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水稻稃片白化突变体Ds插入位点与标记基因的分子鉴定

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第11-29页
    1.1 水稻突变体库创建背景第11页
    1.2 突变体库的主要创建方法第11-14页
        1.2.1 自发突变第11-12页
        1.2.2 理化诱变第12页
        1.2.3 插入突变第12-14页
        1.2.4 基因沉默第14页
    1.3 AC/DS转座元件第14-18页
        1.3.1 Ac/Ds转座元件的结构特点第14-15页
        1.3.2 Ac/Ds转座机制第15-16页
        1.3.3 Ac/Ds元件的转座行为第16-17页
        1.3.4 Ac/Ds转座系统在水稻上的应用与改进第17-18页
    1.4 克隆插入位点侧翼序列的主要方法第18-20页
        1.4.1 反向PCR第18页
        1.4.2 连接-接头PCR第18页
        1.4.3 热不对称性交错PCR第18-20页
    1.5 应用于分离克隆水稻基因的主要方法第20-25页
        1.5.1 图位克隆法第20页
        1.5.2 显示差异表达的基因克隆方法第20页
        1.5.3 基于RACE技术的序列克隆法第20-25页
    1.6 水稻叶绿素缺陷突变体的研究进展第25-28页
        1.6.1 叶绿素缺陷突变体的突变机制第25-27页
        1.6.2 水稻稃片颜色突变体的研究进展第27-28页
    1.7 本研究的目的与意义第28-29页
第二章DS插入水稻稃片白化突变体侧翼序列的扩增及相关标记基因的生物信息学分析第29-48页
    2.1 材料第29页
    2.2 方法第29-36页
        2.2.1 突变体水稻的筛选第29-30页
        2.2.2 提取水稻基因组DNA第30-31页
        2.2.3 引物的设计第31-32页
        2.2.4 PCR检测Ac/Ds在水稻基因组上的插入第32页
        2.2.5 Ds插入位点侧翼序列的扩增第32-34页
        2.2.6 Ds插入位点侧翼序列的TA克隆及测序第34-36页
        2.2.7 Ds相关标记基因的初步生物信息学分析第36页
        2.2.8 Ds切离后残留足迹序列的获取及测定第36页
    2.3 结果与分析第36-44页
        2.3.1 稃片白化突变体水稻的表型特征第36-37页
        2.3.2 稃片白化突变体基因组上Ac/Ds的插入第37-38页
        2.3.3 稃片白化突变体上Ds插入位点旁侧序列的扩增第38-39页
        2.3.4 Ds在突变体上相关标记基因的初步生物信息学分析第39-43页
        2.3.5 稃片白化突变体的Ds切离足迹第43-44页
    2.4 讨论第44-48页
第三章 生物信息学初步分析DS插入后引起的水稻稃片白化突变体相关标记基因结构变化第48-62页
    3.1 材料第48页
    3.2 方法第48-53页
        3.2.1 水稻总RNA的提取第48-49页
        3.2.2 总RNA反转录成cDNA第49-50页
        3.2.3 总RNA反转录成的cDNA的质量检测第50页
        3.2.4 RACE引物的设计第50-51页
        3.2.5 RACE技术扩增水稻相关标记基因cDNA3′端第51-53页
        3.2.6 目标片段的TA克隆及序列测定第53页
        3.2.7 相关标记基因cDNA序列的初步生物信息学分析第53页
    3.3 结果与分析第53-59页
        3.3.1 总RNA反转录成的cDNA的质量检测第53-54页
        3.3.2 Ds标记基因cDNA末端序列的特异性第54-56页
        3.3.3 相关Ds标记基因的cDNA序列初步生物信息学分析第56-59页
    3.4 讨论第59-62页
第四章 小结与展望第62-64页
    4.1 全文小结第62-63页
    4.2 创新点第63页
    4.3 后续试验计划第63-64页
参考文献第64-75页
攻读学位期间本人公开发表或待发表的论著、论文第75-76页
附录第76-83页
致谢第83-84页

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