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金水丝羽乌骨鸡资源群体的构建和三个基因的SNPs检测及其与羽色性状的连锁分析

中文摘要第7-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略词表第10-11页
1 前言第11-26页
    1.1 研究问题的由来第11页
    1.2 文献综述第11-25页
        1.2.1 金水乌鸡简介第11-12页
        1.2.2 鸡基因组研究现状第12-13页
        1.2.3 鸡羽色形成的生物学基础第13-25页
    1.3 本研究的目的和意义第25-26页
2 材料与方法第26-34页
    2.1 实验材料第26-29页
        2.1.1 资源群体构建方案第26页
        2.1.2 实验群体第26-27页
        2.1.3 实验性状观测指标记录第27页
        2.1.4 实验样品第27页
        2.1.5 培养基、酶及试剂盒第27页
        2.1.6 主要试剂及配制第27-28页
        2.1.7 主要仪器设备第28-29页
        2.1.8 主要分子生物学软件及常用网站第29页
    2.2 实验方法第29-32页
        2.2.1 资源群体亲本的组建第29-30页
        2.2.2 PCR扩增引物设计第30页
        2.2.3 PCR扩增条件第30-31页
        2.2.4 PCR产物的纯化和测序第31-32页
        2.2.5 羽色相关基因的连锁分析第32页
    2.3 本研究的总体方案第32-34页
3 结果第34-46页
    3.1 建立金水乌鸡群体的结果第34-36页
        3.1.1 资源群体的建立及说明第34-35页
        3.1.3 本群体羽色遗传规律分析第35-36页
    3.2 候选基因MC1R和EDNRB2的遗传变异检测第36-39页
        3.2.1 鸡MC1R基因的SNP扫描结果第36-37页
        3.2.2 鸡EDNRB2基因的SNP扫描结果第37-39页
    3.3 候选基因MC1R和EDNRB2突变位点与羽色性状的关联分析第39-44页
        3.3.1 鸡MC1R基因EDNRB2基因两个位点与羽色性状的关联分析第39-40页
        3.3.2 Pearson检验分析羽色性状和基因型的关系第40-43页
        3.3.3 鸡EDNRB2基因SNP与羽色连锁分析第43页
        3.3.4 鸡EDNRB2基因的单倍型分析第43-44页
    3.4 TYR基因第四内含子有DNA片段插入的检测第44-46页
        3.4.1 TYR基因第四内含子插入片段结构特点及引物设计第44-45页
        3.4.2 TYR基因第四内含子上引物扩增的结果第45-46页
4 讨论第46-48页
    4.1 关于资源群体的构建第46页
    4.2 关于羽色性状的遗传分析第46-47页
    4.3 关于鸡的MLPH和ASIP基因第47页
    4.4 关于EDNRB2基因检测结果的讨论第47-48页
    4.5 关于鸡TYR基因与隐性白羽间的关系第48页
5 小结第48-50页
    5.1 本研究的主要结果与结论第48-49页
    5.2 本研究的创新点与特色第49页
    5.3 本研究不足之处与进一步工作的建议第49-50页
参考文献第50-57页
附录第57-63页
致谢第63页

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