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基于位置序列的蛋白质序列相似性分析及其应用

摘要第5-6页
abstract第6-7页
第一章 绪论第10-20页
    1.1 研究背景和意义第10-11页
        1.1.1 研究背景第10-11页
        1.1.2 研究意义第11页
    1.2 研究现状第11-18页
        1.2.1 生物序列的序列比对方法介绍第11-12页
        1.2.2 生物序列的非比对分析方法介绍第12-14页
        1.2.3 蛋白质序列的相似性分析方法第14-17页
        1.2.4 相似性分析方法第17-18页
    1.3 论文的主要研究内容第18页
    1.4 论文的组织结构第18-20页
第二章 基于k-字位置序列的蛋白质序列相似性分析方法第20-30页
    2.1 蛋白质的k-字位置序列第20-21页
    2.2 基于标准化的k-字区间平均距离的相似性方法第21-22页
        2.2.1 标准化的k-字区间平均距离第21页
        2.2.2 蛋白质序列k-字位置序列的数值向量第21页
        2.2.3 蛋白质序列间相似性的计算第21-22页
    2.3 基于改进的标准化的k-字区间平均距离的相似性方法第22-23页
        2.3.1 改进的标准化的k-字区间平均距离第22页
        2.3.2 蛋白质序列k-字位置序列的数值向量第22页
        2.3.3 蛋白质序列间相似性的计算第22-23页
    2.4 结果与分析第23-29页
        2.4.1 ND5蛋白质序列的结果分析第24-26页
        2.4.2 ND6蛋白质序列的结果分析第26-28页
        2.4.3 两种方法的比较分析第28-29页
    2.5 本章小结第29-30页
第三章 结合氨基酸物化性质和频率位置信息的方法第30-45页
    3.1 结合氨基酸物化性质和频率位置信息的蛋白质序列相似性分析方法第30-33页
        3.1.1 氨基酸出现的概率向量第30页
        3.1.2 氨基酸的位置概率向量第30页
        3.1.3 氨基酸物化性质平均值向量第30-32页
        3.1.4 蛋白质序列的数值化表示第32页
        3.1.5 蛋白质序列的相似性分析第32-33页
    3.2 ND5蛋白质序列的相似性分析结果第33-34页
    3.3 ND6蛋白质序列的相似性分析结果第34-35页
    3.4 方法评价第35-40页
        3.4.1 评价指标第35页
        3.4.2 比较结果分析第35-40页
    3.5 28个甲型流感病毒数据的分析结果第40-44页
        3.5.1 基于改进的标准化k-字的相对距离方法的结果(k(28)1)第40-42页
        3.5.2 结合氨基酸的物化性质和频率位置信息方法的结果第42-43页
        3.5.3 基于ClustalW方法的结果第43-44页
    3.6 本章小结第44-45页
第四章 结论与讨论第45-46页
参考文献第46-50页
附录第50-58页
致谢第58-59页
作者简介第59页

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