| 中文摘要 | 第2-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一部分 胃癌细胞系AGS感染EB病毒前后转录组测序分析研究 | 第11-60页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 引言 | 第15-18页 |
| 第一章 材料与方法 | 第18-27页 |
| 1.1 仪器、试剂和耗材 | 第18-19页 |
| 1.2 细胞处理 | 第19页 |
| 1.3 RNA测序数据的生成 | 第19-24页 |
| 1.4 RNA测序数据拼接处理 | 第24-27页 |
| 第二章 结果 | 第27-44页 |
| 2.1 样本采集与分组信息 | 第27页 |
| 2.2 测序数据预处理结果 | 第27-28页 |
| 2.3 与参考基因组比对结果 | 第28-29页 |
| 2.4 组间总m RNA和差异m RNA分析 | 第29页 |
| 2.5 基因表达水平分析 | 第29-32页 |
| 2.6 差异m RNA基因GO富集分析 | 第32-35页 |
| 2.7 差异m RNA基因KEGG富集分析 | 第35-38页 |
| 2.8 单核苷酸多态性与插入缺失分析 | 第38-41页 |
| 2.9 可变剪切分析 | 第41-43页 |
| 2.10 EBV表达基因分析 | 第43-44页 |
| 第三章 讨论 | 第44-53页 |
| 研究结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 第二部分EBVa GC组织中差异表达基因及基因多态性的研究 | 第60-105页 |
| 中文摘要 | 第60-62页 |
| 英文摘要 | 第62-64页 |
| 引言 | 第64-66页 |
| 第一章 材料与方法 | 第66-78页 |
| 1.1 仪器、试剂和耗材 | 第66-67页 |
| 1.2 标本采集 | 第67页 |
| 1.3 免疫组化检测REG4表达 | 第67-68页 |
| 1.4 细胞系及新鲜胃癌组织DNA提取 | 第68-69页 |
| 1.5 石蜡包埋胃癌组织DNA提取 | 第69-70页 |
| 1.6 原位杂交筛选EBV阳性胃癌标本 | 第70-71页 |
| 1.7 胃癌细胞系RNA提取及q RT-PCR | 第71-74页 |
| 1.8 基因多态性分析 | 第74-76页 |
| 1.9 统计学分析 | 第76-78页 |
| 第二章 结果 | 第78-93页 |
| 2.1 差异表达基因的验证 | 第78页 |
| 2.2 REG4蛋白在EBVa GC和EBVn GC肿瘤中的表达 | 第78-79页 |
| 2.3 基因多态性在EBVa GC和EBVn GC中的分布 | 第79-93页 |
| 第三章 讨论 | 第93-99页 |
| 3.1 EBV感染后的差异表达基因 | 第93-95页 |
| 3.2 基因多态性在EBVn GC和EBVa GC的分布 | 第95-99页 |
| 研究结论 | 第99-100页 |
| 参考文献 | 第100-105页 |
| 附：英文缩写词索引 | 第105-107页 |
| 综述 | 第107-119页 |
| 综述参考文献 | 第115-119页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第119-120页 |
| 致谢 | 第120-121页 |
