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中国弄蝶科分子系统学研究

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第16-52页
    1.1 分类地位第16-17页
    1.2 研究简史第17-21页
        1.2.1 世界弄蝶研究简史第17-19页
        1.2.2 中国弄蝶研究简史第19-21页
    1.3 弄蝶分类系统第21-33页
        1.3.1 Watson弄蝶科分类系统(1893)第21页
        1.3.2 Evans弄蝶科分类系统(1949)第21-22页
        1.3.3 Ackery弄蝶总科分类系统(1984)第22页
        1.3.4 Scott弄蝶总科系统发育与分类系统(1985)第22-23页
        1.3.5 Scott & Wright弄蝶总科系统发育与分类系统(1990)第23-24页
        1.3.6 Eliot马来半岛弄蝶科分类系统(1992)第24页
        1.3.7 Bridges弄蝶总科分类系统(1994)第24-25页
        1.3.8 周尧世界弄蝶总科Hesperoidea及中国弄蝶科分类系统(1994)第25-26页
        1.3.9 de Jong, Vane-Wright,Ackery弄蝶总科分类系统(1996)第26-27页
        1.3.10 袁锋,袁向群,薛国喜中国弄蝶分类系统(2008)第27-30页
        1.3.11 Dodo, Saigusa, Chiba 日本弄蝶总科分类系统(2008)第30页
        1.3.12 Warren, Ogawa, Brower 弄蝶总科分类系统(2008)第30-31页
        1.3.13 Warren, Ogawa, Brower 整合分子与形态数据的弄蝶科分类系统(2009)第31-33页
    1.4 形态特征与在分类中的应用第33-34页
        1.4.1 成虫的头部第33页
        1.4.2 成虫胸部第33页
        1.4.3 成虫的腹部第33-34页
        1.4.4 成虫的姿态第34页
        1.4.5 幼虫取食的植物第34页
        1.4.6 幼虫特征第34页
    1.5 分子生物学在昆虫分类中的应用第34-51页
        1.5.1 昆虫分子系统学研究概况第34-36页
        1.5.2 线粒体基因在蝶类分子系统学中的应用第36-44页
        1.5.3 核基因在蝶类分子系统学中的应用第44-47页
        1.5.4 多基因联合分析在蝶类分子系统学中的应用第47-49页
        1.5.5 系统发育树的构建方法第49-50页
        1.5.6 线粒体基因和核基因在弄蝶科系统发育中的应用第50-51页
        1.5.7 外群选择第51页
    1.6 研究思路、目的与意义第51-52页
第二章 基于线粒体Cyt b基因序列探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第52-89页
    2.1 材料第52-56页
        2.1.1 实验材料第52-56页
        2.1.2 标本的保存第56页
    2.2 主要试剂与仪器第56-57页
        2.2.1 引物与试剂第56-57页
        2.2.2 仪器第57页
    2.3 DNA 提取第57-58页
        2.3.1 基因组DNA 提取第57-58页
        2.3.2 DNA 检测第58页
    2.4 PCR 扩增条件优化及反应体系建立第58-63页
        2.4.1 PCR 扩增条件的优化第58-62页
        2.4.2 PCR 扩增体系的建立第62-63页
    2.5 克隆第63-64页
        2.5.1 目的DNA 片段的回收第63页
        2.5.2 DH 5α感受态细胞的制备第63页
        2.5.3 纯化后产物的扩增及pGEM-T easy载体连接第63-64页
        2.5.4 连接产物转化第64页
        2.5.5 蓝白斑筛选第64页
    2.6 测序第64-65页
    2.7 序列分析第65页
    2.8 弄蝶Cyt b基因组成及特征第65-75页
        2.8.1 序列组成第65-73页
        2.8.2 碱基序列饱和效应的检验第73-75页
        2.8.3 树长分布分析第75页
    2.9 系统发育树第75-84页
        2.9.1 MP 树第75-77页
        2.9.2 ML 树第77-81页
        2.9.3 贝叶斯树第81-84页
    2.10 三种方法所构建树的比较第84页
    2.11 结果分析第84-89页
        2.11.1 弄蝶科Hesperiidae的单系性第84-85页
        2.11.2 亚科与族级拓扑关系的分析第85-87页
        2.11.3 属级拓扑关系分析第87-88页
        2.11.4 种与亚种第88-89页
第三章 基于线粒体ND1基因序列探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第89-116页
    3.1 材料第89-92页
        3.1.1 实验材料第89-92页
        3.1.2 标本的保存第92页
    3.2 主要试剂与仪器第92页
        3.2.1 引物第92页
        3.2.2 仪器第92页
    3.3 DNA 提取第92-93页
    3.4 PCR 扩增条件优化及反应体系建立第93-94页
        3.4.1 PCR 扩增条件的优化第93页
        3.4.2 PCR 扩增体系的建立第93-94页
    3.5 目的片段测序第94页
    3.6 序列分析第94-95页
    3.7 ND1基因序列组成与特征第95-102页
        3.7.1 序列组成第95-101页
        3.7.2 碱基序列饱和效应的检验第101页
        3.7.3 树长分布分析第101-102页
