| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第11-12页 |
| 1.2 研究现状及内容 | 第12-15页 |
| 1.3 本文的章节安排 | 第15-17页 |
| 第二章 基于方差和中值调整的RNA-Seq数据标准化方法 | 第17-31页 |
| 2.1 实验数据及分析平台 | 第17-19页 |
| 2.1.1 实验数据 | 第17-18页 |
| 2.1.2 分析平台 | 第18-19页 |
| 2.2 RNA-Seq数据标准化 | 第19-22页 |
| 2.2.1 RNA-Seq技术 | 第19-20页 |
| 2.2.2 数据标准化的必要性 | 第20-21页 |
| 2.2.3 数据标准化原理分析 | 第21-22页 |
| 2.3 最小方差中值标准化方法 | 第22-30页 |
| 2.3.1 分析流程 | 第23-26页 |
| 2.3.2 方差优化 | 第26-30页 |
| 2.3.3 中值调整 | 第30页 |
| 2.4 本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 标准化方法的评估 | 第31-43页 |
| 3.1 基于数据分布评估 | 第31-33页 |
| 3.1.1 箱线图和MA图 | 第31-32页 |
| 3.1.2 变异系数 | 第32-33页 |
| 3.2 基于经验统计量评估 | 第33-35页 |
| 3.2.1 均方误差 | 第33-34页 |
| 3.2.2 K-S检验 | 第34-35页 |
| 3.3 基于差异表达分析评估 | 第35-41页 |
| 3.3.1 差异表达分析 | 第35-36页 |
| 3.3.2 负二项分布模型 | 第36-37页 |
| 3.3.3 基于均值方差的模型 | 第37-39页 |
| 3.3.4 差异表达模型检验 | 第39-41页 |
| 3.4 本章小结 | 第41-43页 |
| 第四章 结果分析与讨论 | 第43-51页 |
| 4.1 数据预处理分析 | 第43-44页 |
| 4.2 数据分布结果 | 第44-48页 |
| 4.2.1 原始数据预分析 | 第44-45页 |
| 4.2.2 标准化后数据分布 | 第45-48页 |
| 4.3 经验统计结果 | 第48-49页 |
| 4.3.1 均方误差 | 第48页 |
| 4.3.2 K-S检验 | 第48-49页 |
| 4.4 差异表达分析结果 | 第49-50页 |
| 4.5 本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-55页 |
| 5.1 总结 | 第51-52页 |
| 5.2 展望 | 第52-55页 |
| 附录 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 攻读硕士期间发表的论文与参与的项目 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |