| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-42页 |
| 1.1 植物体细胞再生研究进展 | 第14-20页 |
| 1.1.1 植物体细胞再生简介 | 第14页 |
| 1.1.2 植物再生的分子机制 | 第14-19页 |
| 1.1.3 棉花体细胞胚胎发生研究进展 | 第19-20页 |
| 1.2 植物microRNAs的研究进展 | 第20-36页 |
| 1.2.1 植物miRNAs的动态合成 | 第20-26页 |
| 1.2.2 植物miRNAs的调控机理 | 第26-28页 |
| 1.2.3 MIR基因的进化 | 第28-29页 |
| 1.2.4 植物miRNAs的生物学功能 | 第29-35页 |
| 1.2.5 植物小RNA及其靶标的研究方法 | 第35-36页 |
| 1.3 miR156及其靶标基因功能研究进展 | 第36-41页 |
| 1.3.1 miR156/SPLs调控发育转换和开花 | 第37-38页 |
| 1.3.2 miR156/SPLs调控生殖器官和果实发育，以及谷物产量 | 第38-39页 |
| 1.3.3 miR156/SPLs调控叶片异质性 | 第39页 |
| 1.3.4 miR156/SPLs调控表皮毛和侧根发生 | 第39-40页 |
| 1.3.5 miR156/SPLs参与调控次级代谢物的生物合成和逆境响应 | 第40页 |
| 1.3.6 miR156/SPLs参与植物再生调控 | 第40-41页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第41-42页 |
| 第二章 棉花体细胞胚胎发生相关miRNAs及靶标的鉴定与分析 | 第42-65页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第42-44页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第42页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第42-44页 |
| 2.2 实验结果与分析 | 第44-62页 |
| 2.2.1 小RNA的注释与序列特性分析 | 第44-46页 |
| 2.2.2 保守和新miRNAs的鉴定 | 第46-51页 |
| 2.2.3 miRNAs在棉花体细胞胚胎发生过程中的表达模式分析 | 第51-52页 |
| 2.2.4 miRNA靶标的鉴定 | 第52-55页 |
| 2.2.5 tas3-siRNAs及其靶标的鉴定 | 第55-57页 |
| 2.2.6 小RNA靶标的 5’ RACE验证 | 第57-60页 |
| 2.2.7 靶标的表达模式分析 | 第60-61页 |
| 2.2.8 靶标与对应miRNAs的表达模式负相关性分析 | 第61-62页 |
| 2.3 讨论 | 第62-65页 |
| 第三章 GhmiR157a/GhSPL10在棉花体细胞胚胎发生中的功能分析 | 第65-94页 |
| 3.1 实验材料和方法 | 第65-69页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第65页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第65-69页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第69-90页 |
| 3.2.1 靶标SPLs的进化树和保守结构域分析 | 第69-70页 |
| 3.2.2 Ghmi R157a和靶标GhSPL10在棉花体细胞胚胎发生过程中的表达模式分析 | 第70-72页 |
| 3.2.3 Ghmi R157a和GhSPL10超表达影响幼苗生长、愈伤增殖和胚性再分化..59 | 第72-76页 |
| 3.2.4 RNA seqencing分析GhSPL10超表达系中差异表达基因涉及的信号路径的变化 | 第76-81页 |
| 3.2.5 类黄酮的过量积累部分解释了GhSPL10超表达系中幼苗表型和愈伤增殖表型 | 第81-85页 |
| 3.2.6 乙烯信号的增强部分造成GhSPL10超表达系中类黄酮的过量积累 | 第85-90页 |
| 3.3 讨论 | 第90-94页 |
| 3.3.1 GhSPL10超表达导致多个非靶标SPLs的协同上调表达 | 第90页 |
| 3.3.2 类黄酮积累影响愈伤增殖，并且可能是导致GhSPL10超表达系胚性再分化提前的原因 | 第90-91页 |
| 3.3.3 乙烯信号路径对愈伤起始和增殖起到决定性的作用 | 第91页 |
| 3.3.4 GhSPL10超表达系中乙烯介导的类黄酮生物合成的增加是造成愈伤增殖变快的主要原因 | 第91-94页 |
| 参考文献 | 第94-120页 |
| 附录 | 第120-140页 |
| 附录1 已知miRNAs前体信息。 | 第120-121页 |
| 附录2 预测的已知miRNAs前体结构。 | 第121-122页 |
| 附录3 预测的新miRNAs前体结构。 | 第122-123页 |
| 附录4 通过降解组测序鉴定的CK中可能的miRNAs靶标。 | 第123-131页 |
| 附录5 通过降解组测序鉴定的EC中可能的miRNAs靶标。 | 第131-137页 |
| 附录6 本研究所用引物。 | 第137-139页 |
| 附录7 在读期间研究成果 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-142页 |
