| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-32页 |
| ·非酒精性脂肪性肝病研究进展 | 第10-18页 |
| ·非酒精性脂肪性肝病定义和诊断标准 | 第10-11页 |
| ·非酒精性脂肪性肝病的流行趋势 | 第11-12页 |
| ·非酒精性脂肪性肝病的致病机理研究 | 第12-18页 |
| ·肠道菌群和非酒精性脂肪性肝病 | 第18-25页 |
| ·肠道菌群的结构 | 第19-21页 |
| ·肠道菌群与宿主的共生关系 | 第21-24页 |
| ·肠道菌群参与非酒精性脂肪性肝病的研究进展 | 第24-25页 |
| ·论文中所用的检测技术介绍 | 第25-29页 |
| ·指纹图谱技术 | 第26页 |
| ·实时荧光定量PCR 技术 | 第26-27页 |
| ·bar-coded 454 焦磷酸测序技术 | 第27-29页 |
| ·论文中所用的多元统计分析方法介绍 | 第29-32页 |
| ·主成分分析（principal component analysis, PCA） | 第29页 |
| ·聚类分析 | 第29-30页 |
| ·偏最小二乘法（partial least square, PLS） | 第30-31页 |
| ·UniFrac 分析方法 | 第31-32页 |
| 第二章 中药祛湿化瘀方对非酒精性脂肪性肝病大鼠肠道菌群结构的影响 | 第32-69页 |
| 引言 | 第32-33页 |
| ·材料与方法 | 第33-43页 |
| ·动物实验和样本采集 | 第33-35页 |
| ·动物血清和组织样本中生理生化指标分析 | 第35-36页 |
| ·粪便样本总DNA 提取 | 第36-38页 |
| ·粪便菌群组成的变性梯度凝胶电泳（DGGE）分析 | 第38-40页 |
| ·粪便细菌165 rRNA 基因V3 区bar coded 454 测序 | 第40-43页 |
| ·实验结果 | 第43-58页 |
| ·中药治疗对NAFLD 的症状改善 | 第43-46页 |
| ·中药治疗对NAFLD 大鼠肠道菌群整体结构的影响 | 第46-52页 |
| ·鉴定与中药治疗相关的特定细菌类群 | 第52-56页 |
| ·肠道菌群结构和有关生理生化指标之间的PLS-Regression 分析 | 第56-58页 |
| ·讨论 | 第58-61页 |
| ·本章小结 | 第61-62页 |
| 附表 | 第62-69页 |
| 参考文献 | 第69-81页 |
| 附章 重度肥胖症患者膳食干预前后肠道内硫酸盐还原菌的定量检测 | 第81-94页 |
| 引言 | 第81-82页 |
| ·材料与方法 | 第82-84页 |
| ·重度肥胖症患者膳食干预过程以及粪便样本采集 | 第82页 |
| ·粪便样本总DNA 的提取 | 第82页 |
| ·粪便样本APS 还原酶基因的荧光实时定量PCR | 第82-83页 |
| ·粪便样本总菌165 rRNA 基因的荧光实时定量PCR | 第83页 |
| ·数据处理 | 第83-84页 |
| ·实验结果 | 第84-87页 |
| ·膳食干预前后患者体重和BMI 变化 | 第84页 |
| ·以APS 还原酶基因拷贝数定量膳食干预前后患者体内SRB 变化 | 第84-86页 |
| ·以APS 还原酶基因相对于165 rRNA 基因拷贝数来定量膳食干预前后患者体内SRB 变化 | 第86-87页 |
| ·讨论 | 第87-89页 |
| ·本章小结 | 第89页 |
| ·参考文献 | 第89-92页 |
| 附表 | 第92-94页 |
| 附录1 溶液试剂及培养基配方 | 第94-96页 |
| 附录2 仪器设备 | 第96-97页 |
| 附录3 缩写和全称 | 第97-99页 |
| 研究生阶段已（待）发表论文 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-104页 |
| 附件 | 第104页 |
