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基于pufM基因的乌梁素海好氧不产氧光合细菌系统发育多样性分析

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
1 前言第7-16页
   ·好氧不产氧光合细菌第7-11页
     ·AAPB 的生理与生化特性第7-9页
     ·AAPB 的起源、系统发育与分类第9-11页
     ·AAPB 的生态分布以及生态功能第11页
   ·微生物多样性的研究方法第11-15页
     ·非分子生物学方法第11-12页
     ·分子生物学方法第12-15页
   ·研究目的、意义及内容第15-16页
2 材料与方法第16-24页
   ·材料第16-19页
     ·样品采集与处理第16页
     ·主要试剂与试剂盒第16页
     ·主要仪器第16-17页
     ·引物第17页
     ·序列分析工具和软件第17页
     ·培养基配方第17-18页
     ·主要溶液第18-19页
   ·实验方法第19-24页
     ·环境参数的测定第19页
     ·样品总DNA 的提取第19-21页
     ·构建pufM 克隆文库的PCR 反应第21页
     ·PCR 产物回收第21-22页
     ·连接反应第22页
     ·感受态细胞的制备第22-23页
     ·连接产物的转化第23页
     ·阳性克隆子鉴定第23页
     ·测序与系统发育分析第23-24页
     ·多样性指数分析第24页
3 结果与分析第24-39页
   ·乌梁素海环境参数第24-25页
   ·环境样品 DNA(水体和沉积物)的提取第25-26页
   ·pufM 序列扩增第26页
   ·pufM 克隆文库的构建和分析第26页
   ·多样性指数分析及文库间相似性分析第26-29页
     ·多样性指数分析第26-27页
     ·文库间相似性分析第27-29页
   ·乌梁素海 AAPB 系统发育多样性分析第29-39页
     ·7 月 HGB 位点水体(07-H-W)AAPB 系统发育多样性分析第29-30页
     ·7 月 XK 位点水体(07-X-W)AAPB 系统发育多样性分析第30-31页
     ·7 月 HGB 位点沉积物(07-H-S)AAPB 系统发育多样性分析第31-33页
     ·7 月 XK 位点沉积物(07-X-S)AAPB 系统发育多样性分析第33-34页
     ·11 月 HGB 位点水体(11-H-W)AAPB 系统发育多样性分析第34-35页
     ·11 月 XK 位点水体(11-X-W)AAPB 系统发育多样性分析第35-36页
     ·11 月 HGB 位点沉积物(11-H-S)AAPB 系统发育多样性分析第36-38页
     ·11 月 XK 位点沉积物(11-X-S)AAPB 系统发育多样性分析第38-39页
4 结论与讨论第39-43页
   ·乌梁素海 AAPB 多样性及其与环境的关系第39-40页
   ·乌梁素海 AAPB 类群及其与环境的关系第40-42页
   ·结论第42-43页
致谢第43-44页
参考文献第44-49页
附录第49-57页
作者简介第57页

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