| 摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 上篇 文献综述 | 第10-27页 |
| 第一章 伯克氏菌属概述 | 第11-15页 |
| 1 植物病原细菌概述 | 第11页 |
| 2 伯克氏菌属概述 | 第11-15页 |
| 2.1 伯克氏菌属病原菌分类现状 | 第11-12页 |
| 2.2 伯克氏菌属的三种检疫性病原菌描述 | 第12-15页 |
| 2.2.1 香石竹细菌性萎蔫病菌 | 第12页 |
| 2.2.2 洋葱腐烂病菌 | 第12-13页 |
| 2.2.3 水稻细菌性谷枯病菌 | 第13-15页 |
| 第二章 植物病原细菌的检测及鉴定方法 | 第15-21页 |
| 1 传统细菌检测技术 | 第15-17页 |
| 1.1 症状观察及显微镜观察 | 第15页 |
| 1.2 分离培养 | 第15-16页 |
| 1.3 细菌染色技术 | 第16页 |
| 1.4 致病性测定 | 第16页 |
| 1.5 生理生化测定 | 第16-17页 |
| 1.5.1 生化测定试剂盒(Kits) | 第16-17页 |
| 1.5.2 Biolog测定 | 第17页 |
| 1.5.3 甲基脂肪酸气相色谱分析法 | 第17页 |
| 2 分子检测技术 | 第17-21页 |
| 2.1 传统PCR技术 | 第17-18页 |
| 2.2 实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR) | 第18页 |
| 2.3 免疫PCR(Immuno-PCR) | 第18-19页 |
| 2.4 巢式PCR(Nested-PCR) | 第19页 |
| 2.5 多重PCR(multiple-PCR) | 第19-21页 |
| 第三章 DNA条形码技术在植物病原细菌检测中的应用 | 第21-27页 |
| 1 DNA条形码基因 | 第21-24页 |
| 1.1 16S rRNA基因 | 第21-22页 |
| 1.2 gyrB基因 | 第22页 |
| 1.3 cpn60基因 | 第22-23页 |
| 1.4 rpoD基因 | 第23页 |
| 1.5 DNA条形码基因小结 | 第23-24页 |
| 2 DNA条形码数据库 | 第24-27页 |
| 2.1 BOLD数据库 | 第24页 |
| 2.2 16S rRNA数据库 | 第24-25页 |
| 2.3 欧盟检疫性有害生物DNA条形码数据库 | 第25页 |
| 2.4 CPN60数据库 | 第25-26页 |
| 2.5 中国检疫性有害生物DNA条形码检测数据库[79] | 第26页 |
| 2.6 DNA条形码数据库小结 | 第26-27页 |
| 下篇 研究内容 | 第27-59页 |
| 第一章 伯克氏菌属DNA条形码基因筛选与评价 | 第29-45页 |
| 1 材料与方法 | 第30-34页 |
| 1.1 试验材料与仪器 | 第30-32页 |
| 1.1.1 试验材料 | 第30-32页 |
| 1.1.2 仪器 | 第32页 |
| 1.2 试验方法 | 第32-34页 |
| 1.2.1 DNA的提取 | 第32页 |
| 1.2.2 PCR扩增及测序 | 第32-33页 |
| 1.2.3 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第33-34页 |
| 1.2.4 测序比对 | 第34页 |
| 1.2.5 数据处理 | 第34页 |
| 2 结果与分析 | 第34-41页 |
| 2.1 序列分析及PCR扩增效率、测序成功率评价 | 第34-35页 |
| 2.2 遗传距离分析 | 第35-36页 |
| 2.3 DNA barcoding gap分析 | 第36页 |
| 2.4 Neighbor-Joining Tree(NJ)分析 | 第36-41页 |
| 2.4.1 16S rRNA基因NJ树分析 | 第37页 |
| 2.4.2 rpoD基因NJ树分析 | 第37页 |
| 2.4.3 gyrB基因NJ树分析 | 第37-41页 |
| 3 总结与讨论 | 第41-45页 |
| 第二章 进境万代兰唐菖蒲伯克氏菌的分离鉴定及生物学研究 | 第45-59页 |
| 1 材料与方法 | 第45-50页 |
| 1.1 试验材料与仪器 | 第45-46页 |
| 1.1.1 试验材料 | 第45-46页 |
| 1.1.2 试验仪器 | 第46页 |
| 1.2 试验方法 | 第46-50页 |
| 1.2.1 病原菌的分离和纯培养 | 第46页 |
| 1.2.2 LOPAT测定 | 第46-47页 |
| 1.2.3 BIOLOG鉴定 | 第47-48页 |
| 1.2.4 致病性测定 | 第48页 |
| 1.2.5 PCR检测 | 第48-50页 |
| 2 结果与分析 | 第50-56页 |
| 2.1 LOPAT测定结果 | 第50页 |
| 2.2 BIOLOG鉴定结果 | 第50-51页 |
| 2.3 致病性测定结果 | 第51-52页 |
| 2.3.1 洋葱接种试验 | 第51页 |
| 2.3.2 石斛兰接种实验 | 第51-52页 |
| 2.4 Neighbor-Joining Tree (NJ)分析 | 第52-56页 |
| 2.4.1 16S rRNA基因NJ树分析 | 第52页 |
| 2.4.2 rpoD基因NJ树分析 | 第52页 |
| 2.4.3 gyrB基因NJ树分析 | 第52-56页 |
| 3 结论与讨论 | 第56-59页 |
| 全文展望与总结 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
