| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 文献综述 | 第9-18页 |
| 1 RNA二级结构 | 第9-10页 |
| 1.1 RNA二级结构概述及其预测方法 | 第9页 |
| 1.2 rRNAITS二级结构与功能的关系 | 第9-10页 |
| 1.3 rRNAITS二级结构在系统发育分析中的应用 | 第10页 |
| 2 DNA条形码 | 第10-12页 |
| 2.1 DNA条形码的提出 | 第11页 |
| 2.2 DNA条形码的定义及选择标准 | 第11页 |
| 2.3 DNA条形码技术的操作及分析方法 | 第11-12页 |
| 2.4 DNA条形码的优点和不足 | 第12页 |
| 3 ITS基因作为DNA条形码的研究进展 | 第12-15页 |
| 3.1 ITS基因在植物DNA条形码中的应用研究 | 第13页 |
| 3.2 ITS基因在动物DNA条形码中的应用研究 | 第13-14页 |
| 3.3 ITS基因在真菌DNA条形码中的应用研究 | 第14-15页 |
| 4 黏菌分子系统学研究概况 | 第15-16页 |
| 4.1 黏菌分子系统学研究的国外概况 | 第15-16页 |
| 4.2 黏菌分子系统学研究的国外概况 | 第16页 |
| 5 本研究的内容、目的和意义及技术路线 | 第16-18页 |
| 5.1 研究内容 | 第16-17页 |
| 5.2 研究目的和意义 | 第17-18页 |
| 第2章 绒泡菌目黏菌的ITS1-5.8S-ITS2序列和结构的分析 | 第18-39页 |
| 1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2 实验方法 | 第19-24页 |
| 2.1 实验所用主要试剂与实验仪器 | 第19-21页 |
| 2.1.1 实验所用主要试剂 | 第19页 |
| 2.1.2 主要试剂的配制 | 第19-20页 |
| 2.1.3 实验所用仪器 | 第20-21页 |
| 2.2 基因组DNA的提取 | 第21页 |
| 2.3 引物的筛选 | 第21-22页 |
| 2.4 PCR扩增和测序 | 第22-24页 |
| 2.4.1 PCR反应条件 | 第22页 |
| 2.4.2 PCR产物的检测 | 第22-23页 |
| 2.4.3 PCR产物的纯化 | 第23页 |
| 2.4.4 PCR产物克隆和测序 | 第23-24页 |
| 2.5 实验数据分析 | 第24页 |
| 3 实验结果 | 第24-36页 |
| 3.1 ITS序列的核苷酸分析 | 第24-25页 |
| 3.2 绒泡菌目黏菌的ITS1结构 | 第25-26页 |
| 3.3 绒泡菌目黏菌的5.8S结构 | 第26-29页 |
| 3.4 绒泡菌目黏菌的ITS2结构 | 第29-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| 第3章 ITS序列作为黏菌DNA条形码的探讨 | 第39-51页 |
| 1 实验材料 | 第39-40页 |
| 2 实验方法 | 第40-41页 |
| 2.1 实验所用主要试剂与实验仪器 | 第40页 |
| 2.2 基因组DNA提取 | 第40页 |
| 2.3 引物的筛选 | 第40页 |
| 2.4 PCR扩增和测序 | 第40页 |
| 2.5 序列编辑 | 第40-41页 |
| 2.6 数据分析 | 第41页 |
| 2.6.1 ITS序列种内与种间遗传距离差异 | 第41页 |
| 2.6.2 Barcoding gap分析 | 第41页 |
| 2.6.3 基于ITS序列的分子系统学分析 | 第41页 |
| 3 实验结果 | 第41-50页 |
| 3.1 基因组DNA的提取 | 第41页 |
| 3.2 PCR反应的适宜条件 | 第41-42页 |
| 3.3 PCR扩增结果 | 第42-44页 |
| 3.4 种内与种间遗传距离的差异比较 | 第44-45页 |
| 3.5 DNA barcoding gap的评估 | 第45-46页 |
| 3.6 系统发育树的构建 | 第46-50页 |
| 4 讨论 | 第50-51页 |
| 第4章 ITS1-5.8S-ITS2 rDNA序列与绒泡菌目黏菌的系统发育 | 第51-58页 |
| 1 实验材料 | 第51页 |
| 2 实验方法 | 第51-52页 |
| 2.1 实验所用主要试剂与实验仪器 | 第51页 |
| 2.2 基因组DNA的提取 | 第51页 |
| 2.3 引物的筛选 | 第51-52页 |
| 2.4 PCR扩增和测序 | 第52页 |
| 2.5 实验数据处理和分析 | 第52页 |
| 3 实验结果 | 第52-56页 |
| 4 讨论 | 第56-58页 |
| 全文总结 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-69页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
