庐山和井冈山不同海拔野生油茶叶片比较转录组研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第10-23页 |
| 1.1 油茶概述 | 第10-12页 |
| 1.1.1 油茶经济价值 | 第11页 |
| 1.1.2 油茶产业发展现状 | 第11-12页 |
| 1.2 作物野生近缘种——作物育种的宝贵遗传资源 | 第12-13页 |
| 1.3 野生油茶遗传资源的挖掘与利用 | 第13-15页 |
| 1.3.1 野生油茶对低温的耐受性 | 第14页 |
| 1.3.2 应用分子技术开发野生油茶遗传资源 | 第14-15页 |
| 1.4 分子标记技术与作物遗传资源利用 | 第15-18页 |
| 1.4.1 分子标记技术 | 第15-16页 |
| 1.4.2 作物遗传资源研究中的分子标记 | 第16-18页 |
| 1.5 比较转录组研究概述 | 第18-20页 |
| 1.5.1 转录组测序 | 第18-19页 |
| 1.5.2 比较转录组 | 第19-20页 |
| 1.5.2.1 比较转录组与分子标记开发 | 第19页 |
| 1.5.2.2 比较转录组与基因差异表达 | 第19-20页 |
| 1.6 山茶属植物中的转录组研究 | 第20-21页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第21-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 采样地 | 第23页 |
| 2.1.2 野生油茶样品采集 | 第23-25页 |
| 2.2 主要试剂与仪器 | 第25-27页 |
| 2.2.1 RNA提取试剂 | 第25页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第25-26页 |
| 2.2.3 主要试剂配制 | 第26页 |
| 2.2.4 主要仪器 | 第26-27页 |
| 2.3 实验方法 | 第27-29页 |
| 2.3.1 野生油茶叶片总RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.3.2 总RNA质量检测 | 第28-29页 |
| 2.4 高通量测序和分析 | 第29-34页 |
| 2.4.1 文库构建 | 第29-30页 |
| 2.4.2 高通量测序 | 第30页 |
| 2.4.3 测序数据过滤 | 第30-31页 |
| 2.4.4 数据拼接 | 第31页 |
| 2.4.5 Unigene的定义和注释 | 第31-32页 |
| 2.4.6 分子标记鉴别 | 第32页 |
| 2.4.7 基因表达水平分析和差异表达基因筛选 | 第32-34页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第34-60页 |
| 3.1 实验结果 | 第34-55页 |
| 3.1.1 野生油茶叶片RNA质量检测 | 第34-36页 |
| 3.1.2 测序数据质量 | 第36-37页 |
| 3.1.3 转录本拼接 | 第37-39页 |
| 3.1.4 Unigene功能注释 | 第39-45页 |
| 3.1.5 变异位点分析 | 第45-48页 |
| 3.1.6 基因表达分析 | 第48-55页 |
| 3.2 讨论 | 第55-60页 |
| 3.2.1 山茶属植物转录组测序 | 第55-56页 |
| 3.2.2 分子标记鉴别 | 第56页 |
| 3.2.3 低温下基因的差异表达 | 第56-57页 |
| 3.2.4 潜在的耐低温相关的功能基因 | 第57-60页 |
| 第四章 主要结论及展望 | 第60-62页 |
| 4.1 本研究主要结论 | 第60-61页 |
| 4.2 展望 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 拟发表论文 | 第70页 |
