| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩写、符号清单、术语表 | 第15-18页 |
| 1. 引言 | 第18-42页 |
| 1.1. 土壤中的多环芳烃 | 第18-23页 |
| 1.1.1. 土壤中PAHs污染的国内外现状 | 第19-21页 |
| 1.1.2. 土壤PAHs污染来源 | 第21-22页 |
| 1.1.3. PAHs污染对土壤微生物的影响 | 第22-23页 |
| 1.2. PAHS污染土壤修复国内外研究进展 | 第23-28页 |
| 1.2.1. 物理修复技术 | 第23-24页 |
| 1.2.2. 化学修复技术 | 第24-25页 |
| 1.2.3. 生物修复技术 | 第25-27页 |
| 1.2.4. 不同修复技术比较 | 第27-28页 |
| 1.3. PAHS微生物降解途径及其机制 | 第28-40页 |
| 1.3.1. PAHs微生物降解途径 | 第28-33页 |
| 1.3.2. PAHs细菌降解机制 | 第33-40页 |
| 1.4. 论文研究目标、内容和技术路线 | 第40-42页 |
| 1.4.1. 研究目标 | 第40页 |
| 1.4.2. 研究内容 | 第40-41页 |
| 1.4.3. 技术路线 | 第41-42页 |
| 2. Mussilia sp.WG5和WX5菌株的分离及其生理生化分子特性 | 第42-64页 |
| 2.1. 材料与方法 | 第42-46页 |
| 2.1.1. 实验材料 | 第42-43页 |
| 2.1.2. 实验方法 | 第43-46页 |
| 2.2. 结果与讨论 | 第46-63页 |
| 2.2.1. Massilia sp. WF1菌株基因组 | 第46-48页 |
| 2.2.2. Massilia sp. WG5和WX5的分离、纯化和鉴定 | 第48-49页 |
| 2.2.3. Massilia sp. WG5菌株基因组 | 第49-52页 |
| 2.2.4. Massilia sp. WG5菌株基因组甲基化 | 第52-53页 |
| 2.2.5. Massilia sp. WX5菌株基因组 | 第53-55页 |
| 2.2.6. Massilia sp. WX5菌株基因组甲基化 | 第55-60页 |
| 2.2.7. Massilia spp.比较基因组 | 第60-63页 |
| 2.3. 小结 | 第63-64页 |
| 3. Massilia sp. WG5和WX5菌株菲降解特性及其降解机制 | 第64-82页 |
| 3.1. 材料与方法 | 第64-67页 |
| 3.1.1. 实验材料 | 第64-65页 |
| 3.1.2. 实验方法 | 第65-67页 |
| 3.2. 结果与讨论 | 第67-80页 |
| 3.2.1. 菲降解速率测定 | 第67-68页 |
| 3.2.2. 菲降解产物分离测定 | 第68-72页 |
| 3.2.3. 菲降解产物直接测定 | 第72-74页 |
| 3.2.4. 菲降解基因和降解途径推断 | 第74-80页 |
| 3.3. 小结 | 第80-82页 |
| 4. Massilia sp.WG5菌株转录组分析和PHE降解途径验证 | 第82-100页 |
| 4.1. 材料与方法 | 第82-84页 |
| 4.1.1. 实验材料 | 第82-83页 |
| 4.1.2. 实验方法 | 第83-84页 |
| 4.2. 结果与讨论 | 第84-99页 |
| 4.2.1. 测序数据优化结果及质量评估 | 第84-86页 |
| 4.2.2. 基因表达定量分析 | 第86-87页 |
| 4.2.3. 差异表达基因分析 | 第87-90页 |
| 4.2.4. WG5菌株PHE降解通路表达差异分析 | 第90-99页 |
| 4.3. 小结 | 第99-100页 |
| 5. Massilia sp.WG5菌株在PHE污染土壤中的修复应用 | 第100-128页 |
| 5.1. 材料与方法 | 第100-106页 |
| 5.1.1. 实验材料 | 第100-101页 |
| 5.1.2. 实验方法 | 第101-106页 |
| 5.2. 结果与讨论 | 第106-127页 |
| 5.2.1. 土壤中PHE的残留 | 第106-107页 |
| 5.2.2. iHAAQ方法建立 | 第107-112页 |
| 5.2.3. PHE污染土壤中的细菌群落结构动态 | 第112-127页 |
| 5.3. 小结 | 第127-128页 |
| 6. 研究结论、创新点、不足之处及展望 | 第128-132页 |
| 6.1. 研究结论 | 第128-130页 |
| 6.1.1. Massilia sp. WG5和WX5菌株的分离及其生理生化分子特性 | 第128页 |
| 6.1.2. Massilia sp. WG5和WX5菌株菲降解特性及其降解机制 | 第128-129页 |
| 6.1.3. Massilia sp. WG5菌株转录组分析和PHE降解途径验证 | 第129页 |
| 6.1.4. Massilia sp. WG5菌株在PHE污染土壤中的修复应用 | 第129-130页 |
| 6.2. 创新点 | 第130页 |
| 6.3. 不足与展望 | 第130-132页 |
| 参考文献 | 第132-144页 |
| 附表 | 第144-146页 |
| 作者简介 | 第146-147页 |
