摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-20页 |
1.1 研究背景和意义 | 第10-11页 |
1.1.1 研究背景 | 第10-11页 |
1.1.2 研究意义 | 第11页 |
1.2 研究现状 | 第11-18页 |
1.2.1 生物序列的序列比对方法介绍 | 第11-12页 |
1.2.2 生物序列的非比对分析方法介绍 | 第12-14页 |
1.2.3 蛋白质序列的相似性分析方法 | 第14-17页 |
1.2.4 相似性分析方法 | 第17-18页 |
1.3 论文的主要研究内容 | 第18页 |
1.4 论文的组织结构 | 第18-20页 |
第二章 基于k-字位置序列的蛋白质序列相似性分析方法 | 第20-30页 |
2.1 蛋白质的k-字位置序列 | 第20-21页 |
2.2 基于标准化的k-字区间平均距离的相似性方法 | 第21-22页 |
2.2.1 标准化的k-字区间平均距离 | 第21页 |
2.2.2 蛋白质序列k-字位置序列的数值向量 | 第21页 |
2.2.3 蛋白质序列间相似性的计算 | 第21-22页 |
2.3 基于改进的标准化的k-字区间平均距离的相似性方法 | 第22-23页 |
2.3.1 改进的标准化的k-字区间平均距离 | 第22页 |
2.3.2 蛋白质序列k-字位置序列的数值向量 | 第22页 |
2.3.3 蛋白质序列间相似性的计算 | 第22-23页 |
2.4 结果与分析 | 第23-29页 |
2.4.1 ND5蛋白质序列的结果分析 | 第24-26页 |
2.4.2 ND6蛋白质序列的结果分析 | 第26-28页 |
2.4.3 两种方法的比较分析 | 第28-29页 |
2.5 本章小结 | 第29-30页 |
第三章 结合氨基酸物化性质和频率位置信息的方法 | 第30-45页 |
3.1 结合氨基酸物化性质和频率位置信息的蛋白质序列相似性分析方法 | 第30-33页 |
3.1.1 氨基酸出现的概率向量 | 第30页 |
3.1.2 氨基酸的位置概率向量 | 第30页 |
3.1.3 氨基酸物化性质平均值向量 | 第30-32页 |
3.1.4 蛋白质序列的数值化表示 | 第32页 |
3.1.5 蛋白质序列的相似性分析 | 第32-33页 |
3.2 ND5蛋白质序列的相似性分析结果 | 第33-34页 |
3.3 ND6蛋白质序列的相似性分析结果 | 第34-35页 |
3.4 方法评价 | 第35-40页 |
3.4.1 评价指标 | 第35页 |
3.4.2 比较结果分析 | 第35-40页 |
3.5 28个甲型流感病毒数据的分析结果 | 第40-44页 |
3.5.1 基于改进的标准化k-字的相对距离方法的结果(k(28)1) | 第40-42页 |
3.5.2 结合氨基酸的物化性质和频率位置信息方法的结果 | 第42-43页 |
3.5.3 基于ClustalW方法的结果 | 第43-44页 |
3.6 本章小结 | 第44-45页 |
第四章 结论与讨论 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-50页 |
附录 | 第50-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
作者简介 | 第59页 |