传感菌(或质粒)的种类第14-15页
       ·信号分子的检测方法第15页
     ·群体感应的抑制第15-16页
       ·抑制信号分子的合成第15-16页
       ·降解信号分子第16页
       ·抑制信号分子与调节蛋白的结合第16页
   ·群体感应淬灭酶AiiA第16-20页
     ·AiiA酶第16-19页
       ·AiiA酶的作用机制和特性第17-18页
       ·AiiA酶的生物学功能第18页
       ·AiiA酶在生防及药理学上的应用第18-19页
     ·AiiA酶的存在第19-20页
       ·原核生物中的AiiA酶第19页
       ·真核生物中的AiiA酶第19-20页
   ·DNA改组第20-23页
     ·体外分子进化的新策略第20-22页
       ·DNA家族改组第20-21页
       ·单链DNA家族改组第21页
       ·部分基因片段改组第21页
       ·简并引物基因改组第21-22页
       ·基因组改组第22页
       ·其他分子进化方法第22页
     ·体外分子进化展望第22-23页
   ·研究目的与意义第23-24页
第2章 材料与方法第24-44页
   ·实验材料第24-25页
     ·菌株与质粒第24页
     ·药品与试剂第24-25页
     ·仪器第25页
   ·实验方法第25-44页
     ·aiiA基因库的构建第26-36页
       ·aiiA基因的扩增第26-27页
         ·基因组的抽提第26页
         ·aiiA基因的PCR扩增第26-27页
         ·aiiA基因的割胶回收第27页
       ·DNA Shuffling第27-31页
         ·aiiA基因的DNase Ⅰ(Rnase Free)酶切第27-28页
           ·DNase Ⅰ(Rnase Free)使用浓度的优化第28页
           ·DNase Ⅰ(Rnase Free)酶切时间的优化第28页
         ·DNase Ⅰ(Rnase Free)酶切产物割胶回收第28页
         ·aiiAshuffling基因的无引物PCR第28-30页
           ·第一轮无引物PCR第29页
           ·第二轮无引物PCR第29页
           ·第三轮无引物PCR第29-30页
         ·aiiAshuffling基因的有引物PCR第30-31页
         ·aiiAshuffling基因的PCR产物割胶回收第31页
       ·aiiAshuffling/pET-28a(+)/BL21(DE3)的构建第31-36页
         ·pET-28a(+)质粒的抽提第31-32页
         ·aiiAshuffling基因和pET-28a(+)质粒的酶切、连接第32-33页
         ·BL21(DE3)感受态的制备第33页
         ·aiiAshuffling/pET-28a(+)的转化第33-34页
         ·AiiA蛋白诱导表达第34-36页
     ·高酶活AiiA蛋白的筛选第36-43页
       ·报告菌CV026的培养第36-37页
       ·3OC6-HSL信号分子的制备第37-40页
         ·luxI/pET-28a(+)/BL21(DE3)的构建第37-39页
           ·luxI基因的PCR扩增第37-38页
           ·luxI和pET-28a(+)的酶切、连接第38-39页
           ·luxI/pET-28a(+)的转化第39页
         ·3OC6-HSL信号分子的制备第39-40页
       ·筛选体系的建立第40页
       ·筛选体系的优化第40页
         ·产3OC6-HSL信号分子培养物体积的优化第40页
         ·CV026报告菌体积的优化第40页
         ·酶反应时间的优化第40页
       ·高酶活AiiA蛋白的初筛第40页
       ·筛选结果测序第40-41页
       ·进化前后AiiA蛋白的氨基酸差异第41页
       ·高酶活AiiA蛋白的制备第41-43页
         ·AiiA蛋白的表达第41页
         ·AiiA蛋白的纯化第41-42页
         ·AiiA蛋白的复性第42-43页
         ·AiiA蛋白的浓缩第43页
     ·AiiA蛋白的酶活性分析第43-44页
       ·蛋白浓度测定第43页
       ·AiiA蛋白活性分析第43-44页
第3章 结果与讨论第44-65页
   ·aiiA基因库的构建第44-52页
     ·aiiA基因的扩增第44-45页
       ·基因组的抽提第44页
       ·aiiA基因的PCR扩增第44-45页
       ·aiiA基因的割胶回收第45页
     ·DNA Shuffling第45-50页
       ·aiiA基因的DNase Ⅰ(RNase Free)酶切第45-47页
         ·DNase Ⅰ(RNase Free)使用浓度的优化第45-46页
         ·DNase Ⅰ(RNase Free)酶切时间的优化第46-47页
       ·DNase Ⅰ(RNase Free)酶切产物割胶回收第47-48页
       ·aiiAshuffling基因的无引物PCR第48-49页
         ·第一轮无引物PCR第48页
         ·第二轮无引物PCR第48-49页
         ·第三轮无引物PCR第49页
       ·aiiAshuffling基因的有引物PCR第49-50页
       ·aiiAshuffling基因的PCR产物割胶回收第50页
     ·aiiAshuffling/pET-28a(+)/BL21(DE3)的构建第50-52页
       ·pET-28a(+)质粒的抽提第50-51页
       ·aiiAshuffling基因和pET-28a(+)质粒的酶切、连接第51页
       ·BL21(DE3)感受态的制备第51页
       ·aiiAshuffling/pET-28a(+)的转化第51页
       ·AiiA蛋白诱导表达第51-52页
   ·高酶活AiiA蛋白的筛选第52-62页
     ·报告菌CV026的培养第52页
     ·3OC6-HSL信号分子的制备第52-53页
       ·luxI/pET-28a(+)/BL21(DE3)的构建第52-53页
         ·luxI基因的PCR扩增第52-53页
         ·luxI和pET-28a(+)的酶切、连接第53页
         ·luxI/pET-28a(+)的转化第53页
       ·3OC6-HSL信号分子的制备第53页
         ·培养基的选择第53页
         ·诱导温度的优化第53页
         ·诱导时间的优化第53页
     ·筛选体系的建立第53页
     ·筛选体系的优化第53-54页
       ·产3OC6-HSL信号分子培养物体积的优化第53-54页
       ·CV026报告菌体积的优化第54页
       ·酶反应时间的优化第54页
     ·高酶活AiiA蛋白的初筛第54-55页
     ·筛选结果测序第55-58页
     ·进化前后AiiA蛋白的氨基酸差异第58-61页
     ·高酶活AiiA蛋白的制备第61-62页
       ·AiiA蛋白的表达第61页
       ·AiiA蛋白的纯化第61-62页
       ·AiiA蛋白的复性第62页
       ·AiiA蛋白的浓缩第62页
   ·AiiA蛋白的酶活分析第62-65页
     ·蛋白浓度测定第62-63页
     ·AiiA蛋白活性分析第63-65页
第4章 结论第65-66页
参考文献第66-71页
致谢第71-72页

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