| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 引言 | 第9-13页 |
| 1 综述 | 第13-21页 |
| 1.1 鸟类分子系统学及鸻形目鸟类研究现状 | 第13-18页 |
| 1.1.1 鸟类分子系统学研究概况 | 第13-15页 |
| 1.1.2 鸻形目鸟类分类概况及其存在的争议 | 第15-16页 |
| 1.1.3 鸻形目鸟类系统学研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2 C-mos 基因在鸟类系统发生研究当中的应用 | 第18-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-27页 |
| 2.1 样品采集 | 第21-24页 |
| 2.2 总 DNA 的提取和检测 | 第24-25页 |
| 2.2.1 主要仪器设备 | 第24页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.2.3 羽毛DNA 提取流程 | 第24-25页 |
| 2.2.4 纯度检验及浓度计算 | 第25页 |
| 2.2.5 凝胶电泳检验DNA 片段 | 第25页 |
| 2.3 PCR 扩增及检测 | 第25-27页 |
| 2.3.1 引物的设计与合成 | 第25页 |
| 2.3.2 PCR 反应体系 | 第25页 |
| 2.3.3 PCR 反应条件 | 第25-26页 |
| 2.3.4 琼脂糖凝胶电泳和目的片段回收 | 第26页 |
| 2.3.5 序列测定 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-51页 |
| 3.1 DNA 提取结果 | 第27页 |
| 3.2 PCR 扩增结果 | 第27-28页 |
| 3.3 DNA 测序结果 | 第28页 |
| 3.4 序列分析 | 第28-39页 |
| 3.4.1 分析软件 | 第28页 |
| 3.4.2 序列检验 | 第28页 |
| 3.4.3 C-mos 基因序列分析 | 第28-39页 |
| 3.5 系统树的构建 | 第39-48页 |
| 3.5.1 距离法 | 第39-41页 |
| 3.5.2 最大简约法 | 第41-46页 |
| 3.5.3 最大似然法 | 第46页 |
| 3.5.4 贝叶斯推断法 | 第46-48页 |
| 3.6 不同建树方法的比较 | 第48-49页 |
| 3.6.1 假设依据 | 第48页 |
| 3.6.2 计算时间 | 第48页 |
| 3.6.3 估计一致性（consistency） | 第48-49页 |
| 3.7 建树方法选择 | 第49页 |
| 3.8 系统树置信度检验 | 第49-51页 |
| 3.8.1 重抽样技术 | 第49-50页 |
| 3.8.2 分析性方法 | 第50页 |
| 3.8.3 数据随机化方法 | 第50页 |
| 3.8.4 相对支持方法 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-59页 |
| 4.1 C-mos 作为鸟类高级阶元系统发生工具的可行性 | 第51页 |
| 4.2 鸻形目28 种鸟类的系统关系 | 第51-52页 |
| 4.3 科级系统关系 | 第52-53页 |
| 4.4 科下系统关系 | 第53-55页 |
| 4.5 分子钟与类群分歧时间 | 第55页 |
| 4.6 本实验尚待改进之处 | 第55-59页 |
| 5 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
| 攻读学位期间科研成果 | 第69页 |