| 摘要 | 第7-9页 |
| abstract | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第11-25页 |
| 1.1 阿尔茨海默病 | 第11-16页 |
| 1.1.1 AD疾病的发病机理 | 第11页 |
| 1.1.2 Aβ肽 | 第11-13页 |
| 1.1.3 Aβ肽的结构和研究现状 | 第13-16页 |
| 1.2 单壁碳纳米管 | 第16-18页 |
| 1.3 分子动力学 | 第18-22页 |
| 1.3.1 GROMACS软件包 | 第19页 |
| 1.3.2 GROMACS模拟流程 | 第19-21页 |
| 1.3.3 力场选择以及REMD方法 | 第21-22页 |
| 1.4 研究目的 | 第22-25页 |
| 第二章 实验方案设计与研究方法 | 第25-29页 |
| 2.1 模型的选取 | 第25-26页 |
| 2.2 软件及模拟方法的选择 | 第26-29页 |
| 第三章 质子化作用对人类Aβ_(1-16)单体结构特征和聚集机理的影响 | 第29-37页 |
| 3.1 人类Aβ_(1-16)肽段单体初始结构 | 第29-30页 |
| 3.2 人类Aβ_(1-16)肽段单体的RMSD变化 | 第30-31页 |
| 3.3 人类Aβ_(1-16)肽段单体的二级结构分配图 | 第31-32页 |
| 3.4 人类Aβ_(1-16)肽段单体中H键的贡献以及对结构的影响 | 第32-33页 |
| 3.5 人类Aβ_(1-16)肽段单体结构变化的自由能面图 | 第33-34页 |
| 3.6 本章小结 | 第34-37页 |
| 第四章 质子化作用对啮齿类Aβ_(1-16)单体结构特征和聚集机理的影响 | 第37-45页 |
| 4.1 啮齿类Aβ_(1-16)肽段单体初始结构选择 | 第37-38页 |
| 4.2 啮齿类Aβ_(1-16)肽段单体的RMSD变化 | 第38-40页 |
| 4.3 啮齿类Aβ_(1-16)肽段单体二级结构分配图 | 第40-41页 |
| 4.4 啮齿类Aβ_(1-16)肽段单体的自由能面图 | 第41-43页 |
| 4.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第五章 质子化对啮齿类Aβ_(1-16)二聚体结构的影响 | 第45-53页 |
| 5.1 啮齿类Aβ_(1-16)肽段二聚体的初始结构 | 第45-46页 |
| 5.2 啮齿类Aβ_(1-16)肽段二聚体的结构变化 | 第46-47页 |
| 5.3 啮齿类Aβ_(1-16)肽段二聚体的RMSD以及Rg | 第47-48页 |
| 5.4 啮齿类Aβ_(1-16)肽段二聚体的聚类分析 | 第48-52页 |
| 5.5 本章小结 | 第52-53页 |
| 第六章 SWCNT对Aβ_(17-42)肽段的影响的初步探索 | 第53-63页 |
| 6.1 SWCNT的建立以及初始结构 | 第53-54页 |
| 6.2 Aβ_(17-42)肽在单壁碳纳米管表面的吸附 | 第54-55页 |
| 6.3 肽段与SWCNT的接触面积 | 第55-56页 |
| 6.4 体系中疏水残基的RMSD变化 | 第56-59页 |
| 6.5 体系中肽段的结构行为 | 第59-60页 |
| 6.6 本章小结 | 第60-63页 |
| 第七章 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 附录 | 第75页 |