    3.8 系统发育树第102-111页
        3.8.1 MP 树第102-104页
        3.8.2 ML 树第104-108页
        3.8.3 贝叶斯树第108-111页
    3.9 结果分析第111-116页
        3.9.1 弄蝶科Hesperiidae的单系性第111页
        3.9.2 亚科与族的拓扑结构分析第111-115页
        3.9.3 属级关系第115页
        3.9.4 种与亚种第115-116页
第四章 基于线粒体CO I基因序列探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第116-131页
    4.1 材料第116-118页
        4.1.1 实验材料第116-118页
        4.1.2 标本的保存第118页
    4.2 主要试剂与仪器第118页
        4.2.1 试剂第118页
    4.3 DNA 提取第118页
    4.4 PCR 扩增条件优化及反应体系建立第118-120页
        4.4.1 扩增条件的优化第118-119页
        4.4.2 PCR 扩增体系的建立第119-120页
    4.5 目的片段测序第120页
    4.6 序列分析第120页
    4.7 CO I基因序列组成与特征第120-124页
        4.7.1 序列组成第120-123页
        4.7.2 碱基序列饱和效应的检验第123-124页
        4.7.3 树长分布分析第124页
    4.8 系统发育树第124-129页
        4.8.1 MP 树第124页
        4.8.2 ML 树第124-128页
        4.8.3 贝叶斯树第128-129页
    4.9 结果分析第129-131页
        4.9.1 亚科与族第129-130页
        4.9.2 种第130-131页
第五章 基于线粒体16S rDNA基因序列探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第131-145页
    5.1 材料第131-133页
        5.1.1 实验材料第131-132页
        5.1.2 标本的保存第132-133页
    5.2 主要试剂与仪器第133页
        5.2.1 引物第133页
        5.2.2 主要试剂第133页
    5.3 DNA 提取第133页
    5.4 PCR 扩增条件优化及反应体系建立第133-135页
        5.4.1 PCR 扩增条件优化第133-134页
        5.4.2 PCR 扩增体系的建立第134-135页
    5.5 目的片段测序第135页
    5.6 序列分析第135页
    5.7 16S rDNA基因序列组成与特点第135-138页
        5.7.1 序列组成第135-137页
        5.7.2 碱基序列饱和效应的检验第137-138页
        5.7.3 树长分布分析第138页
    5.8 系统发育树第138-142页
        5.8.1 MP 树第138-139页
        5.8.2 ML 树第139-141页
        5.8.3 贝叶斯树第141-142页
    5.9 系统发育分析第142-145页
        5.9.1 弄蝶科Hesperiidae的单系性第142页
        5.9.2 亚科与族的拓扑结构分析第142-144页
        5.9.3 属级关系第144页
        5.9.4 种与亚种第144-145页
第六章 基于线粒体Cyt b和ND1基因序列联合探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第145-158页
    6.1 实验材料第145-147页
    6.2 序列分析第147-148页
    6.3 Cyt b和ND1基因联合序列组成与特点第148-151页
        6.3.1 序列组成第148-150页
        6.3.2 碱基序列饱和效应的检验第150-151页
        6.3.3 树长分布分析第151页
    6.4 系统发育树第151-155页
        6.4.1 MP 树第151-152页
        6.4.2 ML 树第152-155页
    6.5 贝叶斯树第155-156页
    6.6 系统发育分析第156-158页
        6.6.1 弄蝶科Hesperiidae的单系性第156页
        6.6.2 亚科与族的拓扑结构分析第156-157页
        6.6.3 属级关系第157页
        6.6.4 种第157-158页
第七章 基于线粒体Cyt b,ND1和CO I三个基因序列联合探讨中国弄蝶科主要分类单元的系统发育关系第158-167页
    7.1 材料第158-159页
        7.1.1 实验材料第158-159页
    7.2 序列分析第159页
    7.3 Cyt b,ND1 和CO I基因联合序列组成与结果分析第159-161页
        7.3.1 序列组成第159-160页
        7.3.2 碱基序列饱和效应的检验第160-161页
        7.3.3 树长分布分析第161页
    7.4 系统发育树第161-165页
        7.4.1 MP 树第161-162页
        7.4.2 ML 树第162-164页
        7.4.3 贝叶斯树第164-165页
    7.5 结果分析第165-167页
        7.5.1 弄蝶科Hesperiidae的单系性第165页
        7.5.2 亚科与族级拓扑关系的分析第165-167页
第八章 讨论与结论第167-177页
    8.1 讨论第167-175页
    8.2 以后需要解决的问题第175页
    8.3 结论第175-176页
    8.4 创新点第176-177页
参考文献第177-194页
附录第194-289页
致谢第289-290页
作者简介第290页

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