稳态附近细胞表型转换级联中的噪声及噪声传播
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 表型转换的生物学概念及研究进展 | 第12-24页 |
| 1.1 表型转换的生物学概念 | 第12-22页 |
| 1.1.1 表型与基因型 | 第12-13页 |
| 1.1.2 表型可塑性 | 第13-17页 |
| 1.1.3 表型转换 | 第17-22页 |
| 1.2 论文的主要内容及安排 | 第22-24页 |
| 第二章 表型转换的随机动力学研究方法 | 第24-38页 |
| 2.1 表型转换的随机理论研究方法 | 第24-33页 |
| 2.1.1 主方程 | 第24-26页 |
| 2.1.2 Fokker-Planck方程 | 第26-27页 |
| 2.1.3 Langevin方法 | 第27-29页 |
| 2.1.4 线性噪声近似 | 第29-31页 |
| 2.1.5 Langevin理论 | 第31-33页 |
| 2.2 表型转换的数值模拟方法 | 第33-34页 |
| 2.2.1 Gellespie算法 | 第33-34页 |
| 2.2.2 τ跳跃算法 | 第34页 |
| 2.3 表型转换的实验研究方法 | 第34-38页 |
| 2.3.1 表型与环境 | 第35页 |
| 2.3.2 表型与基因型 | 第35-37页 |
| 2.3.3 基因型与环境 | 第37-38页 |
| 第三章 结肠隐窝中细胞种群的涨落 | 第38-56页 |
| 3.1 引言 | 第38-41页 |
| 3.2 结肠隐窝中细胞种群的随机模型 | 第41-45页 |
| 3.3 结肠隐窝中细胞种群的涨落 | 第45-49页 |
| 3.4 净生长速率对种群涨落的影响 | 第49-52页 |
| 3.4.1 净生长速率对Fano因子的影响 | 第49-50页 |
| 3.4.2 净生长速率对协方差的影响 | 第50-51页 |
| 3.4.3 净生长速率对敏感性的影响 | 第51-52页 |
| 3.5 总结与讨论 | 第52-56页 |
| 3.5.1 几种方法的比较 | 第53-54页 |
| 3.5.2 论结果与生物学数据 | 第54-55页 |
| 3.5.3 论结果的生物学意义 | 第55-56页 |
| 第四章 表型转换级联在平衡点的噪声传播 | 第56-80页 |
| 4.1 引言 | 第56-57页 |
| 4.2 表型转换级联的一般模型 | 第57-60页 |
| 4.3 表型转换级联中的噪声传播公式 | 第60-62页 |
| 4.4 向表型转换级联中的噪声传播 | 第62-69页 |
| 4.4.1 模型以及稳态菌落数 | 第62-63页 |
| 4.4.2 两菌落内的涨落 | 第63-64页 |
| 4.4.3 对数增益 | 第64页 |
| 4.4.4 两菌落中的噪声传播 | 第64-66页 |
| 4.4.5 最大生长速率g_1对两菌落的影响 | 第66-68页 |
| 4.4.6 固有转换速率s_1对两菌落的影响 | 第68-69页 |
| 4.5 单向表型转换级联中的噪声传播 | 第69-78页 |
| 4.5.1 模型以及稳态种群数目 | 第69-71页 |
| 4.5.2 三种表型中的涨落 | 第71-72页 |
| 4.5.3 对数增益 | 第72-73页 |
| 4.5.4 三表型中的噪声传播 | 第73-75页 |
| 4.5.5 固有转换速率s_1对三表型的影响 | 第75-76页 |
| 4.5.6 最大生长速率g_1对三表型的影响 | 第76-78页 |
| 4.6 总结与讨论 | 第78-80页 |
| 第五章 结论与展望 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-96页 |
| 在校期间发表的论文 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
