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三种鳜类线粒体基因组的克隆及其系统进化分析

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
目录第8-10页
第1章 引言第10-17页
 1 三种鳜鱼的生物学多样性第10-12页
   ·形态学与食性及生长特性分析第10-11页
   ·三种鳜鱼的地理分布与生境多样性第11-12页
   ·鳜类的遗传多样性第12页
 2 鱼类线粒体DNA的研究进展第12-17页
   ·线粒体结构的研究进展第12-15页
     ·线粒体基因组的结构组成第12-13页
     ·鱼类线粒体的分布与编码与特征第13页
     ·鱼类线粒体tRNA的分布与编码特征第13页
     ·鱼类线粒体DNA非编码区的研究进展第13-15页
   ·线粒体应用及有待解决的问题第15-17页
     ·鱼类mtDNA多态性第15页
     ·在鱼类系统学中的应用第15-16页
     ·在鱼类分子群体遗传学中的应用第16-17页
第2章 翘嘴鳜基因组全序列的克隆和结构特征分析第17-32页
 1 材料与方法第17-20页
   ·实验材料、试剂及仪器第17页
   ·Total DNA的提取第17-18页
   ·引物设计和PCR扩增第18-19页
   ·PCR扩增产物的检测第19页
   ·扩增片段的回收纯化第19-20页
   ·线粒体DNA片段的序列测定第20页
   ·全序列的确定,测序拼接与分析第20页
 2 结果与分析第20-30页
   ·翘嘴鳜线粒体全序列拼接与结果鉴定第20页
   ·翘嘴鳜全序列结构分析第20-24页
   ·起始与终止密码子分析第24-26页
   ·氨基酸利用率比较分析第26页
   ·鳜鱼线粒体密码子偏好性分析第26-27页
   ·翘嘴鳜线粒体控制区和rRNA基因分析第27-29页
   ·鳜鱼线粒体的酶切分析第29-30页
 3 讨论第30-31页
   ·鳜鱼线粒体DNA编码基因的特点第30页
   ·鳜鱼线粒体基因组tRNA的结构特征第30-31页
   ·翘嘴鳜线粒体基因组控制区与rRNA基因结构特点第31页
 4 小结第31-32页
第3章 三种鳜类鱼类的线粒体基因组比较分析第32-43页
 1 材料与方法第32-33页
   ·实验材料、试剂及仪器第32-33页
     ·DNA的提取第32-33页
     ·实验方法与实验流程第33页
 2 结果与分析第33-39页
   ·基因结构特征分析第33页
   ·三种鳜鱼13个编码蛋白基因的比较分析第33-35页
   ·三种鳜鱼线粒体密码子偏好性分析第35页
   ·氨基酸利用率比较分析第35-36页
   ·三种鳜类鱼类线粒体基因组限制性酶切分析第36-37页
   ·三种鳜类鱼类编码蛋白的相似性比较分析第37-38页
   ·三种鳜鱼的tRNA差异性比较分析第38-39页
   ·非编码区的比较分析第39页
 3 讨论第39-41页
   ·关于线粒体基因组序列测定的方法探讨第39-40页
   ·线粒体的基因组成分析第40-41页
   ·线粒体密码子的通用性分析第41页
 4 小结第41-43页
第4章 鳜类线粒体编码基因的适用性及其多态性分析第43-53页
 1 材料与方法第43-45页
   ·数据的获得与分类第43页
   ·系统发生的分析与评价方法第43-45页
 2 结果与分析第45-50页
   ·序列长度和遗传距离的分析结果第45页
   ·13个编码蛋白基因拼接序列构建的N-J进化树分析第45-47页
   ·各编码蛋白基因核苷酸序列构建的N-J进化树第47-48页
   ·各单基因系统进化的适用性整体评价第48-49页
   ·三种鳜鱼线粒体CYTB基因变异比较性分析第49-50页
 3 讨论第50-52页
   ·高级分类阶元系统进化分析的mtDNA基因选择第50-51页
   ·三种鳜类鱼类变异位点的特征第51-52页
 4 小结第52-53页
全文总结第53-54页
参考文献第54-62页
附录第62-94页
读硕期间发表的论文和参与的专利第94-95页
致谢第95-97页

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