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胃癌易感性lncRNAs及其功能性SNPs的生物信息学筛选和验证

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
英文缩略词表第17-18页
1 前言第18-21页
2 材料方法第21-45页
    2.1 技术路线第21-22页
    2.2 生物信息学筛选拟研究的胃癌相关lncRNA及功能性SNPs第22-29页
        2.2.1 整合并构建长链非编码RNA数据库和蛋白编码数据库第22页
        2.2.2 高通量芯片数据重注释第22-23页
        2.2.3 利用生物信息学筛选胃癌相关差异表达的lncRNAs第23页
        2.2.4 对候选lncRNA及其SNPs进行功能预测第23-29页
    2.3 生物学实验第29-33页
        2.3.1 实验仪器第29-31页
        2.3.2 主要实验试剂第31-32页
        2.3.3 溶液的配制第32-33页
    2.4 研究方法第33-39页
        2.4.1 研究对象第33-34页
        2.4.2 资料收集第34页
        2.4.3 血样采集与全血基因组DNA提取第34-35页
        2.4.4 基因分型第35-39页
    2.5 生物学功能初探第39-42页
        2.5.1 细胞培养第39页
        2.5.2 荧光实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)第39-42页
        2.5.3 荧光素酶报告基因实验第42页
    2.6 质量控制第42-43页
    2.7 统计学分析第43-45页
3 结果第45-64页
    3.1 研究对象的一般情况第45-46页
    3.2 基因分型结果第46-51页
        3.2.1 各位点基因型的凝胶电泳图谱第46-48页
        3.2.2 各位点基因测序结果第48-51页
    3.3 对照组各位点基因型Hardy-Weinberg平衡的检验第51页
    3.4 候选lncRNA及其功能性SNPs和胃癌易感性的关系第51-54页
    3.5 基于显性遗传模型的SNPs与胃癌易感性分层分析第54-56页
    3.6 假阳性结果报告率分析第56-58页
    3.7 基因-环境因素交互作用第58-61页
    3.8 血浆中总RNA的提取第61页
    3.9 不同rs4784659基因型人群血浆中lnc-AMFR-1:1 的表达量第61-62页
    3.10 荧光素酶报告基因实验结果第62-64页
4 讨论第64-69页
    4.1 本研究概述第64页
    4.2 胃癌易感性相关lncRNAs及其SNPs与生物学功能探究第64-67页
    4.3 本研究的优点和局限性第67-69页
5 结论第69-70页
参考文献第70-73页
附录第73-78页
文献综述第78-93页
    参考文献第88-93页
个人简历及学术论文发表情况第93-94页
致谢第94页

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