| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 中英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-46页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 SRC激酶蛋白家族简介 | 第13-21页 |
| 1.2.1 Src蛋白家族的结构和调节机制 | 第13-15页 |
| 1.2.2 Src激酶在肿瘤发生中的作用 | 第15-17页 |
| 1.2.3 Src多靶点激酶抑制剂的发展概况 | 第17-20页 |
| 1.2.4 Src激酶抑制剂理论研究进展 | 第20-21页 |
| 1.3 计算机辅助药物设计 | 第21-30页 |
| 1.3.1 三维定量构效关系（3D-QSAR） | 第22-25页 |
| 1.3.2 分子对接 | 第25-28页 |
| 1.3.3 分子动力学模拟 | 第28-30页 |
| 1.4 本文选题意义 | 第30-32页 |
| 参考文献 | 第32-46页 |
| 第二章 吲哚类SRC/IGF-1R双靶点激酶抑制剂的分子对接和分子动力学研究 | 第46-62页 |
| 2.1 引言 | 第46-47页 |
| 2.2 计算和实验方法 | 第47-49页 |
| 2.2.1 分子对接 | 第47页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第47-48页 |
| 2.2.3 结合自由能的计算 | 第48页 |
| 2.2.4 自由能的分解 | 第48-49页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第49-57页 |
| 2.3.1 对接结果 | 第49-52页 |
| 2.3.2 Src与IGF-1R激酶蛋白的结构比较 | 第52-53页 |
| 2.3.3 分子动力学模拟 | 第53-56页 |
| 2.3.4 结合自由能分析 | 第56-57页 |
| 2.4 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 第三章 嘌呤类衍生物对SRC/ABL激酶活性和非活性构象双重抑制作用的 3D-QSAR、分子对接和分子动力学研究 | 第62-98页 |
| 3.1 引言 | 第62-64页 |
| 3.2 计算和实验方法 | 第64-71页 |
| 3.2.1 数据集 | 第64-69页 |
| 3.2.2 分子对接 | 第69页 |
| 3.2.3 分子模型与叠加 | 第69页 |
| 3.2.4 CoMFA模型的构建 | 第69页 |
| 3.2.5 PLS分析和 3D-QSAR模型的验证 | 第69-70页 |
| 3.2.6 分子动力学模拟 | 第70页 |
| 3.2.7 结合自由能计算 | 第70-71页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第71-89页 |
| 3.3.1 分子对接 | 第71-75页 |
| 3.3.2 CoMFA统计结果分析 | 第75-80页 |
| 3.3.3 CoMFA等势图分析 | 第80-83页 |
| 3.3.4 分子动力学模拟 | 第83-87页 |
| 3.3.5 结合自由能分析 | 第87-89页 |
| 3.4 结论 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-98页 |
| 第四章 吡啶/喹唑啉类衍生物的 3D-QSAR、分子对接和分子动力学研究 | 第98-128页 |
| 4.1 引言 | 第98-99页 |
| 4.2 计算与研究方法 | 第99-109页 |
| 4.2.1 数据集 | 第99-107页 |
| 4.2.2 分子对接 | 第107页 |
| 4.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第107-108页 |
| 4.2.4 分子动力学模拟 | 第108页 |
| 4.2.5 结合自由能计算 | 第108-109页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第109-122页 |
| 4.3.1 寻找合适的对接位点 | 第109-114页 |
| 4.3.2 分子对接 | 第114-115页 |
| 4.3.3 CoMFA统计结果分析 | 第115-117页 |
| 4.3.4 CoMFA等势图分析 | 第117-118页 |
| 4.3.5 分子动力学模拟 | 第118-120页 |
| 4.3.6 结合自由能分析 | 第120-122页 |
| 4.4 结论 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-128页 |
| 第五章 总结与展望 | 第128-130页 |
| 5.1 总结 | 第128-129页 |
| 5.2 展望 | 第129-130页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第130-131页 |
| 致谢 | 第131页 |
