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基于iTRAQ技术的桑树硬枝扦插生根的蛋白质组学研究及MaTIR1基因的表达分析

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第15-23页
    1.1 研究背景第15-21页
        1.1.1 桑树的概述第15页
        1.1.2 桑树的扦插繁殖第15-16页
        1.1.3 扦插不定根形成机理第16-17页
        1.1.4 植物不定根形成发育的蛋白质组学研究进展第17-18页
        1.1.5 同位素的相对和绝对定量技术(iTRAQ)第18-20页
        1.1.6 TIR1基因的研究现状第20-21页
    1.2 研究的目的及意义第21页
    1.3 研究内容第21-23页
        1.3.1 基于iTRAQ技术的桑树硬枝扦插蛋白质组分析第21-22页
        1.3.2 MaTIR1基因的初步分析第22-23页
第2章 基于iTRAQ技术的桑树硬枝扦插蛋白质组分析第23-47页
    2.1 材料与设备第23-24页
        2.1.1 植物材料第23页
        2.1.2 主要仪器与设备第23-24页
        2.1.3 主要试剂第24页
    2.2 试验方法第24-29页
        2.2.1 桑树皮部蛋白的提取与烷基化处理第24-25页
        2.2.2 Bradford测定蛋白浓度第25页
        2.2.3 SDS-PAGE电泳第25-26页
        2.2.4 蛋白质样品的酶解与iTRAQ标记第26页
        2.2.5 强阳离子交换柱(SCX)分离混合标记肽段第26页
        2.2.6 LC-ESI-MSMS质谱分析(Triple TOF 5600)第26-27页
        2.2.7 质谱原始数据处理与蛋白质的鉴定第27-28页
        2.2.8 鉴定蛋白的生物信息学分析第28页
        2.2.9 差异蛋白的生物信息学分析第28-29页
    2.3 结果与分析第29-44页
        2.3.1 样品总蛋白质量检测第29-30页
        2.3.2 蛋白鉴定质量评估第30-31页
        2.3.3 蛋白质鉴定数据基本信息第31-33页
        2.3.4 鉴定的总蛋白的COG,GO,Pathway分析第33-37页
        2.3.5 差异蛋白的确定第37-38页
        2.3.6 差异蛋白的GO富集分析第38-41页
        2.3.7 差异蛋白的KEGG功能富集第41-43页
        2.3.8 差异蛋白的聚类分析第43-44页
    2.4 讨论第44-47页
        2.4.1 植物激素相关蛋白第44-45页
        2.4.2 能量代谢与碳代谢相关蛋白第45页
        2.4.3 黄酮类合成相关蛋白第45-47页
第3章 MaTIR1的克隆及在组织器官和扦插生根过程的达分析第47-63页
    3.1 材料与试剂第47-49页
        3.1.1 植物材料、载体、菌种第47页
        3.1.2 主要酶与试剂第47-48页
        3.1.3 常用基本溶液的配置第48页
        3.1.4 引物的设计与合成第48-49页
    3.2 实验方法第49-55页
        3.2.1 桑树TIR1基因克隆第49-52页
        3.2.2 桑树TIR1基因的生物信息学分析第52-53页
        3.2.3 桑树TIR1基因的组织特异性分析第53-54页
        3.2.4 桑树TIR1基因在硬枝与绿枝扦插生根过程中的表达分析第54-55页
    3.3 结果与分析第55-62页
        3.3.1 桑树MaTIR1基因的克隆与测序鉴定第55-56页
        3.3.2 桑树MaTIR1基因及其编码蛋白质的序列特征第56-57页
        3.3.3 桑树MaTIR1基因编码氨基酸的同源性与系统进化分析第57-60页
        3.3.4 MaTIR1基因表达的组织特异性第60-61页
        3.3.5 MaTIR1在桑树硬枝与绿枝扦插生根过程中的表达变化第61-62页
    3.4 讨论第62-63页
结论第63-64页
参考文献第64-69页
附录第69-70页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第70-71页
致谢第71页

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